5okz

Crystal Strucrure of the Mpp6 Exosome complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Exosome complex component CSL4

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSL4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 4–295； UniProt 1–292 作者链 S； PDB构建体 4–295； UniProt 1–292 作者链 c； PDB构建体 4–295； UniProt 1–292 作者链 m； PDB构建体 4–295； UniProt 1–292

Exosome complex component RRP45

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q05636

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RRP45_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305 作者链 K； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305 作者链 U； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305 作者链 e； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305

Exosome complex component SKI6

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P46948

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RRP41_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 4–249； UniProt 1–246 作者链 L； PDB构建体 4–249； UniProt 1–246 作者链 V； PDB构建体 4–249； UniProt 1–246 作者链 f； PDB构建体 4–249； UniProt 1–246

Exosome complex component RRP43

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P25359

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RRP43_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–394； UniProt 1–394 作者链 M； PDB构建体 1–394； UniProt 1–394 作者链 W； PDB构建体 1–394； UniProt 1–394 作者链 g； PDB构建体 1–394； UniProt 1–394

Exosome complex component RRP46

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P53256

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RRP46_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 4–226； UniProt 1–223 作者链 N； PDB构建体 4–226； UniProt 1–223 作者链 X； PDB构建体 4–226； UniProt 1–223 作者链 h； PDB构建体 4–226； UniProt 1–223

Exosome complex component RRP42

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q12277

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RRP42_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 4–268； UniProt 1–265 作者链 O； PDB构建体 4–268； UniProt 1–265 作者链 Y； PDB构建体 4–268； UniProt 1–265 作者链 i； PDB构建体 4–268； UniProt 1–265

Exosome complex component MTR3

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P48240

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MTR3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 P； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 Z； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 j； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250

Exosome complex component RRP40

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q08285

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RRP40_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 5–244； UniProt 1–240 作者链 Q； PDB构建体 5–244； UniProt 1–240 作者链 a； PDB构建体 5–244； UniProt 1–240 作者链 k； PDB构建体 5–244； UniProt 1–240

Exosome complex component RRP4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38792

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） M-phase phosphoprotein 6 homolog × 1 （P53725） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RRP4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 7–316； UniProt 50–359 作者链 R； PDB构建体 7–316； UniProt 50–359 作者链 b； PDB构建体 7–316； UniProt 50–359 作者链 l； PDB构建体 7–316； UniProt 50–359

M-phase phosphoprotein 6 homolog

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P53725

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 7	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 water × 7	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 water × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Exosome complex component CSL4 × 1 （P53859） Exosome complex component RRP45 × 1 （Q05636） Exosome complex component SKI6 × 1 （P46948） Exosome complex component RRP43 × 1 （P25359） Exosome complex component RRP46 × 1 （P53256） Exosome complex component RRP42 × 1 （Q12277） Exosome complex component MTR3 × 1 （P48240） Exosome complex component RRP40 × 1 （Q08285） Exosome complex component RRP4 × 1 （P38792） TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 7	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MPP6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 5–190； UniProt 1–186 作者链 T； PDB构建体 5–190； UniProt 1–186 作者链 d； PDB构建体 5–190； UniProt 1–186 作者链 n； PDB构建体 5–190； UniProt 1–186

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5okz
沉积日期 deposition_date	2017-07-26
结构标题 title	Crystal Strucrure of the Mpp6 Exosome complex
关键词 keywords	RNA degradation Exosome Ribosome biogenesis KH-domain, RNA BINDING PROTEIN; RNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5okz__assembly_4__model_1

Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5okz__assembly_4__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5okz__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	39.88 Å
Rg（电子密度）	38.98 Å
总 Rg	39.44 Å
原子数	16962
残基数	2242
排除体积	302620 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5okz__assembly_1__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5okz__assembly_2__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`5okz__assembly_3__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`5okz__assembly_4__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Exosome complex component CSL4
分子量 formula_weight	31911.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m,I,S,c
原子数 atom_count	67168

