5uk6

Structure of Anabaena Sensory Rhodopsin Determined by Solid State NMR Spectroscopy and DEER

Method: SOLID-STATE NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Bacteriorhodopsin

Nostoc sp. (strain PCC 7120 / SAG 25.82 / UTEX 2576)

UniProt Q8YSC4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8YSC4_NOSS1
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–229; UniProt 1–229 作者链 B; PDB构建体 1–229; UniProt 1–229 作者链 C; PDB构建体 1–229; UniProt 1–229

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5uk6
沉积日期 deposition_date2017-01-20
结构标题 titleStructure of Anabaena Sensory Rhodopsin Determined by Solid State NMR Spectroscopy and DEER
关键词 keywordsAnabeana sensory rhodopsin, Trimer, Seven-transmembrane proteins, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodSOLID-STATE NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5uk6__assembly_1__model_5

Assembly 1 · Model 5 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5uk6__assembly_1__model_5 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5uk6__assembly_1__model_5 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)27.79 Å
Rg(电子密度)26.01 Å
总 Rg27.17 Å
原子数11223
残基数684
排除体积103460 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5uk6__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 5uk6__assembly_1__model_2 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 5uk6__assembly_1__model_3 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 5uk6__assembly_1__model_4 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 5uk6__assembly_1__model_5 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 5uk6__assembly_1__model_6 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 5uk6__assembly_1__model_7 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 5uk6__assembly_1__model_8 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 5uk6__assembly_1__model_9 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 5uk6__assembly_1__model_10 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id5uk6A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1070 — Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Rhodopsin 7-helix transmembrane proteins
结构域编号 domain_id5uk6B00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1070 — Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Rhodopsin 7-helix transmembrane proteins
结构域编号 domain_id5uk6C00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1070 — Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Rhodopsin 7-helix transmembrane proteins
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7. 引用文献 (1)