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5sx9

Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 14

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 117.8 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform

Homo sapiens

UniProt P42336

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–1068 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha × 1 （P27986） 71L 4,6-dimethylpyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate 分辨率 3.52 Å R-free 0.277

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5SX9 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2ENQ Solution structure of the C2 domain from human PI3-kinase p110 subunit alpha 提交 2007-03-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 331–481（151 aa） 片段：C2 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成 0.77mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl(pH7.0), 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O; 90% H2O | 10% D2O; 90% H2O
分辨率未提供
2RD0 Structure of a human p110alpha/p85alpha complex 提交 2007-09-20 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；Sodium Formate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.323
3HHM Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha and the drug wortmannin 提交 2009-05-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R KWT (1S,6BR,9AS,11R,11BR)-9A,11B-DIMETHYL-1-[(METHYLOXY)METHYL]-3,6,9-TRIOXO-1,6,6B,7,8,9,9A,10,11,11B-DECAHYDRO-3H-FURO[4, 3,2-DE]INDENO[4,5-H][2]BENZOPYRAN-11-YL ACETATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.307
3HIZ Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2009-05-20 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.333
3ZIM Discovery of a potent and isoform-selective targeted covalent inhibitor of the lipid kinase PI3Kalpha 提交 2013-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1046（940 aa） 片段：N-TERMINAL TRUNCATED, RESIDUES 107-1046
未记录 KKR 1-[4-[[2-(1H-indazol-4-yl)-4-morpholin-4-yl-thieno[3,2-d]pyrimidin-6-yl]methyl]piperazin-1-yl]-6-methyl-hept-5-ene-1,4- dione × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.85 Å R-free 0.278
4JPS Co-crystal Structures of the Lipid Kinase PI3K alpha with Pan and Isoform Selective Inhibitors 提交 2013-03-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K SCN THIOCYANATE ION × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6uL protein to 4uL well with streak seeding at 18C , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 303K
分辨率 2.20 Å R-free 0.228
4L1B Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha 提交 2013-06-03 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.59 Å R-free 0.274
4L23 Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and PI-103 提交 2013-06-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
4L2Y Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and compound 9d 提交 2013-06-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 XXK 3-amino-5-[4-(morpholin-4-yl)pyrido[3',2':4,5]furo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.271
4OVU Crystal Structure of p110alpha in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2014-01-14 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate
分辨率 2.96 Å R-free 0.272
4OVV Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with diC4-PIP2 提交 2014-01-14 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.339
4TUU Isolated p110a subunit of PI3Ka provides a platform for structure-based drug design 提交 2014-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa） 片段：UNP residues 105-1048
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；PEG 6K, 0.6 M Na Formate, 0.1M CHES, pH 9.0-10 and 5 mM TCEP, pH 7.0 at a temperature of 20 degC.
分辨率 2.64 Å R-free 0.245
4TV3 Isolated p110a subunit of PI3Ka provides a platform for structure-based drug design 提交 2014-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa） 片段：UNP residues 105-1048
未记录 ML9 2-amino-8-[trans-4-(2-hydroxyethoxy)cyclohexyl]-6-(6-methoxypyridin-3-yl)-4-methylpyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；PEG 6K, 0.6 M Na Formate, 0.1M CHES, pH 9.0-10 and 5 mM TCEP, pH 7.0 at a temperature of 20 degC.
分辨率 2.85 Å R-free 0.250
4WAF Crystal Structure of a novel tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazine in an engineered PI3K alpha 提交 2014-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1068（1067 aa）
突变：M232K, L233K, I800M, F930V 3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12% PEG 3350, 120mM potassium thiocyanate
分辨率 2.39 Å R-free 0.247
4YKN Pi3K alpha lipid kinase with Active Site Inhibitor 提交 2015-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–1068（1067 aa） 片段：UNP P27986 residues 318-615, LINKER (GSPGISGGGGG), P42336 residues 2-1068
未记录 4EL 3-(6-methoxypyridin-3-yl)-5-[({4-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfamoyl]phenyl}amino)methyl]benzoic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；ethylenene glycol, PIP2
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
4ZOP Co-crystal Structure of Lipid Kinase PI3K alpha with a selective phosphatidylinositol-3 kinase alpha inhibitor 提交 2015-05-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K 4Q2 (2S,3R)-N~1~-(8-tert-butyl-4,5-dihydro[1,3]thiazolo[4,5-h]quinazolin-2-yl)-3-methylpyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6UL PROTEIN TO 4UL WELL WITH STREAK SEEDING AT 18C , PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.62 Å R-free 0.258
5DXH p110alpha/p85alpha with compound 5 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1068（1067 aa）
未记录 5H2 methyl {2-[4-(2-chlorophenyl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]-4,5-dihydrothieno[3,2-d][1]benzoxepin-8-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.218
5DXH p110alpha/p85alpha with compound 5 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–1068（1067 aa）
未记录 5H2 methyl {2-[4-(2-chlorophenyl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]-4,5-dihydrothieno[3,2-d][1]benzoxepin-8-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.218
5DXT p110alpha with GDC-0326 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa） 片段：PI3-KINASE P110 ALPHA, UNP residues 107-1068
未记录 5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 20000
分辨率 2.25 Å R-free 0.262
5FI4 Discovery of imidazo[1,2-a]-pyridine inhibitors of pan-PI3 kinases that are efficacious in a mouse xenograft model 提交 2015-12-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K L233K GOL GLYCEROL × 1 5XV ~{N}-[6-[5-azanyl-6-[(2~{S})-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]oxy-pyrazin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12.5% PEG 3350, 125 mM KSCN Drops were 5uL protein: 3uL well solutions and streak seeded.
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5ITD Crystal structure of PI3K alpha with PI3K delta inhibitor 提交 2016-03-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K 6CY 5-{4-[3-(4-acetylpiperazine-1-carbonyl)phenyl]quinazolin-6-yl}-2-methoxypyridine-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 uL of protein was mixed with 5 uL of well solution containing 12% PEG 3350 and 120 mM potassium thiocyanate
分辨率 3.02 Å R-free 0.241
5SW8 Crystal structure of PI3Kalpha in complex with fragments 7 and 11 提交 2016-08-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 70S 2H-indazol-5-amine × 1 FB1 2-CHLOROBENZENESULFONAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
5SWG Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 5 and 21 提交 2016-08-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） AX7 1H-benzimidazol-2-amine × 1 CAQ CATECHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.11 Å R-free 0.262
5SWO Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 4 and 19 提交 2016-08-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 1 70T 2-methyl-5-nitro-1H-indole × 1 2ZV 4-methyl-3-nitropyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.274
5SWP Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 6 and 24 提交 2016-08-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 70W tert-butyl 4-aminopiperidine-1-carboxylate × 2 70V 2-methylcyclohexane-1,3-dione × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.41 Å R-free 0.296
5SWR Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 20 and 26 提交 2016-08-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 718 6-hydroxy-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SAL 2-HYDROXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.31 Å R-free 0.273
5SWT Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 17 and 27 提交 2016-08-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71A pyridin-3-ol × 1 71B 3-fluoro-4-methoxyaniline × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
5SX8 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 12 and 15 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71M 6-methylpyridin-2-amine × 2 LUZ pteridine-2,4(1H,3H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.47 Å R-free 0.276
5SXA Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 10 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71N 2-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-5-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.35 Å R-free 0.275
5SXB Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 23 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SOA ISATOIC ANHYDRIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.30 Å R-free 0.278
5SXC Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 8 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） URF 5-FLUOROURACIL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.55 Å R-free 0.268
5SXD Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 22 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71F 2-methoxybenzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.276
5SXE Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 19 and 28 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71G 3-aminobenzonitrile × 1 ES3 4-bromo-1H-imidazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.51 Å R-free 0.271
5SXF Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 9 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） HPP HYDROXYPHENYL PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.46 Å R-free 0.267
5SXI Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 13 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71J trans-cyclohexane-1,4-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.40 Å R-free 0.279
5SXJ Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 29 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） BHO BENZHYDROXAMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.42 Å R-free 0.279
5SXK Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 18 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 71K 2-methylbenzene-1,3-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.55 Å R-free 0.278
5UBR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K ALPHA IN COMPLEX WITH A 7-(3-(PIPERAZIN-1-YL)PHENYL)PYRROLO[2,1-F][1,2,4] TRIAZIN-4-AMINE DERIVIATINE 提交 2016-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1050（944 aa）
未记录 85S 1-[4-(3-{4-amino-5-[1-(oxan-4-yl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；NULL
分辨率 2.40 Å R-free 0.246
5UK8 The co-structure of (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-20 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K,L233K, I800M, F930V, R770E, W780K, E798I, V850W 8DV (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 303.15K
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
5UKJ The co-structure of N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3- b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5- a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa） 片段：UNP residues
突变：M232K L233K I800M F930V W780K V850W R770E E798I 3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,
分辨率 2.80 Å R-free 0.252
5UL1 The co-structure of 3-amino-6-(4-((1-(dimethylamino)propan-2-yl)sulfonyl)phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K L233K I800M F930V W780K V850W R770E E798I 8DY 3-amino-6-(4-{[(2S)-1-(dimethylamino)propan-2-yl]sulfonyl}phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.00 Å R-free 0.260
5XGH Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 8–1055（1048 aa） 片段：UNP residues 8-1055
未记录 84U 3-[(4-fluorophenyl)methylamino]-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.280
5XGI Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 8–1059（1052 aa） 片段：UNP residues 8-1059
未记录 84R 3-azanyl-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.56 Å R-free 0.290
5XGJ Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 8–1055（1048 aa） 片段：UNP residues 8-1055
未记录 84X 3-(4-morpholin-4-ylfuro[3,2-d]pyrimidin-2-yl)-5-[(phenylmethyl)amino]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.279
6GVF Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-1-isopropyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-ylamine 提交 2018-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1051（945 aa）
未记录 FE5 5-(4-azanyl-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)-1,3-benzoxazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；NULL
分辨率 2.50 Å R-free 0.244
6GVG Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-1-isopropyl-4-methyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-ylamine 提交 2018-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa）
未记录 FCZ 5-(6-azanyl-4-methyl-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)-1,3-benzoxazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；none
分辨率 3.00 Å R-free 0.229
6GVH Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-4-chloro-1-isopropyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-ylamine 提交 2018-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa）
未记录 FDH 5-(6-azanyl-4-chloranyl-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)-1,3-benzoxazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；none
分辨率 2.74 Å R-free 0.246
6GVI Crystal structure of PI3K alpha in complex with 3-(2-Amino-benzooxazol-5-yl)-1-isopropyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidine-4,6-diamine 提交 2018-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1068（962 aa）
未记录 FDW 3-(2-azanyl-1,3-benzoxazol-5-yl)-1-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidine-4,6-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；none
分辨率 2.90 Å R-free 0.232
6NCT Structure of p110alpha/niSH2 - vector data collection 提交 2018-12-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes, 1.4-1.6 M sodium formate
分辨率 3.35 Å R-free 0.271
6OAC PQR530 [(S)-4-(Difluoromethyl)-5-(4-(3-methylmorpholino)-6-morpholino-1,3,5-triazin-2-yl)pyridin-2-amine] bound to the PI3Ka catalytic subunit p110alpha 提交 2019-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 M1J 4-(difluoromethyl)-5-{4-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazin-2-yl}pyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；290 K；8% PEG6000, 0.6M Na Formate, 0.1M CHES pH 9.5, 5mM TCEP
分辨率 3.15 Å R-free 0.287
6PYS Human PI3Kalpha in complex with Compound 2-10 ((3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one) 提交 2019-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1051（945 aa） 片段：UNP residues 107-1051
未记录 P5J (3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；not available
分辨率 2.19 Å R-free 0.259
6VO7 Crystal structure of PI3K-alpha Ras Binding Domain (RBD) 提交 2020-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCL, 0.7 M Na Citrate, pH 8.5
分辨率 2.31 Å R-free 0.255
7JIU HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 2F 提交 2020-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–1052（946 aa） 片段：TRUNCATED PI3-KINASE ALPHA, residues 107-1052
未记录 VBS (3S)-3-benzyl-5-[9-ethyl-8-(2-methylpyrimidin-5-yl)-9H-purin-6-yl]-3-methyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；NOT AVAILABLE
分辨率 2.12 Å R-free 0.246
7K6M Crystal structure of PI3Kalpha selective Inhibitor PF-06843195 提交 2020-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VXY 2,2-difluoroethyl (3S)-3-{[2'-amino-5-fluoro-2-(morpholin-4-yl)[4,5'-bipyrimidin]-6-yl]amino}-3-(hydroxymethyl)pyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7, 50 mM Tris pH 8.0, 100 mM NaCl, 2% Ethylene Glycol
分辨率 2.41 Å R-free 0.232
7K6N Crystal structure of PI3Kalpha selective Inhibitor 11-1575 提交 2020-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VY4 tert-butyl (3S)-3-[4-(2-aminopyrimidin-5-yl)-2-(morpholin-4-yl)-5,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-3-methylpyrrolidine-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.77 Å R-free 0.235
7K6O Crystal structure of PI3Kalpha inhibitor 10-5429 提交 2020-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VY1 (3S)-3-[4-(2-aminopyrimidin-5-yl)-2-(morpholin-4-yl)-5,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-N-methylpyrrolidine-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.74 Å R-free 0.262
7K71 Crystal structure of PI3Kalpha inhibitor 4-0686 提交 2020-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 VYP 2-(morpholin-4-yl)[4,5'-bipyrimidin]-2'-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M sodium formate, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.90 Å R-free 0.259
7L1B Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a wild-type PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；10.00 % w/v Polyethylene glycol 8,000, 200 mM Calcium acetate, 100 mM HEPES; pH 7.5
分辨率 2.04 Å R-free 0.221
7L1C Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 5 FMT FORMIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277.15 K；20% w/v Polyethylene glycol 3,350, 200 mM Ammonium formate, pH 6.6
分辨率 1.96 Å R-free 0.205
7L1D Crystal structure of human 21LT2-2 TCR bound to HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2020-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；10% w/v Polyethylene glycol 8,000, 200mM Magnesium acetate
分辨率 3.11 Å R-free 0.250
7MLK Crystal structure of human PI3Ka (p110a subunit) with MMV085400 bound to the active site determined at 2.9 angstroms resolution 提交 2021-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa） 片段：UNP residues 105-1048
未记录 ZHY 4-[6-(3,4,5-trimethoxyanilino)pyrazin-2-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；286 K；8% (w/v) PEG 6000, 0.1 M CHES pH 9.75, 0.64 M Sodium Formate and AMP, 5 mM TCEP pH 7
分辨率 2.91 Å R-free 0.242
7MYN Cryo-EM Structure of p110alpha in complex with p85alpha 提交 2021-05-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7MYO Cryo-EM structure of p110alpha in complex with p85alpha inhibited by BYL-719 提交 2021-05-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
7PG5 Crystal Structure of PI3Kalpha 提交 2021-08-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% PEG 5K MME (w/v), 160 nM KSCN, 100 mM sodium cacodylate pH 6.5.
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
7PG6 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with the inhibitor NVP-BYL719 提交 2021-08-13 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG 5000, 160 mM KSCN and 100 mM sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
7R9V Structure of PIK3CA with covalent inhibitor 19 提交 2021-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 2Q7 N-[2-(4-{4-[2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl]-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazin-2-yl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]-1-(prop-2-enoyl)piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG6000 8%, 0.6 M sodium formate, 0.1 M CHES pH 9.4, 5 mM TCEP
分辨率 2.69 Å R-free 0.292
7R9Y Structure of PIK3CA with covalent inhibitor 22 提交 2021-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 2IX N-[2-(4-{4-[2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl]-6-(morpholin-4-yl)-1,3,5-triazin-2-yl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]-N-methyl-1-(prop-2-enoyl)piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG6000 8%, 0.6 M sodium formate, 0.1 M CHES pH 9.4, 5 mM TCEP
分辨率 2.85 Å R-free 0.287
7RRG Crystal structure of human 0606T1-2 TCR bound to HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2021-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H1047L GOL GLYCEROL × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；12% w/v Polyethylene glycol 3,350, 100 mM Succinic acid
分辨率 2.12 Å R-free 0.221
7TZ7 PI3K alpha in complex with an inhibitor 提交 2022-02-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K KVJ (4S,5R)-3-[2'-amino-2-(morpholin-4-yl)-4'-(trifluoromethyl)[4,5'-bipyrimidin]-6-yl]-4-(hydroxymethyl)-5-methyl-1,3-oxazolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；0.15M Potassium Thiocyanate, 20% PEG 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.277
8AM0 Crystal structure of human T1061E PI3Kalpha in complex with its regulatory subunit and the inhibitor GDC-0077 (Inavolisib) 提交 2022-08-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：T1061E MWF (2R)-2-[[2-[(4S)-4-[bis(fluoranyl)methyl]-2-oxidanylidene-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl]amino]propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.10 M Bis-Tris-Propane pH 8.10, 0.20 M Na 3 -citrate, 10.00 %(w/v) PEG 3350
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.10 M Bis-Tris-Propane pH 8.10, 0.20 M Na 3 -citrate, 10.00 %(w/v) PEG 3350
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.1；293 K；0.10 M Bis-Tris-Propane pH 8.10, 0.20 M Na 3 -citrate, 10.00 %(w/v) PEG 3350
分辨率 2.82 Å R-free 0.300
8BFU Crystal structure of the apo p110alpha catalytic subunit from homo sapiens 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% (w/v) PEG 4K, 20% (v/v) 1,2,6-hexanetriol, 90 mM LiNaK, 0.1 M MOPSO/bis-tris pH 6.5
分辨率 2.41 Å R-free 0.279
8DCP PI 3-kinase alpha with nanobody 3-126 提交 2022-06-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.41 Å
8DCX PI 3-kinase alpha with nanobody 3-159 提交 2022-06-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8DD4 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142 提交 2022-06-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8DD8 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142, crosslinked with DSG 提交 2022-06-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8EXL Crystal structure of PI3K-alpha in complex with taselisib 提交 2022-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 799 2-methyl-2-(4-{2-[3-methyl-1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-1H-pyrazol-1-yl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 1.99 Å R-free 0.225
8EXO Crystal structure of PI3K-alpha in complex with compound 19 提交 2022-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 X3W 1-{(4S,11aM)-2-[(4R)-2-oxo-4-(propan-2-yl)-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 2.46 Å R-free 0.242
8EXU Crystal structure of PI3K-alpha in complex with compound 30 提交 2022-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 X3R (2S)-2-cyclopropyl-2-({(4S,11aM)-2-[(4S)-2-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}amino)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 2.68 Å R-free 0.241
8EXV Crystal structure of PI3K-alpha in complex with compound 32 提交 2022-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 7–1052（1046 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；291 K；0.1M MES buffer pH 6.2, 16% PEG 20,000, 0.1M KCl
分辨率 2.48 Å R-free 0.258
8GUA Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant E542K in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8GUB Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant H1047R in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8GUD Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant E545K in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.62 Å
8ILR Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 16 提交 2023-03-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 7TZ N-[(2S)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8ILS Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 17 提交 2023-03-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 7U5 N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8ILV Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 18 提交 2023-03-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 L2V N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[3-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
8OW2 Crystal structure of the p110alpha catalytic subunit from homo sapiens in complex with activator 1938 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 QIH 1-[7-[[2-[[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyridin-4-yl]amino]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% (w/v) PEG 4K, 20% (v/v) 1,2,6-hexanetriol, 50 mM Polyamines, 0.1 M MOPSO/bis-tris pH 6.5
分辨率 2.57 Å R-free 0.271
8SBC Co-structure of Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform and brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：M232K, L233K, W780K, I800M, V850W, F930V ZTV (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(pyridin-2-yl)-1H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN PROTEIN SOLUTION : 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML FORMATION METHOD : SOAKING PROTOCOL : SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, REMARK 280 XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS METHOD : VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP TEMPERATURE : 303.0 CRYO PROTOCOL : 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION
分辨率 2.30 Å R-free 0.271
8SBJ Co-structure Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform complexed with brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 ZUO (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(1H-pyrazol-3-yl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN; PROTEIN SOLUTION: 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML, FORMATION METHOD : SOAKING, PROTOCOL: SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS; CRYO PROTOCOL: 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TS7 Human PI3K p85alpha/p110alpha 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.71 Å R-free 0.288
8TS8 p85alpha/p110alpha heterodimer H1047R mutant 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
突变：H1047R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.72 Å R-free 0.265
8TS9 Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 1 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1050（1049 aa）
突变：H1047R UE9 5-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.252
8TSA Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 2 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1050（1049 aa）
突变：H1047R UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.51 Å R-free 0.276
8TSB Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to compound 2 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
未记录 UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.256
8TSC Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 3 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1050（1049 aa）
突变：H1047R UJC (1S)-7-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-1-(2-methylphenyl)-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 3.62 Å R-free 0.255
8TSD Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to RLY-2608 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1053（1052 aa）
未记录 XUZ N-{(3R,6M)-3-(2-chloro-5-fluorophenyl)-6-[(4S)-5-cyano[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridin-6-yl]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.277
8TU6 CryoEM structure of PI3Kalpha 提交 2023-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–1068（1067 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8TWY Structure of p110 alpha bound to (S)-1-(4-((2-(4-(4-(2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl)-6-(3-methylmorpholino)-1,3,5- triazin-2-yl)piperazin-1-yl)-2-oxoethoxy)methyl)piperidin-1-yl)prop-2-en-1-one (compound 9) 提交 2023-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–1048（944 aa）
未记录 RNX 1-(4-{[2-(4-{(4P)-4-[2-amino-4-(difluoromethyl)pyrimidin-5-yl]-6-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-1,3,5-triazin-2-yl}piperazin-1-yl)-2-oxoethoxy]methyl}piperidin-1-yl)prop-2-en-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG6000 10-15%, 0.6 M sodium formate, 0.1 M CHES pH 9.5-10.5, 5 mM TCEP
