Influenza A virus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | MANGANESE (II) ION × 2 ;2-[(2S)-1-(3,5-dichloropyridine-4-carbonyl)pyrrolidin-2-yl]-N-(2,3-dihydro-1H-inden-2-yl)-5-hydroxy-6-oxo-1,6-dihydropy rimidine-4-carboxamide ; × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | C3W5S0_I09A0 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 21–70； UniProt 1–50 作者链 A； PDB构建体 74–197； UniProt 73–196 |
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| 条目编号 entry_id | 5w7u |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-06-20 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the influenza virus PA endonuclease in complex with inhibitor 8f (SRI-29928) |
| 关键词 keywords | Virus, Nuclease, Transcription, Cap-snatching, HYDROLASE, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.07 Å |
| Rg（电子密度） | 15.89 Å |
| 总 Rg | 16.81 Å |
| 原子数 | 1436 |
| 残基数 | 178 |
| 排除体积 | 25273 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5w7ua1 |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.52 — Restriction endonuclease-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.52.1 — Restriction endonuclease-like |
| 家族 Family family | c.52.1.34 — PA N-terminal domain |
| 结构域编号 domain_id | d5w7ua2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 5w7uA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 91 — Restriction Endonuclease |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 90 — Influenza RNA-dependent RNA polymerase subunit PA, endonuclease domain |