5vee

PAK4 kinase domain in complex with FRAX486

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 69.4 Å Quality: REASONABLE

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase PAK 4

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 286–591	片段：UNP residues 286-591 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	981 6-(2,4-dichlorophenyl)-8-ethyl-2-{[3-fluoro-4-(piperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 1.5 - 2.0 M Na acetate	分辨率 2.50 Å R-free 0.276

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5VEE	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2CDZ CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN P21-ACTIVATED KINASE 4 IN COMPLEX WITH CGP74514A 提交 2006-01-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 291–591（301 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 291-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	23D N2-[(1R,2S)-2-AMINOCYCLOHEXYL]-N6-(3-CHLOROPHENYL)-9-ETHYL-9H-PURINE-2,6-DIAMINE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
2J0I CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN P21-ACTIVATED KINASE 4 提交 2006-08-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 291–591（301 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 291-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；150 UL SITTING DROPS, 4DEG, 0.2M K3(CIT), 0.1M BIS-TRIS PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350, 10% ETHYLENE GLYCOL	分辨率 1.60 Å R-free 0.215
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 10–44（35 aa）片段：CRIB domain 链 J 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 10–44（35 aa）片段：CRIB domain 链 L 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 N 10–44（35 aa）片段：CRIB domain 链 O 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 10–44（35 aa）片段：CRIB domain 链 P 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2Q0N Structure of human p21 activating kinase 4 (PAK4) in complex with a consensus peptide 提交 2007-05-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 291–591（301 aa）片段：Kinase domain, residues 291-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；1.7M Ammonium sulfate, 15% PEG400, 1M Tris-HCl pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.75 Å R-free 0.228
2X4Z Crystal Structure of the Human p21-Activated Kinase 4 in Complex with PF-03758309 提交 2010-02-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 296–591（296 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 296-591	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2 7KC PF-3758309 × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.262
4APP Crystal Structure of the Human p21-Activated Kinase 4 in Complex with (S)-N-(5-(3-benzyl-1-methylpiperazine-4-carbonyl)-6,6-dimethyl-1,4,5, 6-tetrahydropyrrolo(3,4-c)pyrazol-3-yl)-3-phenoxybenzamide 提交 2012-04-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	N53 N-[6,6-dimethyl-5-[(2S)-4-methyl-2-(phenylmethyl)piperazin-1-yl]carbonyl-2,4-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazol-3-yl]-3-phenoxy-benzamide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；294 K；CRYSTALS WERE GROWN FROM THE HANGING DROP VAPOR DIFFUSION METHOD AT 21 DEGREES CELCIUS BY MIXING 3.6 MICROLITERS OF A 10 MG/ML PROTEIN SOLUTION WITH A RESERVIOR SOLUTION CONTAINING: 5% (W/V) MEPEG 5K, 0.1 M IMIDAZOLE AT PH 6.2, 0.1 M (NH4)2HPO4 AND 5MM DTT	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
4FIE Full-length human PAK4 提交 2012-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–423（423 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES, 500 mM K/Na tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.11 Å R-free 0.276
4FIE Full-length human PAK4 提交 2012-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–423（423 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES, 500 mM K/Na tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.11 Å R-free 0.276
4FIF Catalytic domain of human PAK4 with RPKPLVDP peptide 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–318（318 aa）链 C 49–56（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES, 700 mM K/Na tartrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å R-free 0.227
4FIF Catalytic domain of human PAK4 with RPKPLVDP peptide 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–318（318 aa）链 D 49–56（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES, 700 mM K/Na tartrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å R-free 0.227
4FIG Catalytic domain of human PAK4 提交 2012-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–318（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES, 700 mM K/Na tartrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.01 Å R-free 0.221
4FIG Catalytic domain of human PAK4 提交 2012-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–318（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES, 700 mM K/Na tartrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.01 Å R-free 0.221
4FIH Catalytic domain of human PAK4 with QKFTGLPRQW peptide 提交 2012-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–318（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Tris-HCl, 1.5M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.97 Å R-free 0.225
4FII Catalytic domain of human PAK4 with RPKPLVDP peptide 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–318（318 aa）链 B 49–56（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Tris-HCl, 1.5M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
4FIJ Catalytic domain of human PAK4 提交 2012-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–318（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Tris-HCl, 1.5M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
4JDH Crystal structure of Serine/threonine-protein kinase PAK 4 in complex with Paktide T peptide substrate 提交 2013-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–591（306 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Tris-HCl, 1.5 - 2.0 M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.00 Å R-free 0.224
4JDI Crystal structure of Serine/threonine-protein kinase PAK 4 in complex with Paktide S peptide substrate 提交 2013-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–591（306 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Tris-HCl, 1.5 - 2.0 M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.85 Å R-free 0.233