分辨率 2.67 Å R-free 0.261
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.
分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.
分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
未记录 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2
分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2
分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8VCL Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2023-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L FMT FORMIC ACID × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；12% w/v Polyethylene glycol 3,350, 4% v/v TacsimateTM, pH 6.0
分辨率 2.40 Å R-free 0.230
8W9A CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-7909 binding at an allosteric site 提交 2023-09-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 UEX 6-chloranyl-3-[[(1R)-1-[2-(1,3-dihydropyrrolo[3,4-c]pyridin-2-yl)-3,6-dimethyl-4-oxidanylidene-quinazolin-8-yl]ethyl]amino]pyridine-2-carboxylic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8W9B CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-8557 binding at an allosteric site 提交 2023-09-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 UJ3 1-[(1S)-1-(5-fluoranyl-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2-methyl-propyl]-3-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-5-yl)urea × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9ASF Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a wild-type PIK3CA peptide analogue (Trp-6 Bta) 提交 2024-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa） 片段：residues 1046-1054 (Uniprot numbering)
突变：W6Bta 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；15% w/v Polyethylene glycol 6,000, 50 mM Potassium chloride; 10 mM Magnesium chloride
分辨率 1.77 Å R-free 0.237
9ASG Crystal structure of HLA-A*03:01 in complex with a mutant PIK3CA peptide analogue (Trp-6 Bta) 提交 2024-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa） 片段：residues 1046-1054 (Uniprot numbering)
突变：H2L, W6Bta 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；15% w/v Polyethylene glycol 3,350, 150mM Cesium chloride
分辨率 2.03 Å R-free 0.238
9B4S Crystal structure of the RRAS2-p110alpha complex 提交 2024-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A, I1058A, F1059A 5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M (Bicine/Tris), 0.06 M Divalent mix, 30% (40%v/v PEG MME 500, 20%w/v PEG 20000)
分辨率 3.10 Å R-free 0.272
9B4T Crystal structure of the MRAS-p110alpha complex 提交 2024-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A, I1058A, F1059A 5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M (Tris/Bicine) 1.2%w/v cholic acid mix, 50%v/v (40%v/v ethylene glycol, 20%w/v PEG 8000)
分辨率 2.75 Å R-free 0.262
9B4U Crystal structure of p110alpha-RBD covalently bound to a breaker compound BBO-10203 via Cys242 提交 2024-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
链 B 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 A1AIR 1-[(4R,8R)-2-[(4M,7P)-7-[2,4-difluoro-6-(2-methoxyethoxy)phenyl]-4-(1-methyl-1H-indazol-5-yl)thieno[3,2-c]pyridin-6-yl]-4-methyl-6,7-dihydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-5(4H)-yl]propan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；277 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 24 % PEG 6000
分辨率 2.21 Å R-free 0.269
9C15 Crystal structure of the KRAS-p110alpha complex with molecular glue D927 提交 2024-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A, I1058A, F1059A A1ATF 2-[3-fluoro-4-({(7P)-7-[2-(2-methoxyethoxy)phenyl]thieno[2,3-d]pyridazin-4-yl}amino)phenyl]acetamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 0.1 M NaCl, 15% PEG 20K
分辨率 2.81 Å R-free 0.234
9CMK Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D927 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 160–300（141 aa）
未记录 A1ATF 2-[3-fluoro-4-({(7P)-7-[2-(2-methoxyethoxy)phenyl]thieno[2,3-d]pyridazin-4-yl}amino)phenyl]acetamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；0.1 M (MES/Imidazole), 0.06 M Divalent mix, 40 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 1.75 Å R-free 0.221
9CMK Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D927 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 160–300（141 aa）
未记录 A1ATF 2-[3-fluoro-4-({(7P)-7-[2-(2-methoxyethoxy)phenyl]thieno[2,3-d]pyridazin-4-yl}amino)phenyl]acetamide × 1 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；277 K；0.1 M (MES/Imidazole), 0.06 M Divalent mix, 40 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 1.75 Å R-free 0.221
9CML Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D223 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 160–300（141 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M (TRIS/Bicine), 0.1 M amino acid mix, 50 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 2.01 Å R-free 0.278
9CML Crystal structure of p110alpha-RAS binding domain (RBD) in complex with molecular glue D223 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 160–300（141 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M (TRIS/Bicine), 0.1 M amino acid mix, 50 %v/v (MPD, PEG 1000, PEG 3350)
分辨率 2.01 Å R-free 0.278
9CMV Crystal structure of the KRAS-p110alpha complex in the presence of molecular glue D223 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–1068（964 aa）
突变：W1057A/I1058A/F1059A A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris, 0.1 M NaCl, 10 % PEG 20K
分辨率 3.01 Å R-free 0.268
9CWY Crystal structure of HLA-A*03:02 in complex with a wild-type PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 FMT FORMIC ACID × 7 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277.15 K；12% w/v polyethylene glycol 3,350, 4% v/v Tacsimate (Hampton Research)
分辨率 1.98 Å R-free 0.224
9CWZ Crystal structure of HLA-A*03:02 in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；277.15 K；20% w/v polyethylene glycol 3,350, 200 mM lithium nitrate
分辨率 2.05 Å R-free 0.238
9CX0 Crystal structure of HLA-A*03:01 E152V mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；12% w/v polyethylene glycol 3,350, 100 mM sodium malonate
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
9CX1 Crystal structure of HLA-A*03:01 L156Q mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.15 K；20% w/v polyethylene glycol 3,350, 200 mM sodium malonate
分辨率 2.00 Å R-free 0.221
9CX2 Crystal structure of HLA-A*03:01 L156Q mutant in complex with a mutant PIK3CA peptide 提交 2024-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1046–1054（9 aa）
突变：H2L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；10% w/v polyethylene glycol 20,000, 100 mM MES
分辨率 2.30 Å R-free 0.219
9E8M Covalent inhibitor VVD-442 bound to the RAS binding domain (RBD) of PI3Ka 提交 2024-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 A1BF9 1-[(1P)-5-bromo-2'-chloro[1,1'-biphenyl]-2-sulfonyl]-4-fluoro-N-[(2S)-4-(methanesulfonyl)butan-2-yl]piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；4.8 M ammonium acetate, 0.1 M MES pH 5.5
分辨率 2.83 Å R-free 0.268
9E8M Covalent inhibitor VVD-442 bound to the RAS binding domain (RBD) of PI3Ka 提交 2024-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 157–300（144 aa） 片段：Ras Binding Domain (RBD)
未记录 A1BF9 1-[(1P)-5-bromo-2'-chloro[1,1'-biphenyl]-2-sulfonyl]-4-fluoro-N-[(2S)-4-(methanesulfonyl)butan-2-yl]piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；4.8 M ammonium acetate, 0.1 M MES pH 5.5
分辨率 2.83 Å R-free 0.268
9LWQ Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 QIH 1-[7-[[2-[[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyridin-4-yl]amino]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9LWR Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
突变：H1047R 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9LWS Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
9NI3 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 1 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9NI4 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex dimer on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1068（1068 aa）
链 B 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
9NI5 Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs 提交 2025-02-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9NI6 Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
9NI7 Cryo-EM structure of the Class 3 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9NI8 Cryo-EM structure of the Class 2 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9NID Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex dimer on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1068（1068 aa）
链 B 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NIE Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas/HER3 phosphopeptide complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NIF Cryo-EM structure of the PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS/PIP2 nanodiscs low-pass filtered to 5 angstroms 提交 2025-02-26 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 1 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9NLC Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs low-pass filtered to 10 angstroms 提交 2025-03-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1068（1068 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å

