Mus musculus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ;1-{3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-1-[(3S)-oxolan-3-yl]-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one ; × 1 DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GLYCEROL × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | CBP_MOUSE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 33–148； UniProt 1083–1198 |
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| 条目编号 entry_id | 5w0i |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-05-30 |
| 结构标题 title | CREBBP Bromodomain in complex with Cpd8 (1-(3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-1-(tetrahydrofuran-3-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) |
| 关键词 keywords | CREBBP, Bromodomain, small molecule inhibitor, TRANSFERASE-INHIBITOR complex; TRANSFERASE/INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.67 Å |
| Rg（电子密度） | 14.59 Å |
| 总 Rg | 15.79 Å |
| 原子数 | 1007 |
| 残基数 | 114 |
| 排除体积 | 18107 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5w0ia_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.29 — Bromodomain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.29.2 — Bromodomain |
| 家族 Family family | a.29.2.1 — Bromodomain |
| 结构域编号 domain_id | 5w0iA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 920 — Histone Acetyltransferase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Bromodomain-like |