SAXSdb — 5we0

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protection of telomeres protein poz1

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein tpz1 × 1 （O14246） DNA-binding protein rap1 × 1 （Q96TL7） ZINC ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein tpz1 × 1 （O14246） DNA-binding protein rap1 × 1 （Q96TL7） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein tpz1 × 1 （O14246） DNA-binding protein rap1 × 1 （Q96TL7） ZINC ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein tpz1 × 1 （O14246） DNA-binding protein rap1 × 1 （Q96TL7） ZINC ION × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POZ1_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–249； UniProt 2–249 作者链 D； PDB构建体 2–249； UniProt 2–249 作者链 G； PDB构建体 2–249； UniProt 2–249 作者链 J； PDB构建体 2–249； UniProt 2–249

Protection of telomeres protein tpz1

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt O14246

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein poz1 × 1 （O13852） DNA-binding protein rap1 × 1 （Q96TL7） ZINC ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein poz1 × 1 （O13852） DNA-binding protein rap1 × 1 （Q96TL7） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein poz1 × 1 （O13852） DNA-binding protein rap1 × 1 （Q96TL7） ZINC ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein poz1 × 1 （O13852） DNA-binding protein rap1 × 1 （Q96TL7） ZINC ION × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TPZ1_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–33； UniProt 476–508 作者链 E； PDB构建体 1–33； UniProt 476–508 作者链 H； PDB构建体 1–33； UniProt 476–508 作者链 K； PDB构建体 1–33； UniProt 476–508

DNA-binding protein rap1

Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)

UniProt Q96TL7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein poz1 × 1 （O13852） Protection of telomeres protein tpz1 × 1 （O14246） ZINC ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein poz1 × 1 （O13852） Protection of telomeres protein tpz1 × 1 （O14246） ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein poz1 × 1 （O13852） Protection of telomeres protein tpz1 × 1 （O14246） ZINC ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Protection of telomeres protein poz1 × 1 （O13852） Protection of telomeres protein tpz1 × 1 （O14246） ZINC ION × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RAP1_SCHPO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–30； UniProt 467–496 作者链 F； PDB构建体 1–30； UniProt 467–496 作者链 I； PDB构建体 1–30； UniProt 467–496 作者链 L； PDB构建体 1–30； UniProt 467–496

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5we0
沉积日期 deposition_date	2017-07-06
结构标题 title	Structural Basis for Shelterin Bridge Assembly
关键词 keywords	Telomere, Shelterin, Cooperativity, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5we0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5we0__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5we0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.90 Å
Rg（电子密度）	19.82 Å
总 Rg	20.90 Å
原子数	2236
残基数	266
排除体积	40045 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5we0__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5we0__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`5we0__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`5we0__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protection of telomeres protein poz1
分子量 formula_weight	29695.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D,G,J
原子数 atom_count	9184

SNEKIRSQSVLNTLETFFIKENHYDMQREESSIVNACLRYLGYSKSMCHEKMPIFMDIAFIEYCFNLSLDPSSFQNLPITQTQPDSQQILWEYSLISNALERLENIELERQNCMREDGLSKYTNSLLLNKETLNNEALKLYSCAKAGICRWMAFHFLEQEPIDHINFTKFLQDWGSHNEKEMEALQRLSKHKIRKRLIYVSQHKKKMPWSKFNSVLSRYIQCTKLQLEVFCDYDFKQREIVKMLTSNIN

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protection of telomeres protein tpz1
分子量 formula_weight	3964.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E,H,K

SEACEMCRLGLPHGSFFELLRDWKKIEEFRNKS

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-binding protein rap1
分子量 formula_weight	3343.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F,I,L

SDNIFVKPGEDLEIPLLSDYSDSENISEKS

来源 Source

来源生物 organism	Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
通用名 common_name	Fission yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	284812
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	317

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晶胞边长 a length_a	56.720 Å
晶胞边长 b length_b	82.010 Å
晶胞边长 c length_c	103.510 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	89.99 °
晶胞夹角 β angle_beta	89.98 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	73.96 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.300 Å
最低分辨率 resolution_low	62.705 Å
R 因子 r_factor	0.1994
R_work r_work	0.1986
R_free r_free	0.2279

Structural Basis for Shelterin Bridge Assembly

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protection of telomeres protein poz1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protection of telomeres protein tpz1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

DNA-binding protein rap1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5we0__assembly_1__model_1

5we0__assembly_1__model_1 | I(q)

5we0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 引用文献 (1)

Structural Basis for Shelterin Bridge Assembly

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protection of telomeres protein poz1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protection of telomeres protein tpz1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-binding protein rap1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5we0__assembly_1__model_1

5we0__assembly_1__model_1 | I(q)

5we0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 引用文献 (1)