共 134 个其他 PDB 条目、145 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PK3CA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 29–1096； UniProt 1–1068

Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha

Homo sapiens

UniProt P27986

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 322–600 片段：residues 322-600 Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform × 1 （P42336） 71L 4,6-dimethylpyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate 分辨率 3.52 Å R-free 0.277

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5SX9 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A0N NMR STUDY OF THE SH3 DOMAIN FROM FYN PROTO-ONCOGENE TYROSINE KINASE COMPLEXED WITH THE SYNTHETIC PEPTIDE P2L CORRESPONDING TO RESIDUES 91-104 OF THE P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, FAMILY OF 25 STRUCTURES 提交 1997-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 91–104（14 aa） 片段：P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, RESIDUES 91 - 104
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1AZG NMR STUDY OF THE SH3 DOMAIN FROM FYN PROTO-ONCOGENE TYROSINE KINASE KINASE COMPLEXED WITH THE SYNTHETIC PEPTIDE P2L CORRESPONDING TO RESIDUES 91-104 OF THE P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, MINIMIZED AVERAGE (PROBMAP) STRUCTURE 提交 1997-11-18 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 91–104（14 aa） 片段：P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, RESIDUES 91 - 104
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1H9O PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE, P85-ALPHA SUBUNIT: C-TERMINAL SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A TYR751 PHOSPHOPEPTIDE FROM THE PDGF RECEPTOR, CRYSTAL STRUCTURE AT 1.79 A 提交 2001-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 617–724（108 aa） 片段：C-TERMINAL SH2 DOMAIN, P85-ALPHA REGULATORY SUBUNIT RESIDUES 617 - 724
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；40MG/ML PROTEIN IN 20 MM PHOSPHATE PH6.2 + PEG8000, RESERVOIR WITH SAME PHOSPHATE + PEG8000 + 250MM NACL, pH 7.00
分辨率 1.79 Å R-free 0.219
1PBW STRUCTURE OF BCR-HOMOLOGY (BH) DOMAIN 提交 1996-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 105–319（215 aa） 片段：P85 ALPHA SUBUNIT BCR-HOMOLOGY DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.235
1PBW STRUCTURE OF BCR-HOMOLOGY (BH) DOMAIN 提交 1996-10-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 105–319（215 aa） 片段：P85 ALPHA SUBUNIT BCR-HOMOLOGY DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.235
1PHT PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN, RESIDUES 1-85 提交 1995-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–85（85 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.258
1PIC PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE, P85-ALPHA SUBUNIT: C-TERMINAL SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A TYR751 PHOSPHOPEPTIDE FROM THE PDGF RECEPTOR, NMR, MINIMIZED MEAN STRUCTURE 提交 1997-06-23 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 617–724（108 aa） 片段：C-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 617 - 724 OF P85-ALPHA REGULATORY SUBUNIT
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；296 K
分辨率未提供
1PKS STRUCTURE OF THE PI3K SH3 DOMAIN AND ANALYSIS OF THE SH3 FAMILY 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–79（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1PKT STRUCTURE OF THE PI3K SH3 DOMAIN AND ANALYSIS OF THE SH3 FAMILY 提交 1994-03-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–79（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
2IUG Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain 提交 2006-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 321–440（120 aa） 片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 20% PEG4000, 50MM MGCL2, 50MM TRIS PH7.5
分辨率 1.89 Å R-free 0.289
2IUH Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with c-Kit phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 321–440（120 aa） 片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CITRATE PH5.6, 0.2M NA/K TARTRATE, 2M AMMONIUM SULFATE
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
2IUI Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with PDGFR phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 321–440（120 aa） 片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, 0.2M AMMONIUM ACETATE, 30% PEG4000
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2IUI Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with PDGFR phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 321–440（120 aa） 片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, 0.2M AMMONIUM ACETATE, 30% PEG4000
分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2RD0 Structure of a human p110alpha/p85alpha complex 提交 2007-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：UNP residues 322-600
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；Sodium Formate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.05 Å R-free 0.323
2V1Y Structure of a phosphoinositide 3-kinase alpha adaptor-binding domain (ABD) in a complex with the iSH2 domain from p85 alpha 提交 2007-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 431–600（170 aa） 片段：INTER-SH2 DOMAIN (ISH2), RESIDUES 431-600
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；0.2M MG(NO3)2, 20% PEG3350 (HAMPTON), 5MM TRIS-HCL PH 7.0 (25C), 5% GLYCEROL AND 5MM FRESH DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.292
3HHM Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha and the drug wortmannin 提交 2009-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–694（373 aa） 片段：UNP residues 322-694
突变：D330N KWT (1S,6BR,9AS,11R,11BR)-9A,11B-DIMETHYL-1-[(METHYLOXY)METHYL]-3,6,9-TRIOXO-1,6,6B,7,8,9,9A,10,11,11B-DECAHYDRO-3H-FURO[4, 3,2-DE]INDENO[4,5-H][2]BENZOPYRAN-11-YL ACETATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.307
3HIZ Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2009-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–694（373 aa） 片段：UNP residues 322-694
突变：D330N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.333
3I5R PI3K SH3 domain in complex with a peptide ligand 提交 2009-07-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–83（83 aa） 片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 10.5；293 K；100mM CAPS, 2M ammonium sulfate, 0.2M lithium sulfate, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
分辨率 1.70 Å R-free 0.223
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–83（83 aa） 片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.299
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–83（83 aa） 片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.299
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–83（83 aa） 片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.299
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–83（83 aa） 片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.299
4A55 Crystal structure of p110alpha in complex with iSH2 of p85alpha and the inhibitor PIK-108 提交 2011-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：NISH2, RESIDUES 322-600
未记录 P08 PIK-108 × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.4；0.1 M NAK PHOSPHATE PH 6.4, 0.14 M NH4H2SO4, 0.1 M NA FORMATE, 0.42 M NA2SO4, 15% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 3.50 Å R-free 0.228
4JPS Co-crystal Structures of the Lipid Kinase PI3K alpha with Pan and Isoform Selective Inhibitors 提交 2013-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 307–593（287 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6uL protein to 4uL well with streak seeding at 18C , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 303K
分辨率 2.20 Å R-free 0.228
4L1B Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha 提交 2013-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：niSH2 of p85alpha, UNP residues 318-615
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.59 Å R-free 0.274
4L23 Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and PI-103 提交 2013-06-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：niSH2 of p85alpha, UNP residues 318-615
未记录 X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
4L2Y Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and compound 9d 提交 2013-06-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：niSH2 of p85alpha, UNP residues 318-615
未记录 XXK 3-amino-5-[4-(morpholin-4-yl)pyrido[3',2':4,5]furo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.271
4OVU Crystal Structure of p110alpha in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2014-01-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：UNP residues 322-600
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate
分辨率 2.96 Å R-free 0.272
4OVV Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with diC4-PIP2 提交 2014-01-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：UNP residues 322-600
未记录 PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.339
4WAF Crystal Structure of a novel tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazine in an engineered PI3K alpha 提交 2014-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–317（316 aa） 片段：UNP residues 2-317
突变：T12Y 3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12% PEG 3350, 120mM potassium thiocyanate
分辨率 2.39 Å R-free 0.247
4YKN Pi3K alpha lipid kinase with Active Site Inhibitor 提交 2015-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 318–615（298 aa） 片段：UNP P27986 residues 318-615, LINKER (GSPGISGGGGG), P42336 residues 2-1068
未记录 4EL 3-(6-methoxypyridin-3-yl)-5-[({4-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfamoyl]phenyl}amino)methyl]benzoic acid × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；ethylenene glycol, PIP2
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
