5nrg

The crystal structure of the large ribosomal subunit of Staphylococcus aureus in complex with RB02

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

50S ribosomal protein L2

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL2_STAA8
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–277； UniProt 1–277

50S ribosomal protein L3

物种未注明

UniProt Q2FW06

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL3_STAA8
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220

50S ribosomal protein L4

物种未注明

UniProt Q2FW07

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL4_STAA8
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–207； UniProt 1–207

50S ribosomal protein L5

物种未注明

UniProt Q2FW18

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL5_STAA8
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–179； UniProt 1–179

50S ribosomal protein L6

物种未注明

UniProt Q2FW21

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL6_STAA8
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178

50S ribosomal protein L13

物种未注明

UniProt Q2FW38

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL13_STAA8
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

50S ribosomal protein L14

物种未注明

UniProt Q2FW16

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL14_STAA8
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–122； UniProt 1–122

50S ribosomal protein L15

物种未注明

UniProt P0A0F8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL15_STAA8
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140

50S ribosomal protein L16

物种未注明

UniProt Q2FW13

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL16_STAA8
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144

50S ribosomal protein L17

物种未注明

UniProt Q2FW33

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL17_STAA8
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–122； UniProt 1–122

50S ribosomal protein L18

物种未注明

UniProt Q2FW22

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL18_STAA8
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–119； UniProt 1–119

50S ribosomal protein L19

物种未注明

UniProt Q2FZ42

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL19_STAA8
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–116； UniProt 1–116

50S ribosomal protein L20

物种未注明

UniProt A7X3A1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL20_STAA1
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

50S ribosomal protein L21

物种未注明

UniProt Q2FXS8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL21_STAA8
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–102； UniProt 1–102

50S ribosomal protein L22

物种未注明

UniProt Q2FW11

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL22_STAA8
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

50S ribosomal protein L23

物种未注明

UniProt Q2FW08

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL23_STAA8
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–91； UniProt 1–91

50S ribosomal protein L24

物种未注明

UniProt Q2FW17

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL24_STAA8
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–105； UniProt 1–105

50S ribosomal protein L25

物种未注明

UniProt Q2G0S0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q2G0S0_STAA8
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217

50S ribosomal protein L27

物种未注明

UniProt Q2FXT0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL27_STAA8
Isoform	—
PDB实体	21
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94

50S ribosomal protein L29

物种未注明

UniProt Q2FW14

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL29_STAA8
Isoform	—
PDB实体	22
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69

50S ribosomal protein L30

物种未注明

UniProt P0A0G2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL30_STAA8
Isoform	—
PDB实体	23
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–59； UniProt 1–59

50S ribosomal protein L32

物种未注明

UniProt Q2FZF1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL32_STAA8
Isoform	—
PDB实体	24
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58

50S ribosomal protein L34

物种未注明

UniProt Q2FUQ0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L35 × 1 （A7X3A2） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RL34_STAA8
Isoform	—
PDB实体	25
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–45； UniProt 1–45

50S ribosomal protein L35

物种未注明

UniProt A7X3A2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 24 RNA 2	23S ribosomal RNA × 1 5S ribosomal RNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 （P60430） 50S ribosomal protein L3 × 1 （Q2FW06） 50S ribosomal protein L4 × 1 （Q2FW07） 50S ribosomal protein L5 × 1 （Q2FW18） 50S ribosomal protein L6 × 1 （Q2FW21） 50S ribosomal protein L13 × 1 （Q2FW38） 50S ribosomal protein L14 × 1 （Q2FW16） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P0A0F8） 50S ribosomal protein L16 × 1 （Q2FW13） 50S ribosomal protein L17 × 1 （Q2FW33） 50S ribosomal protein L18 × 1 （Q2FW22） 50S ribosomal protein L19 × 1 （Q2FZ42） 50S ribosomal protein L20 × 1 （A7X3A1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （Q2FXS8） 50S ribosomal protein L22 × 1 （Q2FW11） 50S ribosomal protein L23 × 1 （Q2FW08） 50S ribosomal protein L24 × 1 （Q2FW17） 50S ribosomal protein L25 × 1 （Q2G0S0） 50S ribosomal protein L27 × 1 （Q2FXT0） 50S ribosomal protein L29 × 1 （Q2FW14） 50S ribosomal protein L30 × 1 （P0A0G2） 50S ribosomal protein L32 × 1 （Q2FZF1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （Q2FUQ0） ;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ; × 1 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 MANGANESE (II) ION × 210 MAGNESIUM ION × 84 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 SPERMIDINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RL35_STAA1
Isoform	—
PDB实体	26
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5nrg
沉积日期 deposition_date	2017-04-23
结构标题 title	The crystal structure of the large ribosomal subunit of Staphylococcus aureus in complex with RB02
关键词 keywords	ribosome, RNA, antibiotics, lincosamides; RIBOSOME
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5nrg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5nrg__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5nrg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	66.93 Å
Rg（电子密度）	67.51 Å
总 Rg	67.36 Å
原子数	80778
残基数	5696
排除体积	1213500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5nrg__assembly_1__model_1`	26-meric （26）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (32)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	23S ribosomal RNA
分子量 formula_weight	946687.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	X
原子数 atom_count	80800

GAUUAAGUUAUUAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGAAGCCAAUGAAGGACGUUACUAACGACGAUAUGCUUUGGGGAGCUGUAAGUAAGCUUUGAUCCAGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGCAUGAGUUAUGUCAUGUUAUCGAUAUGUGAAUACAUAGCAUAUCAGAAGGCACACCCGGAGAACUGAAACAUCUUAGUACCCGGAGGAAGAGAAAGAAAAUUCGAUUCCCUUAGUAGCGGCGAGCGAAACGGGAAGAGCCCAAACCAACAAGCUUGCUUGUUGGGGUUGUAGGACACUCUAUACGGAGUUACAAAGGACGACAUUAGACGAAUCAUCUGGAAAGAUGAAUCAAAGAAGGUAAUAAUCCUGUAGUCGAAAAUGUUGUCUCUCUUGAGUGGAUCCUGAGUACGACGGAGCACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCUGGGAGGACCAUCUCCUAAGGCUAAAUACUCUCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCGUGUGCUUACAAGUAGUCAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGAUUUGAUGCAAGGUUAAGCAGUAAAUGUGGAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUUAGUAUUUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCUUGGUCAGGUUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUGGAGGACCGAACCGACUUACGUUGAAAAGUGAGCGGAUGAACUGAGGGUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGUGAUGAUUAUUGGAGGUAGAGCACUGUUUGGACGAGGGGCCCCUCUCGGGUUACCGAAUUCAGACAAACUCCGAAUGCCAAUUAAUUUAACUUGGGAGUCAGAACAUGGGUGAUAAGGUCCGUGUUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGCUAAGGUCCCAAAAUAUAUGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGCGUUGCCCAGACAACUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUGACACUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACAUAUUACCGAAGCUGUGGAUUGUCCUUUGGACAAUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCGUUGAAGCAUGAUCGUAAGGACAUGUGGAGCGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUGUGAGUAGCGAAAGACGGGUGAGAAUCCCGUCCACCGAUUGACUAAGGUUUCCAGAGGAAGGCUCGUCCGCUCUGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCUGAGGCCGACAGGCGUAGGCGAUGGAUAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUAUAAUCGUUUUAAUCGAUGGGGGGACGCAGUAGGAUAGGCGAAGCGUGCGAUUGGAUUGCACGUCUAAGCAGUAAGGCUGAGUAUUAGGCAAAUCCGGUACUCGUUAAGGCUGAGCUGUGAUGGGGAGAAGACAUUGAGUCUUCGAGUCGUUGAUUUCACACUGCCGAGAAAAGCCUCUAGAUAGAAAAUAGGUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGUCAAGAUGAGAAUUCUAAGGUGAGCGAGCGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUUUAGGGUUAACGCCCAGAAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGGUCUCUGCUAAACCGUAAGGUGAUGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGGUUAGCUUCUGCGAAGCUACGAAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUUUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUCAUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGUAGCCUGAUAUUGAAAUUCGGCACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUUGAAACGUGAGCGCUAGCUUACGUGGAGGCGCUGGUGGGAUACUACCCUAGCUGUGUUGGCUUUCUAACCCGCACCACUUAUCGUGGUGGGAGACAGUGUCAAGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCUCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCAUAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGUCGAAAGACGGACUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGUGGGCGUAGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCGUGCCAACGGCAUAGCUGGGUAGCUAUGUGUGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAACUUCGGUUAUAAGAUCCCUCAAAGAUGAUGAGGUUAAUAGGUUCGAGGUGGAAGCAUGGUGACAUGUGGAGCUGACGAAUACUAAUCGAUCGAAGACUUAAUCAA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	5S ribosomal RNA
分子量 formula_weight	36692.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	Y