4JDJ Crystal structure of Serine/threonine-protein kinase PAK 4 F461V mutant in complex with Paktide T peptide substrate 提交 2013-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–591（306 aa）	突变：F461V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Tris-HCl, 1.5 - 2.0 M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.30 Å R-free 0.244
4JDK Crystal structure of Serine/threonine-protein kinase PAK 4 F461V mutant in complex with Paktide S peptide substrate 提交 2013-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–591（306 aa）	突变：F461V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Tris-HCl, 1.5 - 2.0 M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.249
4L67 Crystal Structure of Catalytic Domain of PAK4 提交 2013-06-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：UNP residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1M Tris pH 8.5, 12%(M/V) PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.80 Å R-free 0.333
4L67 Crystal Structure of Catalytic Domain of PAK4 提交 2013-06-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 36–60（25 aa）片段：UNP residues 36-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1M Tris pH 8.5, 12%(M/V) PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.80 Å R-free 0.333
4NJD Structure of p21-activated kinase 4 with a novel inhibitor KY-04031 提交 2013-11-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：UNP residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NJD N-(1H-indazol-5-yl)-N'-[2-(1H-indol-3-yl)ethyl]-6-methoxy-1,3,5-triazine-2,4-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；297 K；0.6M sodium potassium tartrate, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 2.50 Å R-free 0.321
4O0V Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors 提交 2013-12-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：unp residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	2OL 1-({1-(2-aminopyrimidin-4-yl)-2-[(2-methoxyethyl)amino]-1H-benzimidazol-6-yl}ethynyl)cyclohexanol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；500 uL of 0.2 M Tri-Potassium citrate and 20% PEG3350 in the reservoir, and drops set up by mixing 1.0 uL of reservoir solution and 1.0 uL of protein, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4O0X Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors 提交 2013-12-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：unp residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	2OQ 1-{[1-(4-amino-1,3,5-triazin-2-yl)-2-methyl-1H-benzimidazol-6-yl]ethynyl}cyclohexanol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；0.2 M Tri-Potassium citrate and 20% PEG3350 in the reservoir, and drops set up by mixing 1.0 uL of reservoir solution and 1.0 uL of protein, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.48 Å R-free 0.242
4O0Y Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors 提交 2013-12-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：unp residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	2OO 4-[1-(4-amino-1,3,5-triazin-2-yl)-2-(ethylamino)-1H-benzimidazol-6-yl]-2-methylbut-3-yn-2-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；0.2 M Tri-Potassium citrate and 20% PEG3350 in the reservoir, and drops set up by mixing 1.0 uL of reservoir solution and 1.0 uL of protein, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.238
4XBR In cellulo Crystal Structure of PAK4 in complex with Inka 提交 2014-12-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 278–591（314 aa）片段：UNP residues 166-203,UNP residues 278-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 IN CELL；310.15 K；In cellulo growth	分辨率 2.94 Å R-free 0.230
4XBU In vitro Crystal Structure of PAK4 in complex with Inka peptide 提交 2014-12-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–591（306 aa）片段：UNP residues 286-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298.15 K；Tris-HCl, PEG 8000	分辨率 2.06 Å R-free 0.243
5BMS Crystal structure of P21-activated kinase 4 in complex with an inhibitor compound 29 提交 2015-05-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：Protein kinase domain residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	4T6 N~2~-[(7-chloro-1H-benzimidazol-6-yl)methyl]-N~4~-(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Tri-Potassium citrate and 20% PEG3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.230
5I0B Structure of PAK4 提交 2016-02-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：UNP residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	67U 6-bromo-2-[1-methyl-3-(propan-2-yl)-1H-pyrazol-4-yl]-1H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.8M sodium potassium tartrate, 0.1M TRIS pH 8.5	分辨率 3.09 Å R-free 0.269
5UPK CDC42 binds PAK4 via an extended GTPase-effector interface - 3 peptide: PAK4cat, PAK4-N45, CDC42 提交 2017-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–45（45 aa）片段：UNP residues 1-45 链 B 109–426（318 aa）片段：UNP residues 109-426	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 22% PEG1,000	分辨率 2.40 Å R-free 0.264
5UPL CDC42 binds PAK4 via an extended GTPase-effector inteface - 2 peptide: PAK4FL, CDC42 - UNREFINED 提交 2017-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–426（425 aa）片段：UNP residues 2-426	突变：S474SEP 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 50mM Na2SO4, 6% PEG6000	分辨率 3.00 Å R-free 0.310
5VED PAK4 kinase domain in complex with Staurosporine 提交 2017-04-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 286–591（306 aa）片段：UNP residues 286-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	STU STAUROSPORINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 1.5 - 2.0 M Na acetate	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
5VEF PAK4 kinase domain in complex with fasudil 提交 2017-04-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 286–591（306 aa）片段：UNP residues 286-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	M77 5-(1,4-DIAZEPAN-1-SULFONYL)ISOQUINOLINE × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 1.5 - 2.0 M Na acetate	分辨率 1.75 Å R-free 0.239
