SAXSdb — 6a5e

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Receptor-like protein kinase FERONIA

Arabidopsis thaliana

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 2	GPI-anchored protein LLG2 × 1 （Q6NLF4） RALF23 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 2	GPI-anchored protein LLG2 × 1 （Q6NLF4） RALF23 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FERON_ARATH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–396； UniProt 28–423 作者链 B； PDB构建体 1–396； UniProt 28–423

GPI-anchored protein LLG2

Arabidopsis thaliana

UniProt Q6NLF4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 2	Receptor-like protein kinase FERONIA × 1 （Q9SCZ4） RALF23 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 3 其他聚合物 2	Receptor-like protein kinase FERONIA × 1 （Q9SCZ4） RALF23 × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LLG2_ARATH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–84； UniProt 42–125 作者链 D； PDB构建体 1–84； UniProt 42–125

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6a5e
沉积日期 deposition_date	2018-06-23
结构标题 title	Crystal structure of plant peptide RALF23 in complex with FER and LLG2
关键词 keywords	a plant receptor-ligand complex FLR, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6a5e__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6a5e__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6a5e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.66 Å
Rg（电子密度）	24.78 Å
总 Rg	25.68 Å
原子数	3782
残基数	474
排除体积	67107 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6a5e__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6a5e__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Receptor-like protein kinase FERONIA
分子量 formula_weight	43363.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	7564

ADYSPTEKILLNCGGGASNLTDTDNRIWISDVKSKFLSSSSEDSKTSPALTQDPSVPEVPYMTARVFRSPFTYTFPVASGRKFVRLYFYPNSYDGLNATNSLFSVSFGPYTLLKNFSASQTAEALTYAFIIKEFVVNVEGGTLNMTFTPESAPSNAYAFVNGIEVTSMPDMYSSTDGTLTMVGSSGSVTIDNSTALENVYRLNVGGNDISPSADTGLYRSWYDDQPYIFGAGLGIPETADPNMTIKYPTGTPTYVAPVDVYSTARSMGPTAQINLNYNLTWIFSIDSGFTYLVRLHFCEVSSNITKINQRVFTIYLNNQTAEPEADVIAWTSSNGVPFHKDYVVNPPEGNGQQDLWLALHPNPVNKPEYYDSLLNGVEIFKMNTSDGNLAGTNPIP

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	Mouse-ear cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Insect cell expression vector pTIE1

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	GPI-anchored protein LLG2
分子量 formula_weight	9370.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

TTCKEDFANKNYTIITSRCKGPNYPANVCCSAFKDFACPFAEVLNDEKNDCASTMFSYINLYGRYPPGIFANMCKEGKEGLDCT

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis thaliana
通用名 common_name	Mouse-ear cress
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3702
宿主生物 host_organism	Insect cell expression vector pTIE1

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	RALF23
分子量 formula_weight	1786.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

RYISYGALRRNTIPC

来源 Source

来源生物 organism	Arabidopsis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3701
宿主生物 host_organism	Insect cell expression vector pTIE1

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

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晶胞边长 a length_a	62.312 Å
晶胞边长 b length_b	62.360 Å
晶胞边长 c length_c	97.478 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	105.72 °
晶胞夹角 β angle_beta	91.30 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	108.48 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.766 Å
最低分辨率 resolution_low	42.607 Å
R 因子 r_factor	0.2351
R_work r_work	0.2325
R_free r_free	0.2846

Crystal structure of plant peptide RALF23 in complex with FER and LLG2

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Receptor-like protein kinase FERONIA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

GPI-anchored protein LLG2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6a5e__assembly_1__model_1

6a5e__assembly_1__model_1 | I(q)

6a5e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of plant peptide RALF23 in complex with FER and LLG2

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Receptor-like protein kinase FERONIA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

GPI-anchored protein LLG2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6a5e__assembly_1__model_1

6a5e__assembly_1__model_1 | I(q)

6a5e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)