Mycobacterium smegmatis str. MC2 155
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 12 | FE (III) ION × 12 FE (II) ION × 18 MAGNESIUM ION × 6 CHLORIDE ION × 6 water × 12 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | A0QXB7_MYCS2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 B； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 C； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 作者链 D； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161 |
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| 条目编号 entry_id | 5ww3 |
| 沉积日期 deposition_date | 2016-12-31 |
| 结构标题 title | Crystal structure of the second DNA-Binding protein under starvation from Mycobacterium smegmatis soaked with iron in the ratio of 24 iron atoms per dodecamer |
| 关键词 keywords | ferritin-like fold, DNA binding, ferroxidation, OXIDOREDUCTASE, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 36.69 Å |
| Rg（电子密度） | 35.49 Å |
| 总 Rg | 36.03 Å |
| 原子数 | 14970 |
| 残基数 | 1926 |
| 排除体积 | 262670 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d5ww3a_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.25 — Ferritin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.25.1 — Ferritin-like |
| 家族 Family family | a.25.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5ww3b_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.25 — Ferritin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.25.1 — Ferritin-like |
| 家族 Family family | a.25.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5ww3c_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.25 — Ferritin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.25.1 — Ferritin-like |
| 家族 Family family | a.25.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d5ww3d_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.25 — Ferritin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.25.1 — Ferritin-like |
| 家族 Family family | a.25.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 5ww3A01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1260 — Ferritin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle |
| 结构域编号 domain_id | 5ww3B01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1260 — Ferritin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle |
| 结构域编号 domain_id | 5ww3C01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1260 — Ferritin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle |
| 结构域编号 domain_id | 5ww3D01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1260 — Ferritin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ferritin, core subunit, four-helix bundle |