Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | 6-dipropylamino-1-hexanol × 2 SULFATE ION × 10 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | DNM3B_HUMAN |
| Isoform | Q9UBC3-6 |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–150； UniProt 218–367 作者链 D； PDB构建体 1–150； UniProt 218–367 |
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| 条目编号 entry_id | 5nrv |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-04-25 |
| 结构标题 title | Human DNMT3B PWWP domain in complex with 6-dipropylamino-1-hexanol |
| 关键词 keywords | DNMT3B PWWP DOMAIN, HISTONE BINDING, BETA BARREL, LIGAND, transferase; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 21.58 Å |
| Rg（电子密度） | 20.87 Å |
| 总 Rg | 21.71 Å |
| 原子数 | 2165 |
| 残基数 | 260 |
| 排除体积 | 38709 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5nrva_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.34 — SH3-like barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.34.9 — Tudor/PWWP/MBT |
| 家族 Family family | b.34.9.2 — PWWP domain |
| 结构域编号 domain_id | d5nrvd_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.34 — SH3-like barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.34.9 — Tudor/PWWP/MBT |
| 家族 Family family | b.34.9.2 — PWWP domain |
| 结构域编号 domain_id | 5nrvA01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — |
| 结构域编号 domain_id | 5nrvA02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 720 — Transcription Termination Factor Rho, Rna-binding Domain; Chain A, Domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 50 — PWWP, helical domain |
| 结构域编号 domain_id | 5nrvD01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 140 — |
| 结构域编号 domain_id | 5nrvD02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 720 — Transcription Termination Factor Rho, Rna-binding Domain; Chain A, Domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 50 — PWWP, helical domain |