Escherichia coli O157:H7
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 8 | DnaA regulatory inactivator Hda × 4 （P69933） GLYCEROL × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 8 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | DPO3B_ECO57 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 21–386； UniProt 1–366 作者链 B； PDB构建体 21–386； UniProt 1–366 作者链 C； PDB构建体 21–386； UniProt 1–366 作者链 D； PDB构建体 21–386； UniProt 1–366 |
Escherichia coli O157:H7
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 8 | DNA polymerase III subunit beta × 4 （P0A990） GLYCEROL × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MAGNESIUM ION × 4 water × 8 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | HDA_ECO57 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 E； PDB构建体 21–253； UniProt 1–233 作者链 F； PDB构建体 21–253； UniProt 1–233 作者链 G； PDB构建体 21–253； UniProt 1–233 作者链 H； PDB构建体 21–253； UniProt 1–233 |
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| 条目编号 entry_id | 5x06 |
| 沉积日期 deposition_date | 2017-01-20 |
| 结构标题 title | DNA replication regulation protein |
| 关键词 keywords | DNA replication, RIDA, REPLICATION; REPLICATION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 51.83 Å |
| Rg（电子密度） | 51.19 Å |
| 总 Rg | 51.47 Å |
| 原子数 | 18234 |
| 残基数 | 2300 |
| 排除体积 | 324640 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 5x06A01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06A02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06A03 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06B01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06B02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06B03 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06C01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06C02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06C03 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06D01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06D02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 5x06D03 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 150 — DNA Polymerase III; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — DNA Polymerase III, subunit A, domain 2 |