Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*TP*GP*CP*TP*TP*CP*CP*(5CM)P*GP*(5CM)P*GP*AP*AP*TP*AP*AP*CP*G)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*CP*GP*TP*TP*AP*TP*TP*(5CM)P*GP*(5CM)P*GP*GP*GP*AP*AP*GP*CP*A)-3') ; × 1 ZINC ION × 3 CHLORIDE ION × 1 L(+)-TARTARIC ACID × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | KAISO_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–134； UniProt 471–604 |
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| 条目编号 entry_id | 5vmz |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-04-28 |
| 结构标题 title | Kaiso (ZBTB33) E535Q mutant zinc finger DNA binding domain in complex with a double CpG-methylated DNA resembling the specific Kaiso binding sequence (KBS) |
| 关键词 keywords | DNA methylation, Zinc finger, Transcriptional regulator, TRANSCRIPTION-DNA complex; TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.04 Å |
| Rg（电子密度） | 18.37 Å |
| 总 Rg | 19.15 Å |
| 原子数 | 1784 |
| 残基数 | 154 |
| 排除体积 | 29310 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 5vmzA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 160 — Double Stranded RNA Binding Domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 60 — Classic Zinc Finger |
| 结构域编号 domain_id | 5vmzA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 160 — Double Stranded RNA Binding Domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 60 — Classic Zinc Finger |
| 结构域编号 domain_id | 5vmzA03 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 160 — Double Stranded RNA Binding Domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 60 — Classic Zinc Finger |