UCUGGUGACUAUAGCAAGGAGGUCACACCUGUUCCCAUGCCGAACACAGAAGUUAAGGUCUUUAGCGACGAUGGUAGCCAACUUACGUUCCGCUAGAGUAGAACGUUGCCAGGC

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L2
分子量 formula_weight	30217.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MAIKKYKPITNGRRNMTSLDFAEITKTTPEKSLLKPLPKKAGRNNQGKLTVRHHGGGHKRQYRVIDFKRNKDGINAKVDSIQYDPNRSANIALVVYADGEKRYIIAPKGLEVGQIVESGAEADIKVGNALPLQNIPVGTVVHNIELKPGKGGQIARSAGASAQVLGKEGKYVLIRLRSGEVRMILSTCRATIGQVGNLQHELVNVGKAGRSRWKGIRPTVRGSVMNPNDHPHGGGEGRAPIGRPSPMSPWGKPTLGKKTRRGKKSSDKLIVRGRKKK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L3
分子量 formula_weight	23760.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MTKGILGRKIGMTQVFGENGELIPVTVVEAKENVVLQKKTVEVDGYNAIQVGFEDKKAYKKDAKSNKYANKPAEGHAKKADAAPKRFIREFRNVDVDAYEVGQEVSVDTFVAGDVIDVTGVSKGKGFQGAIKRHGQSRGPMSHGSHFHRAPGSVGMASDASRVFKGQKMPGRMGGNTVTVQNLEVVQVDTENKVILVKGNVPGPKKGLVEIRTSIKKGNK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L4
分子量 formula_weight	22495.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MANYDVLKLDGTKSGSIELSDAVFGIEPNNSVLFEAINLQRASLRQGTHAVKNRSAVSGGGRKPWKQKGTGRARQGTIRAPQWRGGGIVFGPTPRSYAYKMPKKMRRLALRSALSFKAQENGLTVVDAFNFEAPKTKEFKNVLSTLEQPKKVLVVTENEDVNVELSARNIPGVQVTTAQGLNVLDITNADSLVITEAAAKKVEEVLG

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L5
分子量 formula_weight	20296.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MNRLKEKFNTEVTENLMKKFNYSSVMEVPKIDKIVVNMGVGDAVQNSKVLDNAVEELELITGQKPLVTKAKKSIATFRLREGMPIGAKVTLRGERMYEFLDKLISVSLPRVRDFQGVSKKAFDGRGNYTLGVKEQLIFPEIDYDKVSKVRGMDIVIVTTANTDEEARELLANFGMPFRK

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L6
分子量 formula_weight	19818.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MSRVGKKIIDIPSDVTVTFDGNHVTVKGPKGELSRTLNERMTFKQEENTIEVVRPSDSKEDRTNHGTTRALLNNMVQGVSQGYVKVLELVGVGYRAQMQGKDLILNVGYSHPVEIKAEENITFSVEKNTVVKVEGISKEQVGALASNIRSVRPPEPYKGKGIRYQGEYVRRKEGKTGK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L13
分子量 formula_weight	16359.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L14
分子量 formula_weight	13157.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MIQQETRLKVADNSGAREVLTIKVLGGSGRKTANIGDVIVCTVKNATPGGVVKKGDVVKAVIVRTKSGVRRNDGSYIKFDENACVIIRDDKGPRGTRIFGPVARELREGNFMKIVSLAPEVL

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L15
分子量 formula_weight	15021.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MKLHELKPAEGSRKERNRVGRGVATGNGKTSGRGHKGQKARSGGGVRPGFEGGQLPLFRRLPKRGFTNINRKEYAIVNLDQLNKFEDGTEVTPALLVESGVVKNEKSGIKILGNGSLDKKLTVKAHKFSASAAEAIDAKG

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L16
分子量 formula_weight	16274.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MLLPKRVKYRRQHRPKTTGRSKGGNYVTFGEFGLQATTTSWITSRQIESARIAMTRYMKRGGKVWIKIFPHTPYTKKPLEVRMGAGKGAVEGWIAVVKPGRILFEVAGVSEEVAREALRLASHKLPVKTKFVKREELGGETNES

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L17
分子量 formula_weight	13771.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L18
分子量 formula_weight	13124.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MISKIDKNKVRLKRHARVRTNLSGTAEKPRLNVYRSNKHIYAQIIDDNKGVTLAQASSKDSDIATTATKVELATKVGEAIAKKAADKGIKEIVFDRGGYLYHGRVKALAEAARESGLEF

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L19
分子量 formula_weight	13392.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L20
分子量 formula_weight	13720.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MPRVKGGTVTRARRKKTIKLAKGYFGSKHTLYKVAKQQVMKSGQYAFRDRRQRKRDFRKLWITRINAAARQHEMSYSRLMNGLKKAGIDINRKMLSEIAISDEKAFAQLVTKAKDALK

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L21
分子量 formula_weight	11354.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MFAIIETGGKQIKVEEGQEIFVEKLDVNEGDTFTFDKVLFVGGDSVKVGAPTVEGATVTATVNKQGRGKKITVFTYKRRKNSKRKKGHRQPYTKLTIDKINA

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L22
分子量 formula_weight	12857.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MEAKAVARTIRIAPRKVRLVLDLIRGKNAAEAIAILKLTNKASSPVIEKVLMSALANAEHNYDMNTDELVVKEAYANEGPTLKRFRPRAQGRASAINKRTSHITIVVSDGKEEAKEA