5XVA Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor CZH216 提交 2017-06-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：PAK4 Kinase Domain (UNP RESIDUES 300-591)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	8FU [6-chloranyl-4-[(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]quinazolin-2-yl]-[(3R)-3-methylpiperazin-1-yl]methanone × 1 EOH ETHANOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.1 M Imidazole pH 6.5, 1.0 M sodium acetate trihydrate	分辨率 1.85 Å R-free 0.209
5XVF Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor CZH062 提交 2017-06-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–588（289 aa）片段：PAK4 Kinase Domain (UNP RESIDUES 300-588)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	8FR 2-(4-azanylpiperidin-1-yl)-6-chloranyl-N-(1-methylimidazol-4-yl)quinazolin-4-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG3350.	分辨率 2.65 Å R-free 0.251
5XVG Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor CZH226 提交 2017-06-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：PAK4 Kinase Domain (UNP RESIDUES 300-591)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	8FX [6-chloranyl-4-[(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]quinazolin-2-yl]-[(3R)-3-methylpiperazin-1-yl]methanone × 1 EOH ETHANOL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.5M Magnesium formate dihydrate	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
5ZJW Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor CZg353 提交 2018-03-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	9EO (3Z)-N-[(1S)-2-hydroxy-1-phenylethyl]-3-[(1H-imidazol-2-yl)(phenyl)methylidene]-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indole-5-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 BCT BICARBONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.1 M Bis-tris pH 6.5, 25% PEG 3350, 0.2 M NaCl	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
6WLX PAK4 kinase domain in complex with beta-catenin Ser675 substrate peptide 提交 2020-04-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–426（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Tris-HCl, 2M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K, 5mM peptide	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
6WLY PAK4 kinase domain in complex with LIMK1 Thr508 substrate peptide 提交 2020-04-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–426（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Tris-HCl, 2M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K, 2mM peptide	分辨率 1.90 Å R-free 0.205
7CMB Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor 41 提交 2020-07-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：PAK4 Kinase Domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	G5X 1-(2-azanylpyrimidin-4-yl)-6-[2-(1-oxidanylcyclohexyl)ethynyl]indole-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 8.5, 25% PEG3350	分辨率 2.59 Å R-free 0.251
7CP3 Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor 47 提交 2020-08-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：PAK4 Kinase Domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GC6 [(3R)-3-azanylpiperidin-1-yl]-[1-(2-azanylpyrimidin-4-yl)-6-[2-(1-oxidanylcyclohexyl)ethynyl]indol-3-yl]methanone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；291 K；0.1M Tris pH 8.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.267
7CP4 Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor 55 提交 2020-08-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：Protein kinase domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GCC [1-(2-azanylpyrimidin-4-yl)-6-[2-(1-oxidanylcyclohexyl)ethynyl]indol-3-yl]-[(3S)-3-methylpiperazin-1-yl]methanone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Bis-tris 5.5, 25% PEG 3350, 0.1M Guanidine hydrochloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.252
7S46 PAK4cat (D440N/S474E) in complex with Integrin beta5 760-770 peptide 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–426（318 aa）	突变：D440N, S474E	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5) and 0.5 M tri-sodium citrate	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
7S48 PAK4cat in complex with Integrin beta5 760-770 peptide 提交 2021-09-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–426（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5) and 0.5 M tri-sodium citrate	分辨率 1.90 Å R-free 0.222
8AHG PAC-FragmentDEL: Photoactivated covalent capture of DNA encoded fragments for hit discovery 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	突变：L310A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	M4I ~{N}-methyl-3-propan-2-yl-1~{H}-pyrazolo[3,4-c]pyridine-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.8M Na/K tartrate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 1.89 Å R-free 0.227
8AHH PAC FragmentDEL: Photoactivated covalent capture of DNA encoded fragments for hit discovery 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	突变：L310A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	M4X 5-cyano-~{N}-methyl-pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.8M Na/K tartrate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.04 Å R-free 0.250
8AHI PAC-FragmentDEL: Photoactivated covalent capture of DNA encoded fragments for hit discovery 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	突变：L310A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	M56 ~{N}-methyl-1,3-benzothiazole-6-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.8M Na/K tartrate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.249
8YHK The Crystal Structure of P21-Activated Kinases Pak4 from Biortus 提交 2024-02-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 291–591（301 aa）	未记录	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.4 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate	分辨率 3.30 Å R-free 0.319
9D52 Structure of PAK4 in complex with compound 18 提交 2024-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1A2R 2-cyano-N-[3-({6-[(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)amino]pyrazin-2-yl}amino)bicyclo[1.1.1]pentan-1-yl]acetamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 4% (v/v) PEG 8000	分辨率 2.45 Å R-free 0.287
9D53 PAK4 in complex with compound 7 提交 2024-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1A2P N~2~-{[(1s,4s)-4-aminocyclohexyl]methyl}-N~4~-(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris-Propane, pH 9.0, 10% PEG 20,000	分辨率 2.47 Å R-free 0.263

