5t4d

Cryo-EM structure of Polycystic Kidney Disease protein 2 (PKD2), residues 198-703

Method: ELECTRON MICROSCOPY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

hPKD:198-703, Polycystin-2

Homo sapiens

UniProt Q13563

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PKD2_HUMAN
Isoform Q13563-5
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 6–510; UniProt 198–702 作者链 B; PDB构建体 6–510; UniProt 198–702 作者链 C; PDB构建体 6–510; UniProt 198–702 作者链 D; PDB构建体 6–510; UniProt 198–702

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5t4d
沉积日期 deposition_date2016-08-29
结构标题 titleCryo-EM structure of Polycystic Kidney Disease protein 2 (PKD2), residues 198-703
关键词 keywordsTRP channel, PKD2, nanodisc, TRPP, METAL TRANSPORT; METAL TRANSPORT
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5t4d__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5t4d__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5t4d__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)38.45 Å
Rg(电子密度)37.18 Å
总 Rg37.89 Å
原子数14876
残基数1852
排除体积269230 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5t4d__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 引用文献 (1)