5ola

Structure of mitochondrial transcription elongation complex in complex with elongation factor TEFM

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription elongation factor, mitochondrial

Homo sapiens

UniProt Q96QE5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 3 DNA 2 RNA 1 DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial × 1 (O00411) ;DNA (5'-D(P*AP*TP*GP*GP*TP*GP*TP*AP*AP*CP*GP*CP*CP*AP*GP*AP*CP*GP*AP*AP*C)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(P*GP*CP*GP*GP*CP*GP*CP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (30-MER) × 1 与全部聚合物一致
2 其他组合 异源复合物 蛋白 3 DNA 2 RNA 1 DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial × 1 (O00411) ;DNA (5'-D(P*AP*TP*GP*GP*TP*GP*TP*AP*AP*CP*GP*CP*CP*AP*GP*AP*CP*GP*AP*AP*C)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(P*GP*CP*GP*GP*CP*GP*CP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (30-MER) × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TEFM_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–226; UniProt 136–360 作者链 B; PDB构建体 2–226; UniProt 136–360 作者链 C; PDB构建体 2–226; UniProt 136–360 作者链 D; PDB构建体 2–226; UniProt 136–360

DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial

Homo sapiens

UniProt O00411

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 3 DNA 2 RNA 1 Transcription elongation factor, mitochondrial × 2 (Q96QE5) ;DNA (5'-D(P*AP*TP*GP*GP*TP*GP*TP*AP*AP*CP*GP*CP*CP*AP*GP*AP*CP*GP*AP*AP*C)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(P*GP*CP*GP*GP*CP*GP*CP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (30-MER) × 1 与全部聚合物一致
2 其他组合 异源复合物 蛋白 3 DNA 2 RNA 1 Transcription elongation factor, mitochondrial × 2 (Q96QE5) ;DNA (5'-D(P*AP*TP*GP*GP*TP*GP*TP*AP*AP*CP*GP*CP*CP*AP*GP*AP*CP*GP*AP*AP*C)-3') ; × 1 ;RNA (5'-R(P*GP*CP*GP*GP*CP*GP*CP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (30-MER) × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPOM_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 9–1088; UniProt 151–1230 作者链 F; PDB构建体 9–1088; UniProt 151–1230

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5ola
沉积日期 deposition_date2017-07-27
结构标题 titleStructure of mitochondrial transcription elongation complex in complex with elongation factor TEFM
关键词 keywordsElongation Factor, Mitochondria, Resolvase, RNA Polymerase, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5ola__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5ola__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5ola__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)38.16 Å
Rg(电子密度)37.98 Å
总 Rg38.37 Å
原子数12561
残基数1468
排除体积220850 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5ola__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5ola__assembly_2__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 引用文献 (1)