SAXSdb — 5tnc

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TROPONIN-C

Meleagris gallopavo

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	CALCIUM ION × 2 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNC2_MELGA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–162； UniProt 2–162

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5tnc
沉积日期 deposition_date	1988-05-27
结构标题 title	REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF TROPONIN C FROM TURKEY SKELETAL MUSCLE AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION
关键词 keywords	CONTRACTILE SYSTEM PROTEINS; CONTRACTILE SYSTEM PROTEINS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5tnc__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5tnc__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5tnc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.39 Å
Rg（电子密度）	22.68 Å
总 Rg	23.22 Å
原子数	1263
残基数	161
排除体积	22186 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5tnc__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	TROPONIN-C
分子量 formula_weight	18320.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1421

ASMTDQQAEARAFLSEEMIAEFKAAFDMFDADGGGDISTKELGTVMRMLGQNPTKEELDAIIEEVDEDGSGTIDFEEFLVMMVRQMKEDAKGKSEEELEDCFRIFDKNADGFIDIEELGEILRATGEHVTEEDIEDLMKDSDKNNDGRIDFDEFLKMMEGVQ

来源 Source

来源生物 organism	Meleagris gallopavo
通用名 common_name	turkey
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9103

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	157

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d5tnca_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5tncA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	5tncA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

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7. 引用文献 (10)

Refined crystal structure of troponin C from turkey skeletal muscle at 2.0 A resolution.

J.Mol.Biol. (1988)

PMID: 3210231 · DOI: 10.1016/0022-2836(88)90208-2 PRIMARY

Molecular Structure of Troponin C and its Implications for the Ca2+ Triggering of Muscle Contraction

Methods Enzymol. (1987)

Conformational Flexibility of Troponin C

Calcium-Binding Proteins in Health and Disease (1987)

Calcium Binding to Skeletal Muscle Troponin C and the Regulation of Muscle Contraction

Ciba Found.Symp. (1986)

Crystallographic Determination of Lanthanide Ion Binding to Troponin C

FEBS Lett. (1986)

A Model for the Ca2+-Induced Conformational Transition of Troponin C. A Trigger for Muscle Contraction

J.Biol.Chem. (1986)

Common Structural Framework of the Two Ca2+(Slash)Mg2+ Binding Loops of Troponin C and Other Ca2+ Binding Proteins

Biochemistry (1985)

Structure of the Calcium Regulatory Muscle Protein Troponin-C at 2.8 Angstroms Resolution

Nature (1985)

Crystallographic Data for Troponin C from Turkey Skeletal Muscle

J.Mol.Biol. (1984)

The Crystal Structure of Troponin C from Turkey Skeletal Muscle at 2.8 Angstroms Resolution

Acta Crystallogr.,Sect.A (1984)

晶胞边长 a length_a	66.550 Å
晶胞边长 b length_b	66.550 Å
晶胞边长 c length_c	60.910 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	0.1550
R_work r_work	—
R_free r_free	—

REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF TROPONIN C FROM TURKEY SKELETAL MUSCLE AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TROPONIN-C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5tnc__assembly_1__model_1

5tnc__assembly_1__model_1 | I(q)

5tnc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (10)

REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF TROPONIN C FROM TURKEY SKELETAL MUSCLE AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TROPONIN-C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5tnc__assembly_1__model_1

5tnc__assembly_1__model_1 | I(q)

5tnc__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (10)