SAXSdb — 6bo8

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 41–765 链 B； UniProt 41–765 链 C； UniProt 41–765 链 D； UniProt 41–765	未记录	无其他共同聚合物	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8；TRIS, NaCl, cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6BO8	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
12AG Spermine-blocked open-state cryo-EM structure of human TRPV6 channel in cNW30 nanodiscs 提交 2026-03-23	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 67–678（612 aa）链 B 67–678（612 aa）链 C 67–678（612 aa）链 D 67–678（612 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.48 Å
6BO9 Cryo-EM structure of human TRPV6 in amphipols 提交 2017-11-18	结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–765（725 aa）链 B 41–765（725 aa）链 C 41–765（725 aa）链 D 41–765（725 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；TRIS, NaCl, cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6BOA Cryo-EM structure of human TRPV6-R470E in amphipols 提交 2017-11-18	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–765（725 aa）链 B 41–765（725 aa）链 C 41–765（725 aa）链 D 41–765（725 aa）	突变：R470E 突变：R470E 突变：R470E 突变：R470E	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；TRIS, NaCl, cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6D7S Cryo-EM structure of human TRPV6-Y467A in amphipols 提交 2018-04-25	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–765（725 aa）链 B 41–765（725 aa）链 C 41–765（725 aa）链 D 41–765（725 aa）	突变：Y467A 突变：Y467A 突变：Y467A 突变：Y467A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.34 Å
6D7T Cryo-EM structure of human TRPV6-Y467A in complex with 2-Aminoethoxydiphenyl borate (2-APB) 提交 2018-04-25	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–765（725 aa）链 B 41–765（725 aa）链 C 41–765（725 aa）链 D 41–765（725 aa）	突变：Y467A 突变：Y467A 突变：Y467A 突变：Y467A	FZ4 2-aminoethyl diphenylborinate × 4 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.44 Å
6E2F Cryo-EM structure of human TRPV6 in complex with Calmodulin 提交 2018-07-11	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 41–765（725 aa）链 B 41–765（725 aa）链 C 41–765（725 aa）链 D 41–765（725 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
7K4A Cryo-EM structure of human TRPV6 in the open state 提交 2020-09-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–707（667 aa）链 B 41–707（667 aa）链 C 41–707（667 aa）链 D 41–707（667 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 52 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.26 Å
7K4B Cryo-EM structure of human TRPV6 in complex with (4- phenylcyclohexyl)piperazine inhibitor cis-22a 提交 2020-09-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–707（667 aa）链 B 41–707（667 aa）链 C 41–707（667 aa）链 D 41–707（667 aa）	未记录	VUG 1-[cis-4-(3-methylphenyl)cyclohexyl]-4-(pyridin-3-yl)piperazine × 5 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 8 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 48 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7K4C Cryo-EM structure of human TRPV6 in complex with (4- phenylcyclohexyl)piperazine inhibitor Br-cis-22a 提交 2020-09-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–707（667 aa）链 B 41–707（667 aa）链 C 41–707（667 aa）链 D 41–707（667 aa）	未记录	81F 1-(5-bromopyridin-3-yl)-4-[cis-4-(3-methylphenyl)cyclohexyl]piperazine × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.78 Å
7K4D Cryo-EM structure of human TRPV6 in complex with (4- phenylcyclohexyl)piperazine inhibitor 3OG 提交 2020-09-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–707（667 aa）链 B 41–707（667 aa）链 C 41–707（667 aa）链 D 41–707（667 aa）	未记录	VUM 5-[(4-{trans-4-hydroxy-4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]cyclohexyl}piperazin-1-yl)methyl]pyridin-2(1H)-one × 5 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
7K4E Cryo-EM structure of human TRPV6 in complex with (4- phenylcyclohexyl)piperazine inhibitor 30 提交 2020-09-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–707（667 aa）链 B 41–707（667 aa）链 C 41–707（667 aa）链 D 41–707（667 aa）	未记录	VUJ 5-({4-[(1R,4S)-3'-methyl[1,2,3,4-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)pyridin-2(1H)-one × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.34 Å
7K4F Cryo-EM structure of human TRPV6 in complex with (4- phenylcyclohexyl)piperazine inhibitor 31 提交 2020-09-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–707（667 aa）链 B 41–707（667 aa）链 C 41–707（667 aa）链 D 41–707（667 aa）	未记录	5GK 5-[(4-{cis-4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]cyclohexyl}piperazin-1-yl)methyl]pyridin-2(1H)-one × 5 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.75 Å
7S88 Open apo-state cryo-EM structure of human TRPV6 in glyco-diosgenin detergent 提交 2021-09-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–707（667 aa）链 B 41–707（667 aa）链 C 41–707（667 aa）链 D 41–707（667 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 20 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 32 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.69 Å
7S89 Open apo-state cryo-EM structure of human TRPV6 in cNW11 nanodiscs 提交 2021-09-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–707（667 aa）链 B 41–707（667 aa）链 C 41–707（667 aa）链 D 41–707（667 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 28 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 4 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.54 Å
7S8B Cryo-EM structure of human TRPV6 in complex with channel blocker ruthenium red 提交 2021-09-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–707（667 aa）链 B 41–707（667 aa）链 C 41–707（667 aa）链 D 41–707（667 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 28 CA CALCIUM ION × 1 R2R ruthenium(6+) azanide pentaamino(oxido)ruthenium (1/4/2) × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.43 Å
7S8C Cryo-EM structure of human TRPV6 in complex with inhibitor econazole 提交 2021-09-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–707（667 aa）链 B 41–707（667 aa）链 C 41–707（667 aa）链 D 41–707（667 aa）	未记录	ECL 1-[(2R)-2-[(4-chlorobenzyl)oxy]-2-(2,4-dichlorophenyl)ethyl]-1H-imidazole × 4 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 16 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
8FOA Cryo-EM structure of human TRPV6 in complex with the natural phytoestrogen genistein 提交 2022-12-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–765（725 aa）链 B 41–765（725 aa）链 C 41–765（725 aa）链 D 41–765（725 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 36 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 GEN GENISTEIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.66 Å
8FOB Cryo-EM structure of human TRPV6 in the open state 提交 2022-12-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–765（725 aa）链 B 41–765（725 aa）链 C 41–765（725 aa）链 D 41–765（725 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 28 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.71 Å
8SP8 Human TRP channel TRPV6 in cNW30 nanodiscs inhibited by tetrahydrocannabivarin (THCV) 提交 2023-05-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 41–706（666 aa）链 B 41–706（666 aa）链 C 41–706（666 aa）链 D 41–706（666 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 28 I8E Tetrahydrocannabivarin × 8 CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.79 Å
9CUH Structure of human full-length ancestral TRPV6 channel in apo open state 提交 2024-07-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–765（765 aa）链 B 1–765（765 aa）链 C 1–765（765 aa）链 D 1–765（765 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 32 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.03 Å
9CUI Structure of human full-length ancestral TRPV6 channel in Calmodulin-bound state 提交 2024-07-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–765（765 aa）链 B 1–765（765 aa）链 C 1–765（765 aa）链 D 1–765（765 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 8 CLR CHOLESTEROL × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 43 CA CALCIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
9CUJ Structure of human full-length derived TRPV6 channel in apo open state 提交 2024-07-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–765（765 aa）链 B 1–765（765 aa）链 C 1–765（765 aa）链 D 1–765（765 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 32 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 20 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
9CUK Structure of human full-length derived TRPV6 channel in Calmodulin-bound state 提交 2024-07-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–765（765 aa）链 B 1–765（765 aa）链 C 1–765（765 aa）链 D 1–765（765 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 8 CLR CHOLESTEROL × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 43 CA CALCIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.26 Å
9NQ9 Magnesium ions-bound closed-state cryo-EM structure of human TRPV6 in cNW11 nanodiscs 提交 2025-03-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 67–678（612 aa）链 B 67–678（612 aa）链 C 67–678（612 aa）链 D 67–678（612 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 12 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 16 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRPV6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–725； UniProt 41–765 作者链 B； PDB构建体 1–725； UniProt 41–765 作者链 C； PDB构建体 1–725； UniProt 41–765 作者链 D； PDB构建体 1–725； UniProt 41–765

