SAXSdb — 5nqx

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Factor H binding protein,Major outer membrane protein P.IA,Factor H binding protein

Neisseria meningitidis MC58

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
3	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
4	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
5	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	OMPA1_NEIMC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 223–235； UniProt 195–207 作者链 B； PDB构建体 223–235； UniProt 195–207 作者链 C； PDB构建体 223–235； UniProt 195–207 作者链 D； PDB构建体 223–235； UniProt 195–207 作者链 E； PDB构建体 223–235； UniProt 195–207

Factor H binding protein,Major outer membrane protein P.IA,Factor H binding protein

Neisseria meningitidis MC58

UniProt Q9JXV4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
3	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
4	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致
5	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9JXV4_NEIMB
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–222； UniProt 72–293 作者链 A； PDB构建体 236–261； UniProt 295–320 作者链 B； PDB构建体 1–222； UniProt 72–293 作者链 B； PDB构建体 236–261； UniProt 295–320 作者链 C； PDB构建体 1–222； UniProt 72–293 作者链 C； PDB构建体 236–261； UniProt 295–320 作者链 D； PDB构建体 1–222； UniProt 72–293 作者链 D； PDB构建体 236–261； UniProt 295–320 作者链 E； PDB构建体 1–222； UniProt 72–293 作者链 E； PDB构建体 236–261； UniProt 295–320

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5nqx
沉积日期 deposition_date	2017-04-21
结构标题 title	Structure of a fHbp(V1.1):PorA(P1.16) chimera. Fusion at fHbp position 294.
关键词 keywords	Meningitis, Vaccine, Complement, Chimeric, Immune system; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5nqx__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5nqx__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5nqx__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	19.88 Å
Rg（电子密度）	18.79 Å
总 Rg	19.79 Å
原子数	1881
残基数	247
排除体积	33244 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5nqx__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5nqx__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`5nqx__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`5nqx__assembly_4__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`5nqx__assembly_5__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	5nqxA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1980 —

结构域编号 domain_id	5nqxA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	5nqxB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1980 —

结构域编号 domain_id	5nqxB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	5nqxC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1980 —

结构域编号 domain_id	5nqxC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	5nqxD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1980 —

结构域编号 domain_id	5nqxD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	5nqxE01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1980 —

结构域编号 domain_id	5nqxE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

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晶胞边长 a length_a	94.850 Å
晶胞边长 b length_b	114.900 Å
晶胞边长 c length_c	160.340 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	20

空间群 space_group	P 2 21 21
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.660 Å
最低分辨率 resolution_low	81.636 Å
R 因子 r_factor	0.2348
R_work r_work	0.2324
R_free r_free	0.2815

描述 description	Factor H binding protein,Major outer membrane protein P.IA,Factor H binding protein
分子量 formula_weight	29184.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,A,B,D,E
原子数 atom_count	9572

Structure of a fHbp(V1.1):PorA(P1.16) chimera. Fusion at fHbp position 294.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Factor H binding protein,Major outer membrane protein P.IA,Factor H binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Factor H binding protein,Major outer membrane protein P.IA,Factor H binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5nqx__assembly_3__model_1

5nqx__assembly_3__model_1 | I(q)

5nqx__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Neisseria meningitidis MC58
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	122586
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

Structure of a fHbp(V1.1):PorA(P1.16) chimera. Fusion at fHbp position 294.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Factor H binding protein,Major outer membrane protein P.IA,Factor H binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Factor H binding protein,Major outer membrane protein P.IA,Factor H binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5nqx__assembly_3__model_1

5nqx__assembly_3__model_1 | I(q)

5nqx__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)