GPHMACNFQFPEIAYPGKLICPQYGTENKDGEDIIFNYVPGPGTKLIQYEHNGRTLEAITATLVGTVRCEEEKKTDQEEEREGTDQSTEEEKSVDASPNDVTRRTVKNILVSVLPGTEKGRKTNKYANNDFANNLPKEGDIVLTRVTRLSLQRANVEILAVEDKPSPIDSGIGSNGSGIVAAGGGSGAATFSVSQASSDLGETFRGIIRSQDVRSTDRDRVKVIECFKPGDIVRAQVLSLGDGTNYYLTTARNDLGVVFARAANGAGGLMYATDWQMMTSPVTGATEKRKCAKPF

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP45
分子量 formula_weight	34001.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,K,U,e

MAKDIEISASESKFILEALRQNYRLDGRSFDQFRDVEITFGKEFGDVSVKMGNTKVHCRISCQIAQPYEDRPFEGLFVISTEISPMAGSQFENGNITGEDEVLCSRIIEKSVRRSGALDVEGLCIVAGSKCWAVRADVHFLDCDGGFIDASCIAVMAGLMHFKKPDITVHGEQIIVHPVNEREPVPLGILHIPICVTFSFFNPQDTEENIKGETNSEISIIDATLKEELLRDGVLTVTLNKNREVVQVSKAGGLPMDALTLMKCCHEAYSIIEKITDQILQLLKEDSEKRNKYAAMLTSENAREI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Exosome complex component SKI6
分子量 formula_weight	27892.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,L,V,f

GPHMSRLEIYSPEGLRLDGRRWNELRRFESSINTHPHAADGSSYMEQGNNKIITLVKGPKEPRLKSQMDTSKALLNVSVNITKFSKFERSKSSHKNERRVLEIQTSLVRMFEKNVMLNIYPRTVIDIEIHVLEQDGGIMGSLINGITLALIDAGISMFDYISGISVGLYDTTPLLDTNSLEENAMSTVTLGVVGKSEKLSLLLVEDKIPLDRLENVLAIGIAGAHRVRDLMDEELRKHAQKRVSNASAR

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP43
分子量 formula_weight	44093.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,M,W,g

MAESTTLETIEIHPITFPPEVLARISPELSLQRHLSLGIRPCLRKYEEFRDVAIENNTLSRYADAGNIDTKNNILGSNVLKSGKTIVITSITGGIIEETSAAIKDLDDFGEEELFEVTKEEDIIANYASVYPVVEVERGRVGACTDEEMTISQKLHDSILHSRILPKKALKVKAGVRSANEDGTFSVLYPDELEDDTLNETNLKMKRKWSYVLYAKIVVLSRTGPVFDLCWNSLMYALQSVKLPRAFIDERASDLRMTIRTRGRSATIRETYEIICDQTKSVPLMINAKNIAFASNYGIVELDPECQLQNSDNSEEEEVDIDMDKLNTVLIADLDTEAEETSIHSTISILAAPSGNYKQLTLMGGGAKITPEMIKRSLLLSRVRADDLSTRFNI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP46
分子量 formula_weight	24659.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,N,X,h

AASMSVQAEIGILDHVDGSSEFVSQDTKVICSVTGPIEPKARQELPTQLALEIIVRPAKGVATTREKVLEDKLRAVLTPLITRHCYPRQLCQITCQILESGEDEAEFSLRELSCCINAAFLALVDAGIALNSMCASIPIAIIKDTSDIIVDPTAEQLKISLSVHTLALEFVNGGKVVKNVLLLDSNGDFNEDQLFSLLELGEQKCQELVTNIRRIIQDNISPRLVV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP42
分子量 formula_weight	29391.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,O,Y,i

GPHMSLSVAEKSYLYDSLASTPSIRPDGRLPHQFRPIEIFTDFLPSSNGSSRIIASDGSECIVSIKSKVVDHHVENELLQVDVDIAGQRDDALVVETITSLLNKVLKSGSGVDSSKLQLTKKYSFKIFVDVLVISSHSHPISLISFAIYSALNSTYLPKLISAFDDLEVEELPTFHDYDMVKLDINPPLVFILAVVGNNMLLDPAANESEVANNGLIISWSNGKITSPIRSVALNDSNVKSFKPHLLKQGLAMVEKYAPDVVRSLENL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Exosome complex component MTR3
分子量 formula_weight	27573.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,P,Z,j

