SAXSdb — 6aj0

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Viral protein 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 240	Virion protein 2 × 60 （A0A0A7X639） Capsid protein VP3 × 60 Capsid protein VP4 × 60 （E7FM39）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Virion protein 2 × 1 （A0A0A7X639） Capsid protein VP3 × 1 Capsid protein VP4 × 1 （E7FM39）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Virion protein 2 × 5 （A0A0A7X639） Capsid protein VP3 × 5 Capsid protein VP4 × 5 （E7FM39）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Virion protein 2 × 6 （A0A0A7X639） Capsid protein VP3 × 6 Capsid protein VP4 × 6 （E7FM39）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Virion protein 2 × 1 （A0A0A7X639） Capsid protein VP3 × 1 Capsid protein VP4 × 1 （E7FM39）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A097F8Q2_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–295； UniProt 565–859

Virion protein 2

物种未注明

UniProt A0A0A7X639

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 240	Viral protein 1 × 60 （A0A097F8Q2） Capsid protein VP3 × 60 Capsid protein VP4 × 60 （E7FM39）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Viral protein 1 × 1 （A0A097F8Q2） Capsid protein VP3 × 1 Capsid protein VP4 × 1 （E7FM39）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Viral protein 1 × 5 （A0A097F8Q2） Capsid protein VP3 × 5 Capsid protein VP4 × 5 （E7FM39）	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Viral protein 1 × 6 （A0A097F8Q2） Capsid protein VP3 × 6 Capsid protein VP4 × 6 （E7FM39）	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Viral protein 1 × 1 （A0A097F8Q2） Capsid protein VP3 × 1 Capsid protein VP4 × 1 （E7FM39）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0A7X639_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–248； UniProt 70–317

Capsid protein VP4

物种未注明

UniProt E7FM39

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 240	Viral protein 1 × 60 （A0A097F8Q2） Virion protein 2 × 60 （A0A0A7X639） Capsid protein VP3 × 60	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Viral protein 1 × 1 （A0A097F8Q2） Virion protein 2 × 1 （A0A0A7X639） Capsid protein VP3 × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Viral protein 1 × 5 （A0A097F8Q2） Virion protein 2 × 5 （A0A0A7X639） Capsid protein VP3 × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	Viral protein 1 × 6 （A0A097F8Q2） Virion protein 2 × 6 （A0A0A7X639） Capsid protein VP3 × 6	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Viral protein 1 × 1 （A0A097F8Q2） Virion protein 2 × 1 （A0A0A7X639） Capsid protein VP3 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E7FM39_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–69； UniProt 5–73

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6aj0
沉积日期 deposition_date	2018-08-25
结构标题 title	The structure of Enterovirus D68 mature virion
关键词 keywords	Enterovirus D68, mature virion, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6aj0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6aj0__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6aj0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	136.20 Å
总 Rg	136.30 Å
原子数	369780
残基数	47340
排除体积	6574600 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6aj0__assembly_1__model_1`	240-meric （240）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6aj0__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3	1	`6aj0__assembly_3__model_1`	eicosameric （20）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4	1	`6aj0__assembly_4__model_1`	24-meric （24）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5	1	`6aj0__assembly_5__model_1`	tetrameric （4）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Viral protein 1
分子量 formula_weight	32673.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6163

IESIIKTATDTVKSEINAELGVVPSLNAVETGATSNTEPEEAIQTRTVINQHGVSETLVENFLSRAALVSKRSFEYKDHTSSAAQADKNFFKWTINTRSFVQLRRKLELFTYLRFDAEITILTTVAVNGSGNNTYVGLPDLTLQAMFVPTGALTPEKQDSFHWQSGSNASVFFKISDPPARITIPFMCINSAYSVFYDGFAGFEKNGLYGINPADTIGNLCVRIVNEHQPVGFTVTVRVYMKPKHIKAWAPRPPRTLPYMSIANANYKGKERAPNALNAIIGNRDSVKTMPHNIV

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Virion protein 2
分子量 formula_weight	27567.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SPSAEACGYSDRVLQLKLGNSAIVTQEAANYCCAYGEWPNYLPDHEAVAIDKPTQPETATDRFYTLKSVKWETGSTGWWWKLPDALNNIGMFGQNVQHHYLYRSGFLIHVQCNATKFHQGALLVVAIPEHQRGAHNTNTSPGFDDIMKGEEGGTFNHPYVLDDGTSLACATIFPHQWINLRTNNSATIVLPWMNAAPMDFPLRHNQWTLAIIPVVPLGTRTTSSMVPITVSIAPMCCEFNGLRHAITQ

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Capsid protein VP3
分子量 formula_weight	27142.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GVPTYLLPGSGQFLTTDDHSSAPALPCFNPTPEMHIPGQVRNMLEVVQVESMMEINNTESAVGMERLKVDISALTDVDQLLFNIPLDIQLDGPLRNTLVGNISRYYTHWSGSLEMTFMFCGSFMATGKLILCYTPPGGSCPTTRETAMLGTHIVWDFGLQSSVTLIIPWISGSHYRMFNNDAKSTNANVGYVTCFMQTNLIVPSESSDTCSLIGFIAAKDDFSLRLMRDSPDIGQLDHLHAAEAAYQ

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Capsid protein VP4
分子量 formula_weight	7468.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MGAQVTRQQTGTHENANIATNGSHITYNQINFYKDSYAASASKQDFSQDPSKFTEPVVEGLKAGAPVLK

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	6aj0A00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	6aj0B00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	6aj0C00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	11938

The structure of Enterovirus D68 mature virion

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Viral protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Virion protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Capsid protein VP4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6aj0__assembly_1__model_1

6aj0__assembly_1__model_1 | I(q)

6aj0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

The structure of Enterovirus D68 mature virion

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Viral protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Virion protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Capsid protein VP4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6aj0__assembly_1__model_1

6aj0__assembly_1__model_1 | I(q)

6aj0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)