4ZOP Co-crystal Structure of Lipid Kinase PI3K alpha with a selective phosphatidylinositol-3 kinase alpha inhibitor 提交 2015-05-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–290（290 aa）
未记录 4Q2 (2S,3R)-N~1~-(8-tert-butyl-4,5-dihydro[1,3]thiazolo[4,5-h]quinazolin-2-yl)-3-methylpyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6UL PROTEIN TO 4UL WELL WITH STREAK SEEDING AT 18C , PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.62 Å R-free 0.258
5AUL PI3K p85 C-terminal SH2 domain/CD28-derived peptide complex 提交 2015-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 622–728（107 aa） 片段：UNP residues 614-720
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Sodium Acetate trihydrate, 200 mM Ammonium Acetate, 30% PEG4000
分辨率 1.10 Å R-free 0.160
5FI4 Discovery of imidazo[1,2-a]-pyridine inhibitors of pan-PI3 kinases that are efficacious in a mouse xenograft model 提交 2015-12-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–317（316 aa） 片段：UNP residues 2-317
未记录 GOL GLYCEROL × 1 5XV ~{N}-[6-[5-azanyl-6-[(2~{S})-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]oxy-pyrazin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12.5% PEG 3350, 125 mM KSCN Drops were 5uL protein: 3uL well solutions and streak seeded.
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5GJI PI3K p85 N-terminal SH2 domain/CD28-derived peptide complex 提交 2016-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 325–430（106 aa） 片段：UNP residues 325-430
突变：D330N SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；100mM Sodium acetate trihydrate, 30% PEG MME 2000, 200mM Ammonium sulfate
分辨率 0.90 Å R-free 0.145
5ITD Crystal structure of PI3K alpha with PI3K delta inhibitor 提交 2016-03-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–317（316 aa） 片段：UNP residues 2-317
未记录 6CY 5-{4-[3-(4-acetylpiperazine-1-carbonyl)phenyl]quinazolin-6-yl}-2-methoxypyridine-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 uL of protein was mixed with 5 uL of well solution containing 12% PEG 3350 and 120 mM potassium thiocyanate
分辨率 3.02 Å R-free 0.241
5M6U HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH LASW1579 提交 2016-10-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–724（724 aa） 片段：UNP residues 431-599
未记录 7KA 4-azanyl-6-[[(1~{S})-1-(4-oxidanylidene-3-phenyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-2-yl)ethyl]amino]pyrimidine-5-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；NULL
分辨率 2.85 Å R-free 0.309
5SW8 Crystal structure of PI3Kalpha in complex with fragments 7 and 11 提交 2016-08-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 70S 2H-indazol-5-amine × 1 FB1 2-CHLOROBENZENESULFONAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
5SWG Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 5 and 21 提交 2016-08-08 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 AX7 1H-benzimidazol-2-amine × 1 CAQ CATECHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.11 Å R-free 0.262
5SWO Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 4 and 19 提交 2016-08-08 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 70T 2-methyl-5-nitro-1H-indole × 1 2ZV 4-methyl-3-nitropyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.274
5SWP Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 6 and 24 提交 2016-08-08 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 70W tert-butyl 4-aminopiperidine-1-carboxylate × 2 70V 2-methylcyclohexane-1,3-dione × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.41 Å R-free 0.296
5SWR Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 20 and 26 提交 2016-08-08 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 718 6-hydroxy-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SAL 2-HYDROXYBENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.31 Å R-free 0.273
5SWT Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 17 and 27 提交 2016-08-08 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 71A pyridin-3-ol × 1 71B 3-fluoro-4-methoxyaniline × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
5SX8 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 12 and 15 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71M 6-methylpyridin-2-amine × 2 LUZ pteridine-2,4(1H,3H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.47 Å R-free 0.276
5SXA Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 10 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71N 2-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-5-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.35 Å R-free 0.275
5SXB Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 23 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 SOA ISATOIC ANHYDRIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.30 Å R-free 0.278
5SXC Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 8 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 URF 5-FLUOROURACIL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.55 Å R-free 0.268
5SXD Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 22 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71F 2-methoxybenzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.50 Å R-free 0.276
5SXE Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 19 and 28 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71G 3-aminobenzonitrile × 1 ES3 4-bromo-1H-imidazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.51 Å R-free 0.271
5SXF Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 9 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 HPP HYDROXYPHENYL PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.46 Å R-free 0.267
5SXI Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 13 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71J trans-cyclohexane-1,4-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.40 Å R-free 0.279
5SXJ Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 29 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 BHO BENZHYDROXAMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.42 Å R-free 0.279
5SXK Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 18 提交 2016-08-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa） 片段：residues 322-600
未记录 71K 2-methylbenzene-1,3-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate
分辨率 3.55 Å R-free 0.278
5UBT CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A 7-(3-(PIPERAZIN-1-YL)PHENYL)PYRROLO[2,1-F][1,2,4] TRIAZIN-4-AMINE DERIVIATINE 提交 2016-12-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 432–599（168 aa）
未记录 85S 1-[4-(3-{4-amino-5-[1-(oxan-4-yl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；NULL
分辨率 2.83 Å R-free 0.268
5UK8 The co-structure of (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–293（293 aa）
突变：T6Y 8DV (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 303.15K
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
5UKJ The co-structure of N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3- b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5- a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–293（293 aa）
未记录 3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,
分辨率 2.80 Å R-free 0.252
5UL1 The co-structure of 3-amino-6-(4-((1-(dimethylamino)propan-2-yl)sulfonyl)phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–293（293 aa）
未记录 8DY 3-amino-6-(4-{[(2S)-1-(dimethylamino)propan-2-yl]sulfonyl}phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.00 Å R-free 0.260
5VLR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A TRIFLUORO-ETHYL-PYRAZOL-PYROLOTRIAZINE INHIBITOR 提交 2017-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 431–600（170 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；NULL, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
5VLR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A TRIFLUORO-ETHYL-PYRAZOL-PYROLOTRIAZINE INHIBITOR 提交 2017-04-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 431–600（170 aa）
未记录 9EM 4-acetyl-1-(3-{4-amino-5-[1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)-3,3-dimethylpiperazin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；NULL, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
5XGH Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–598（277 aa） 片段：UNP residues 322-598
未记录 84U 3-[(4-fluorophenyl)methylamino]-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.280
5XGI Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–598（277 aa） 片段：UNP residues 322-598
未记录 84R 3-azanyl-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.56 Å R-free 0.290
5XGJ Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–599（278 aa） 片段：UNP residues 322-598
未记录 84X 3-(4-morpholin-4-ylfuro[3,2-d]pyrimidin-2-yl)-5-[(phenylmethyl)amino]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME
分辨率 2.97 Å R-free 0.279
6NCT Structure of p110alpha/niSH2 - vector data collection 提交 2018-12-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes, 1.4-1.6 M sodium formate
分辨率 3.35 Å R-free 0.271
6PYR Human PI3Kdelta in complex with Compound 2-10 ((3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one) 提交 2019-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 131–299（169 aa） 片段：UNP residues 131-299
未记录 P5J (3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；12-14% PEG6000, 100 mM MES/NaOH, pH 5.75, 5 mM DTT
分辨率 2.21 Å R-free 0.259
6PYU Human PI3Kdelta in complex with Compound 4-2 ((3S)-1'-(cyclopropanecarbonyl)-5-(quinoxalin-6-yl)spiro[indole-3,2'-pyrrolidin]-2(1H)-one) 提交 2019-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 131–299（169 aa） 片段：UNP residues 131-299
未记录 P5V (3S)-1'-(cyclopropanecarbonyl)-5-(quinoxalin-6-yl)spiro[indole-3,2'-pyrrolidin]-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；not available
分辨率 2.54 Å R-free 0.292