MNVQDRRRLLGPAAAKPMAFSNTTTHVPEKKSTDLTPKGNESEQELSLHTGFIENCNGSALVEARSLGHQTSLITAVYGPRSIRGSFTSQGTISIQLKNGLLEKYNTNELKEVSSFLMGIFNSVVNLSRYPKSGIDIFVYLTYDKDLTNNPQDDDSQSKMTSSQISSLIPHCITSITLALADAGIELVDMAGAGEANGTVVSFIKNGEEIVGFWKDDGDDEDLLECLDRCKEQYNRYRDLMISCLMNQET

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP40
分子量 formula_weight	26939.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,Q,a,k

GPDSMSTFIFPGDSFPVDPTTPVKLGPGIYCDPNTQEIRPVNTGVLHVSAKGKSGVQTAYIDYSSKRYIPSVNDFVIGVIIGTFSDSYKVSLQNFSSSVSLSYMAFPNASKKNRPTLQVGDLVYARVCTAEKELEAEIECFDSTTGRDAGFGILEDGMIIDVNLNFARQLLFNNDFPLLKVLAAHTKFEVAIGLNGKIWVKCEELSNTLACYRTIMECCQKNDTAAFKDIAKRQFKEILTVKEE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Exosome complex component RRP4
分子量 formula_weight	34603.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,R,b,l

TGGRSMSDSQIVTPGELVTDDPIWMRGHGTYFLDNMTYSSVAGTVSRVNRLLSVIPLKGRYAPETGDHVVGRIAEVGNKRWKVDIGGKQHAVLMLGSVNLPGGILRRKSESDELQMRSFLKEGDLLNAEVQSLFQDGSASLHTRSLKYGKLRNGMFCQVPSSLIVRAKNHTHNLPGNITVVLGVNGYIWLRKTSQMDLARDTPSANNSSSIKSTGPTGAVSLNPSITRLEEESSWQIYSDENDPSISNNIRQAICRYANVIKALAFCEIGITQQRIVSAYEASMVYSNVGELIEKNVMESIGSDILTAEKMRGNGN

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	M-phase phosphoprotein 6 homolog
分子量 formula_weight	21541.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,T,d,n

GPDSMSANNGVTGKLSSRVMNMKFMKFGKTDDEESSNSNTPSNINSDVEPIEQKGKLFGLDDSAWDLNSYKDDLKKISGKEKKKVKRVVYKKRPNLIISNVGYSELRKPEGVISGRKTFGDNSDDSGSRKRKFDEGEQNEDEKRDAKDKEFTGSQDDGEDEYDLDKLFKDSIKKKKTNHNGKNKNRNSKK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE
分子量 formula_weight	163.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 14 Entity 14 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	140

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 40 domains

CATH v4.4 (40 domains)

结构域编号 domain_id	5okzA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzG01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	5okzG02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	5okzG03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — K Homology domain, type 1

结构域编号 domain_id	5okzH01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	5okzK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzM00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzN00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzO00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzP00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzQ01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	5okzQ02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	5okzQ03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — K Homology domain, type 1

结构域编号 domain_id	5okzR01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	5okzU00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzV00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzW00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzX00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzY00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzZ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okza01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	5okza02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	5okza03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — K Homology domain, type 1

结构域编号 domain_id	5okzb01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	5okze00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzf00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzg00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzh00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzi00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzj00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — GHMP Kinase, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5okzk01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	5okzk02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	5okzk03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — K Homology domain, type 1

结构域编号 domain_id	5okzl01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

▶

晶胞边长 a length_a	161.779 Å
晶胞边长 b length_b	237.430 Å
晶胞边长 c length_c	201.895 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	110.37 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	monoclinic

分辨率 resolution	3.200 Å
最低分辨率 resolution_low	80.760 Å
R 因子 r_factor	0.2245
R_work r_work	0.2225
R_free r_free	0.2615

Crystal Strucrure of the Mpp6 Exosome complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Exosome complex component CSL4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exosome complex component RRP45

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exosome complex component SKI6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exosome complex component RRP43

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exosome complex component RRP46

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exosome complex component RRP42

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exosome complex component MTR3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exosome complex component RRP40

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Exosome complex component RRP4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

M-phase phosphoprotein 6 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体