5nb2

Crystal structures of homooligomers of collagen type IV. alpha2NC1

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Collagen alpha-2(IV) chain

Homo sapiens

UniProt P08572

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 water × 4 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CO4A2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–228; UniProt 1485–1712 作者链 B; PDB构建体 1–228; UniProt 1485–1712

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5nb2
沉积日期 deposition_date2017-02-28
结构标题 titleCrystal structures of homooligomers of collagen type IV. alpha2NC1
关键词 keywordsNon-collagenous domain of collagen type IV. A principal structural component of basement membranes, structural protein; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5nb2__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5nb2__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5nb2__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)29.07 Å
Rg(电子密度)27.84 Å
总 Rg28.73 Å
原子数5168
残基数680
排除体积92230 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5nb2__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5nb2__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd5nb2a1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.169 — C-type lectin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.169.1 — C-type lectin-like
家族 Family familyd.169.1.6 — Noncollagenous (NC1) domain of collagen IV
结构域编号 domain_idd5nb2b1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.169 — C-type lectin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.169.1 — C-type lectin-like
家族 Family familyd.169.1.6 — Noncollagenous (NC1) domain of collagen IV

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id5nb2A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology240 — Noncollagenous (NC1) domain of collagen IV
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Collagen IV, non-collagenous
结构域编号 domain_id5nb2B00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology240 — Noncollagenous (NC1) domain of collagen IV
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Collagen IV, non-collagenous
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7. 引用文献 (1)