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L23
分子量 formula_weight	10625.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MEARDILKRPVITEKSSEAMAEDKYTFDVDTRVNKTQVKMAVEEIFNVKVASVNIMNYKPKKKRMGRYQGYTNKRRKAIVTLKEGSIDLFN

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L24
分子量 formula_weight	11561.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MHIKKGDNVKVIAGKDKGKEGKVIATLPKKDRVVVEGVNIMKKHQKPTQLNPEGGILETEAAIHVSNVQLLDPKTNEPTRVGYKFVDGKKVRIAKKSGEEIKSNN

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L25
分子量 formula_weight	23810.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MASLKSIIRQGKQTRSDLKQLRKSGKVPAVVYGYGTKNVSVKVDEVEFIKVIREVGRNGVIELGVGSKTIKVMVADYQFDPLKNQITHIDFLAINMSEERTVEVPVQLVGEAVGAKEGGVVEQPLFNLEVTATPDNIPEAIEVDITELNINDSLTVADVKVTGDFKIENDSAESVVTVVAPTEEPTEEEIEAMEGEQQTEEPEVVGESKEDEEKTEE

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L27
分子量 formula_weight	10334.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MLKLNLQFFASKKGVSSTKNGRDSESKRLGAKRADGQFVTGGSILYRQRGTKIYPGENVGRGGDDTLFAKIDGVVKFERKGRDKKQVSVYAVAE

实体 22 Entity 22 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L29
分子量 formula_weight	8105.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MKAKEIRDLTTSEIEEQIKSSKEELFNLRFQLATGQLEETARIRTVRKTIARLKTVAREREIEQSKANQ

实体 23 Entity 23 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L30
分子量 formula_weight	6565.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MAKLQITLTRSVIGRPETQRKTVEALGLKKTNSSVVVEDNPAIRGQINKVKHLVTVEEK

实体 24 Entity 24 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L32
分子量 formula_weight	6657.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MAVPKRRTSKTRKNKRRTHFKISVPGMTECPNCGREYKLSHRVCKNCGSYNGEEVAAK

实体 25 Entity 25 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L34
分子量 formula_weight	5454.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

MVKRTYQPNKRKHSKVHGFRKRMSTKNGRKVLARRRRKGRKVLSA

实体 26 Entity 26 polymer

描述 description	50S ribosomal protein L35
分子量 formula_weight	7722.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

MPKMKTHRGAAKRVKRTASGQLKRSRAFTSHLFANKSTKQKRQLRKARLVSKSDMKRVKQLLAYKK

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	;~{N}-[(1~{R},2~{R})-1-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-methylsulfanyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]-2-oxidanyl-propy l]-4-nitro-benzamide ;
分子量 formula_weight	402.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	(4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL
分子量 formula_weight	118.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	210

实体 30 Entity 30 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	84

实体 31 Entity 31 non-polymer

描述 description	4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 32 Entity 32 non-polymer

描述 description	SPERMIDINE
分子量 formula_weight	145.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	5nrg200
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3980 —

结构域编号 domain_id	5nrgA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	5nrgA03
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	950 — Ribosomal protein L2; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein L2, domain 3

结构域编号 domain_id	5nrgH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	150 — Ribosomal Protein L14
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribosomal protein L14/L23

结构域编号 domain_id	5nrgJ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1170 — Aldehyde Oxidoreductase; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein L16/L10

结构域编号 domain_id	5nrgK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1030 — 50s Ribosomal Protein L17; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein L17

结构域编号 domain_id	5nrgL01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	5nrgP00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	470 — Ribosomal Protein L22; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein L22/L17

结构域编号 domain_id	5nrgQ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — RRM (RNA recognition motif) domain

结构域编号 domain_id	5nrgS01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	240 — Ribosomal Protein L25; Chain P
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal Protein L25; Chain P

结构域编号 domain_id	5nrgS02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribosomal protein L25, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	5nrgW00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1390 — Ribosomal Protein L30; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Ribosomal protein L30/L7

▶

晶胞边长 a length_a	279.797 Å
晶胞边长 b length_b	279.797 Å
晶胞边长 c length_c	873.274 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 65 2 2
空间群编号 int_tables_number	179
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.442 Å
最低分辨率 resolution_low	49.369 Å
R 因子 r_factor	0.2210
R_work r_work	0.2189
R_free r_free	0.2613

The crystal structure of the large ribosomal subunit of Staphylococcus aureus in complex with RB02

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

50S ribosomal protein L2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

50S ribosomal protein L3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

50S ribosomal protein L4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

50S ribosomal protein L5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

50S ribosomal protein L6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

50S ribosomal protein L13

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

50S ribosomal protein L14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

50S ribosomal protein L15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

50S ribosomal protein L16

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

50S ribosomal protein L17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体