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6bo8
沉积日期 deposition_date	2017-11-18
结构标题 title	Cryo-EM structure of human TRPV6 in nanodiscs
关键词 keywords	Ion channel, Membrane protein, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	47.84 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	46.73 Å
零角强度 I(0) i0	985518000.00
分子量 molecular_weight	271200.0 kDa
排除体积 excluded_volume	343730 Å³
包络体积 envelope_volume	494830 Å³
水化壳体积 shell_volume	85428 Å³
包络直径 envelope_diameter	150.2 Å
壳层 Rg shell_rg	54.19 Å
包络 Rg envelope_rg	45.36 Å
形状 Rg shape_rg	46.72 Å
总 Rg total_rg	47.05 Å
总原子数 total_atoms	19048
残基数 n_residues	2372
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	144.7 Å
Rg (实空间) rg_real	47.41 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.96 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.8550e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.6290e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	47.84 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	986000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8244
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	65.8 Å
偏度 Skewness skewness	-0.056
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.587
角度范围 angular_range	— – 0.1650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	50770000.0000
实空间数据点数 n_real_points	34
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.918; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.958; Smooth: 0.000

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	46124

描述 description	Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6
分子量 formula_weight	85169.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	19048

Cryo-EM structure of human TRPV6 in nanodiscs

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transient receptor potential cation channel subfamily V member 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

fit	/app/data/saxs_computation/bo/6bo8/6bo8.fit
pddf	/app/data/pr_computation/bo/6bo8/6bo8.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/bo/6bo8/6bo8.dat