Methanosarcina mazei (strain ATCC BAA-159 / DSM 3647 / Goe1 / Go1 / JCM 11833 / OCM 88)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 单体 | 蛋白 1 RNA 1 | RNA (70-MER) × 1 ZINC ION × 1 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白–RNA | 单体 | 蛋白 1 RNA 1 | RNA (70-MER) × 1 ZINC ION × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | PYLS_METMA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 9–109； UniProt 1–101 作者链 B； PDB构建体 9–109； UniProt 1–101 |
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| 条目编号 entry_id | 5v6x |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-03-17 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the tRNA binding domain of Pyrrolysyl-tRNA synthetase mutant (32A NTD) bound to tRNA(Pyl) |
| 关键词 keywords | PylRS, tRNA, aminoacyl-tRNA synthetase, LIGASE-RNA complex; LIGASE/RNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 22.71 Å |
| Rg（电子密度） | 22.03 Å |
| 总 Rg | 22.60 Å |
| 原子数 | 2174 |
| 残基数 | 154 |
| 排除体积 | 33262 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |