Streptomyces avidinii
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 4 | [N-(2-{bis[2-(pyridin-2-yl-kappaN)ethyl]amino-kappaN}ethyl)-5-(2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide]copper × 4 COPPER (II) ION × 4 GLYCEROL × 4 SULFATE ION × 4 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SAV_STRAV |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 14–159； UniProt 38–183 |
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| 条目编号 entry_id | 5wbb |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-06-28 |
| 结构标题 title | Peroxide Activation Regulated by Hydrogen Bonds within Artificial Cu Proteins - S112A |
| 关键词 keywords | ;streptavidin, biotin, copper, hydroperoxo, secondary coordination sphere, hydrogen bond, biotin binding protein, METAL BINDING PROTEIN ;; METAL BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 22.99 Å |
| Rg（电子密度） | 21.79 Å |
| 总 Rg | 22.80 Å |
| 原子数 | 3932 |
| 残基数 | 500 |
| 排除体积 | 68631 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5wbba1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.61 — Streptavidin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.61.1 — Avidin/streptavidin |
| 家族 Family family | b.61.1.1 — Avidin/streptavidin |
| 结构域编号 domain_id | d5wbba2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 5wbbA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 128 — Lipocalin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 30 — Avidin-like |