7CIO Molecular interactions of cytoplasmic region of CTLA-4 with SH2 domains of PI3-kinase 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 614–720（107 aa）
突变：C656S, C659V, C670L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 30% PEG 4000
分辨率 1.10 Å R-free 0.179
7LM2 HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 3C 提交 2021-02-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 131–299（169 aa）
未记录 Y5Y cyclopropyl[(3S)-3-{[9-ethyl-8-(2-methylpyrimidin-5-yl)-9H-purin-6-yl]amino}pyrrolidin-1-yl]methanone × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；12-14% PEG6000, 100 MM MES/NAOH, PH 5.75, 5 MM DTT
分辨率 2.79 Å R-free 0.289
7LQ1 HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 28 提交 2021-02-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 131–299（169 aa）
未记录 YA7 N-(5-(6-(2-((2S,6R)-2,6-dimethylmorpholino)pyridin-4-yl)-1-oxoisoindolin-4-yl)-2-methoxypyridin-3-yl)methanesulfonamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；16% PEG6000, 0.10 M KCL, 0.10 M MES PH 6.0
分辨率 2.96 Å R-free 0.281
7MYN Cryo-EM Structure of p110alpha in complex with p85alpha 提交 2021-05-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
7MYO Cryo-EM structure of p110alpha in complex with p85alpha inhibited by BYL-719 提交 2021-05-21 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
7PG5 Crystal Structure of PI3Kalpha 提交 2021-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 307–593（287 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% PEG 5K MME (w/v), 160 nM KSCN, 100 mM sodium cacodylate pH 6.5.
分辨率 2.20 Å R-free 0.246
7PG6 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with the inhibitor NVP-BYL719 提交 2021-08-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 307–593（287 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG 5000, 160 mM KSCN and 100 mM sodium cacodylate pH 6.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.240
7RNS nSH2 domain of p85-alpha subunit of phosphatidylinositol 3-kinase in complex with an actin peptide with phosphorylated tyrosine 53 提交 2021-07-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 51–164（114 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.05 M cadmium sulfate hydrate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 1.0 M sodium acetate trihydrate
分辨率 1.14 Å R-free 0.147
7TZ7 PI3K alpha in complex with an inhibitor 提交 2022-02-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–291（291 aa）
未记录 KVJ (4S,5R)-3-[2'-amino-2-(morpholin-4-yl)-4'-(trifluoromethyl)[4,5'-bipyrimidin]-6-yl]-4-(hydroxymethyl)-5-methyl-1,3-oxazolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；0.15M Potassium Thiocyanate, 20% PEG 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.277
8DCP PI 3-kinase alpha with nanobody 3-126 提交 2022-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.41 Å
8DCX PI 3-kinase alpha with nanobody 3-159 提交 2022-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8DD4 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142 提交 2022-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8DD8 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142, crosslinked with DSG 提交 2022-06-17 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8GUB Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant H1047R in complex with BYL-719 提交 2022-09-11 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8H36 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CUL3-Rbx1-p85a dimeric complex 提交 2022-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–724（724 aa）
链 H 1–724（724 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8H37 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CUL3-Rbx1-p85a tetrameric complex 提交 2022-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–724（724 aa）
链 H 1–724（724 aa）
链 I 1–724（724 aa）
链 J 1–724（724 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.52 Å
8ILR Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 16 提交 2023-03-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 7TZ N-[(2S)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8ILS Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 17 提交 2023-03-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 7U5 N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8ILV Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 18 提交 2023-03-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 L2V N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[3-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
8SBC Co-structure of Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform and brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–293（293 aa）
未记录 ZTV (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(pyridin-2-yl)-1H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN PROTEIN SOLUTION : 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML FORMATION METHOD : SOAKING PROTOCOL : SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, REMARK 280 XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS METHOD : VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP TEMPERATURE : 303.0 CRYO PROTOCOL : 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION
分辨率 2.30 Å R-free 0.271
8SBJ Co-structure Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform complexed with brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–293（293 aa）
未记录 ZUO (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(1H-pyrazol-3-yl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN; PROTEIN SOLUTION: 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML, FORMATION METHOD : SOAKING, PROTOCOL: SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS; CRYO PROTOCOL: 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 8–293（286 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 8–293（286 aa）
未记录 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350
分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 8–293（286 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 8–293（286 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TS7 Human PI3K p85alpha/p110alpha 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.71 Å R-free 0.288
8TS8 p85alpha/p110alpha heterodimer H1047R mutant 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.72 Å R-free 0.265
8TS9 Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 1 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 UE9 5-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.252
8TSA Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 2 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.51 Å R-free 0.276
8TSB Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to compound 2 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 3.53 Å R-free 0.256
8TSC Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 3 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 UJC (1S)-7-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-1-(2-methylphenyl)-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 3.62 Å R-free 0.255
8TSD Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to RLY-2608 提交 2023-08-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 318–615（298 aa） 片段：residues 318-615
未记录 XUZ N-{(3R,6M)-3-(2-chloro-5-fluorophenyl)-6-[(4S)-5-cyano[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridin-6-yl]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.277
8TU6 CryoEM structure of PI3Kalpha 提交 2023-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–724（724 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.
分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–600（279 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.
分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–600（279 aa）
未记录 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2
分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–600（279 aa）
未记录 YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2
分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–600（279 aa）
未记录 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 322–600（279 aa）
未记录 YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0
分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8W9A CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-7909 binding at an allosteric site 提交 2023-09-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–724（724 aa）
未记录 UEX 6-chloranyl-3-[[(1R)-1-[2-(1,3-dihydropyrrolo[3,4-c]pyridin-2-yl)-3,6-dimethyl-4-oxidanylidene-quinazolin-8-yl]ethyl]amino]pyridine-2-carboxylic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8W9B CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-8557 binding at an allosteric site 提交 2023-09-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 322–600（279 aa）
未记录 UJ3 1-[(1S)-1-(5-fluoranyl-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2-methyl-propyl]-3-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-5-yl)urea × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9LWQ Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 QIH 1-[7-[[2-[[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyridin-4-yl]amino]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9LWR Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9LWS Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–724（722 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
9NI6 Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–724（724 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
9NI8 Cryo-EM structure of the Class 2 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–724（724 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9NLC Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs low-pass filtered to 10 angstroms 提交 2025-03-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–724（724 aa）
未记录 A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å

共 103 个其他 PDB 条目、116 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 P85A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–279； UniProt 322–600

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5sx9

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5sx9
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5sx9
沉积日期 deposition_date2016-08-09
结构标题 titleCrystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 14
关键词 keywordslipid kinase, phosphoinositide, 3-kinase, signaling, TRANSFERASE, TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR complex; TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier35.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron34.68 Å
零角强度 I(0) i0345463000.00
分子量 molecular_weight150960.0 kDa
排除体积 excluded_volume189410 ų
包络体积 envelope_volume248920 ų
水化壳体积 shell_volume58128 ų
包络直径 envelope_diameter128.2 Å
壳层 Rg shell_rg42.45 Å
包络 Rg envelope_rg34.92 Å
形状 Rg shape_rg34.68 Å
总 Rg total_rg35.21 Å
总原子数 total_atoms10602
残基数 n_residues1283
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax117.8 Å
Rg (实空间) rg_real35.33 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.84 Å
I(0) (实空间) i0_real3.4550e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.6040e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal35.40 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal345500000.0000
解质量估计 total_estimate0.6616
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary44.5 Å
偏度 Skewness skewness0.274
峰度 Kurtosis kurtosis-0.267
角度范围 angular_range— – 0.2250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha76050000.0000
实空间数据点数 n_real_points46
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.826; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.062; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.938
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id5sx9A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily150 — C2 domain
结构域编号 domain_id5sx9A02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Phosphatidylinositol 3-kinase, accessory domain (PIK)
结构域编号 domain_id5sx9B01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1490 —
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)