SAXSdb — 5oma

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3 protein sigma,Steroidogenic acute regulatory protein, mitochondrial

Homo sapiens

UniProt P31947

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	Undetermined peptide × 1 PHOSPHATE ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SULFATE ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	1433S_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–234； UniProt 1–231 作者链 B； PDB构建体 4–234； UniProt 1–231 作者链 C； PDB构建体 4–234； UniProt 1–231 作者链 D； PDB构建体 4–234； UniProt 1–231

14-3-3 protein sigma,Steroidogenic acute regulatory protein, mitochondrial

Homo sapiens

UniProt P49675

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	Undetermined peptide × 1 PHOSPHATE ION × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SULFATE ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	STAR_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 240–248； UniProt 54–62 作者链 B； PDB构建体 240–248； UniProt 54–62 作者链 C； PDB构建体 240–248； UniProt 54–62 作者链 D； PDB构建体 240–248； UniProt 54–62

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5oma
沉积日期 deposition_date	2017-07-28
结构标题 title	CH3 chimera of human 14-3-3 sigma with the StARD1 peptide including Ser57
关键词 keywords	14-3-3 proteins, Protein chimera, phosphopeptide-binding, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5oma__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5oma__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5oma__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	28.76 Å
Rg（电子密度）	27.80 Å
总 Rg	28.58 Å
原子数	3635
残基数	462
排除体积	64272 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5oma__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5oma__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	14-3-3 protein sigma,Steroidogenic acute regulatory protein, mitochondrial
分子量 formula_weight	27835.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	7285

GPHMERASLIQKAKLAEQAERYEDMAAFMKGAVEKGEELSCEERNLLSVAYKNVVGGQRAAWRVLSSIEQKSNEEGSAAAGPEVREYREKVETELQGVCDTVLGLLDSHLIKEAGDAESRVFYLKMKGDYYRYLAEVATGDDKKRIIDSARSAYQEAMDISKKEMPPTNPIRLGLALNFSVFHYEIANSPEEAISLAKTTFDEAMADLHTLSEDSYKDSTLIMQLLRDNLTLWTGSGSLRRSSLLGSR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Undetermined peptide
分子量 formula_weight	358.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

XXXX

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL
分子量 formula_weight	122.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	5omaA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — 14-3-3 domain

结构域编号 domain_id	5omaB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — 14-3-3 domain

结构域编号 domain_id	5omaC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — 14-3-3 domain

结构域编号 domain_id	5omaD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	190 — Delta-Endotoxin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — 14-3-3 domain

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晶胞边长 a length_a	123.251 Å
晶胞边长 b length_b	123.251 Å
晶胞边长 c length_c	162.447 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.900 Å
最低分辨率 resolution_low	47.000 Å
R 因子 r_factor	0.2120
R_work r_work	0.2090
R_free r_free	0.2480

CH3 chimera of human 14-3-3 sigma with the StARD1 peptide including Ser57

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3 protein sigma,Steroidogenic acute regulatory protein, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

14-3-3 protein sigma,Steroidogenic acute regulatory protein, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5oma__assembly_1__model_1

5oma__assembly_1__model_1 | I(q)

5oma__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

CH3 chimera of human 14-3-3 sigma with the StARD1 peptide including Ser57

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3 protein sigma,Steroidogenic acute regulatory protein, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

14-3-3 protein sigma,Steroidogenic acute regulatory protein, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5oma__assembly_1__model_1

5oma__assembly_1__model_1 | I(q)

5oma__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)