共 46 个其他 PDB 条目、61 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAK4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 14–319； UniProt 286–591

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5vee
沉积日期 deposition_date	2017-04-04
结构标题 title	PAK4 kinase domain in complex with FRAX486
关键词 keywords	Kinase, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	20.72 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.61 Å
零角强度 I(0) i0	18681700.00
分子量 molecular_weight	33209.0 kDa
排除体积 excluded_volume	41870 Å³
包络体积 envelope_volume	49814 Å³
水化壳体积 shell_volume	21108 Å³
包络直径 envelope_diameter	63.4 Å
壳层 Rg shell_rg	26.06 Å
包络 Rg envelope_rg	19.78 Å
形状 Rg shape_rg	19.62 Å
总 Rg total_rg	20.50 Å
总原子数 total_atoms	2330
残基数 n_residues	289
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	69.4 Å
Rg (实空间) rg_real	20.63 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.47 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.8680e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.7410e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.64 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	18680000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6629
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	26.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.218
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.431
角度范围 angular_range	— – 0.3850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	6715000.0000
实空间数据点数 n_real_points	70
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.818; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.387; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.000

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Serine/threonine-protein kinase PAK 4
分子量 formula_weight	36025.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2330

GARARQENGMPEKPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	6-(2,4-dichlorophenyl)-8-ethyl-2-{[3-fluoro-4-(piperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one
分子量 formula_weight	513.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d5veea_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5veeA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	5veeA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	62.955 Å
晶胞边长 b length_b	62.955 Å
晶胞边长 c length_c	183.509 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2310
R_work r_work	0.2284
R_free r_free	0.2756

fit	/app/data/saxs_computation/ve/5vee/5vee.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ve/5vee/5vee.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ve/5vee/5vee.dat