Drosophila melanogaster
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | Maternal effect protein oskar × 2 （P25158） water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | VASA1_DROME |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 3–163； UniProt 463–623 作者链 D； PDB构建体 3–163； UniProt 463–623 |
Drosophila melanogaster
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | ATP-dependent RNA helicase vasa, isoform A × 2 （P09052） water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | OSKA_DROME |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 6–107； UniProt 139–240 作者链 C； PDB构建体 6–107； UniProt 139–240 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 5nt7 |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-04-27 |
| 结构标题 title | Structure of the LOTUS domain of Oskar in complex with the C-terminal RecA-like domain of Vasa |
| 关键词 keywords | ;DEAD-box RNA helicase, ATPase, RNA binding, regulator, stimulator, germ plasm, nuage, LOTUS, hydrolase- hydrolase regulator complex, hydrolase-hydrolase regulator complex ;; hydrolase/hydrolase regulator |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 31.40 Å |
| Rg（电子密度） | 31.66 Å |
| 总 Rg | 31.97 Å |
| 原子数 | 3837 |
| 残基数 | 490 |
| 排除体积 | 68405 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5nt7b_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases |
| 家族 Family family | c.37.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5nt7d_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases |
| 家族 Family family | c.37.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 5nt7A00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Nucleotidyltransferase; domain 5 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 610 — LOTUS domain-like |
| 结构域编号 domain_id | 5nt7B00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |
| 结构域编号 domain_id | 5nt7C00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 420 — Nucleotidyltransferase; domain 5 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 610 — LOTUS domain-like |
| 结构域编号 domain_id | 5nt7D00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |