5t1o

Solution-state NMR and SAXS structural ensemble of NPr (1-85) in complex with EIN-Ntr (170-424)

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphocarrier protein NPr

Escherichia coli O157:H7

UniProt P0A9N2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP × 1 (P37177) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PTSO_ECO57
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–85; UniProt 1–85

Phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P37177

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Phosphocarrier protein NPr × 1 (P0A9N2) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PT1P_ECOLI
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 2–256; UniProt 170–424

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5t1o
沉积日期 deposition_date2016-08-19
结构标题 titleSolution-state NMR and SAXS structural ensemble of NPr (1-85) in complex with EIN-Ntr (170-424)
关键词 keywordsPTSNtr, phosphotransfer, bacterial, complex, TRANSFERASE; TRANSFERASE
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5t1o__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5t1o__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5t1o__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)24.52 Å
Rg(电子密度)23.81 Å
总 Rg24.58 Å
原子数5287
残基数340
排除体积46933 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5t1o__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 5t1o__assembly_1__model_2 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 5t1o__assembly_1__model_3 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 5t1o__assembly_1__model_4 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 5t1o__assembly_1__model_5 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 5t1o__assembly_1__model_6 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 5t1o__assembly_1__model_7 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 5t1o__assembly_1__model_8 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 5t1o__assembly_1__model_9 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 5t1o__assembly_1__model_10 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 5t1o__assembly_1__model_11 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 5t1o__assembly_1__model_12 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 5t1o__assembly_1__model_13 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 5t1o__assembly_1__model_14 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 5t1o__assembly_1__model_15 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 5t1o__assembly_1__model_16 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 5t1o__assembly_1__model_17 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 5t1o__assembly_1__model_18 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 5t1o__assembly_1__model_19 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 5t1o__assembly_1__model_20 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd5t1oa_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.94 — HPr-like
超家族 Superfamily superfamilyd.94.1 — HPr-like
家族 Family familyd.94.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id5t1oA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1340 — Histidine-containing Protein; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — HPr-like
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7. 引用文献 (1)