SAXSdb — 5tre

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Frataxin homolog, mitochondrial × 24 （Q07540）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ISU1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 b； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 c； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 d； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 e； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 f； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 g； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 h； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 i； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 j； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 k； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 l； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 m； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 n； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 o； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 p； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 q； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 r； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 s； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 t； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 u； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 v； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 w； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165 作者链 x； PDB构建体 5–142； UniProt 28–165

Frataxin homolog, mitochondrial

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q07540

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial × 24 （Q03020）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FRDA_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 B； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 C； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 D； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 E； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 F； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 G； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 H； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 I； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 J； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 K； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 L； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 M； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 N； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 O； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 P； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 Q； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 R； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 S； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 T； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 U； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 V； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 W； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172 作者链 X； PDB构建体 1–121； UniProt 52–172

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5tre
沉积日期 deposition_date	2016-10-26
结构标题 title	Zinc and the Iron Donor Frataxin Regulate Oligomerization of the Scaffold Protein to Form New Fe-S Cluster Assembly Centers
关键词 keywords	Friedreich Ataxia, frataxin, iron-sulfur protein, mitochondria, protein complex, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5tre__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5tre__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5tre__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	57.38 Å
Rg（电子密度）	56.61 Å
总 Rg	56.93 Å
原子数	48456
残基数	6312
排除体积	865850 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5tre__assembly_1__model_1`	48-meric （48）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial
分子量 formula_weight	15383.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s,t,u,v,w,x
原子数 atom_count	48456

GSHMSSITKRLYHPKVIEHYTHPRNVGSLDKKLPNVGTGLVGAPACGDVMRLQIKVNDSTGVIEDVKFKTFGCGSAIASSSYMTELVQGMTLDDAAKIKNTEIAKELSLPPVKLHCSMLAEDAIKAAIKDYKSKRNTPTMLS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli #1/H766

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Frataxin homolog, mitochondrial
分子量 formula_weight	13456.0 kDa
EC 编号 ec_number	1.16.3.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X

VESSTDGQVVPQEVLNLPLEKAHEEADDYLDHLLDSLEELSEAHPDCIPDVELSHGVMTLEIPAFGTYVINKQPPNKQIWLASPLSGPNRFDLLNGEWVSLRNGTKLTDILTEEVEKAISK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli #1/H766

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	15.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	4218

Zinc and the Iron Donor Frataxin Regulate Oligomerization of the Scaffold Protein to Form New Fe-S Cluster Assembly Centers

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Frataxin homolog, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5tre__assembly_1__model_1

5tre__assembly_1__model_1 | I(q)

5tre__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Zinc and the Iron Donor Frataxin Regulate Oligomerization of the Scaffold Protein to Form New Fe-S Cluster Assembly Centers

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Frataxin homolog, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5tre__assembly_1__model_1

5tre__assembly_1__model_1 | I(q)

5tre__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)