Rattus norvegicus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | MAGNESIUM ION × 1 CHLORIDE ION × 2 SULFATE ION × 1 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 2 (4S,5S)-1,2-DITHIANE-4,5-DIOL × 1 5-(4-fluorophenyl)-2,3-dihydroxy-N-[3-(pyrrolo[3,2-c]pyridin-1-ylmethoxy)propyl]benzamide × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | COMT_RAT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–221； UniProt 44–264 |
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| 条目编号 entry_id | 5p8y |
| 沉积日期 deposition_date | 2016-08-29 |
| 结构标题 title | humanized rat catechol O-methyltransferase in complex with 5-(4-fluorophenyl)-2,3-dihydroxy-N-[3-(pyrrolo[3,2-c]pyridin-1-ylmethoxy)propyl]benzamide at 1.42A |
| 关键词 keywords | METHYLTRANSFERASE, NEUROTRANSMITTER DEGRADATION, TRANSFERASE, TRANSFERASE-TRANSFERASE inhibitor complex; TRANSFERASE/TRANSFERASE inhibitor |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.51 Å |
| Rg（电子密度） | 16.35 Å |
| 总 Rg | 17.36 Å |
| 原子数 | 1739 |
| 残基数 | 213 |
| 排除体积 | 31243 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5p8ya_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.66 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.66.1 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases |
| 家族 Family family | c.66.1.1 — COMT-like |
| 结构域编号 domain_id | 5p8yA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 150 — Vaccinia Virus protein VP39 |