SAXSdb — 6c79

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactamase Toho-1

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 32–291	片段：residues 32-291	CE3 (6R,7R)-3-(acetyloxymethyl)-7-[[(2Z)-2-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)-2-methoxyimino-ethanoyl]amino]-8-oxo-5-thia-1-azabicy clo[4.2.0]oct-2-ene-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：BATCH MODE；pH 6.1；293 K；10 mg/ml protein in a solution containing 2.0 M ammonium sulfate and 0.1 M sodium citrate (pH 6.1)	分辨率 1.10 Å R-free 0.164

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6C79	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BZA BETA-LACTAMASE TOHO-1 FROM ESCHERICHIA COLI TUH12191 提交 1998-10-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 33–290（258 aa）	突变：E166A	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；pH 4.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.217
1IYO Toho-1 beta-Lactamase In Complex With Cefotaxime 提交 2002-09-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：E166A	SO4 SULFATE ION × 3 CEF CEFOTAXIME, C3' cleaved, open, bound form × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 1.80 Å R-free 0.206
1IYP Toho-1 beta-Lactamase In Complex With Cephalothin 提交 2002-09-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：E166A	SO4 SULFATE ION × 3 CEP CEPHALOTHIN GROUP × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
1IYQ Toho-1 beta-Lactamase In Complex With Benzylpenicillin 提交 2002-09-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：E166A	SO4 SULFATE ION × 3 PNM OPEN FORM - PENICILLIN G × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 2.10 Å R-free 0.227
1IYS Crystal Structure of Class A beta-Lactamase Toho-1 提交 2002-09-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–291（261 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate, acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.65 Å R-free 0.197
1WE4 Crystal Structure of Class A beta-Lactamase Toho-1 G238C mutant 提交 2004-05-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：A26M, G238C	SO4 SULFATE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；Ammonium sulfate, sodium acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.222
2WYX Neutron structure of a class A Beta-lactamase Toho-1 E166A R274N R276N triple mutant 提交 2009-11-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 33–288（256 aa）片段：RESIDUES 33-288	突变：YES	未记录非水小分子	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.258
2XQZ Neutron structure of the perdeuterated Toho-1 R274N R276N double mutant beta-lactamase 提交 2010-09-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 32–291（260 aa）片段：RESIDUES 32-291	突变：YES	未记录非水小分子	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.259
2XR0 Room temperature X-ray structure of the perdeuterated Toho-1 R274N R276N double mutant beta-lactamase 提交 2010-09-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 32–291（260 aa）片段：RESIDUES 32-291	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 A AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM CITRATE, PD 5.1. PREPARED IN 99.9% D2O AND MIXED 1:1 WITH PERDEUTERATED PROTEIN PREPARED IN 20 MM NA MES AT PD 6.1 (PH 6.5).	分辨率 2.20 Å R-free 0.173
2ZQ7 Apo structure of Class A beta-lactamase Toho-1 E166A/R274N/R276N triple mutant 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：E166A, R274N, R276N	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.95-2.10M Ammonium sulfate, 0.2M sodium citrate, pH5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 0.94 Å R-free 0.147
2ZQ8 Apo structure of class a beta-lactamase Toho-1 R274N/R276N double mutant 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：R274N, R276N	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.95-2.10M ammonium sulfate, 0.2M sodium citrate, PH5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.03 Å R-free 0.148
2ZQ9 Cephalothin acyl-intermediate structure of class a beta-lactamase Toho-1 E166A/R274N/R276N triple mutant 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：E166A, R274N, R276N	SO4 SULFATE ION × 2 CEO 5-METHYLENE-2-[2-OXO-1-(2-THIOPHEN-2-YL-ACETYLAMINO)-ETHYL]-5,6-DIHYDRO-2H-[1,3]THIAZINE-4-CARBOXYLIC ACID × 1 CLS CEPHALOTHIN × 1 SPA THIOPHENEACETIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.95-2.10M ammonium sulfate, 0.2M sodium citrate, PH5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.07 Å R-free 0.146
2ZQA Cefotaxime acyl-intermediate structure of class a beta-lacta Toho-1 E166A/R274N/R276N triple mutant 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：E166A, R274N, R276N	CEF CEFOTAXIME, C3' cleaved, open, bound form × 1 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.95-2.10M ammonium sulfate, 0.2M sodium citrate, PH5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 0.95 Å R-free 0.145
2ZQC Aztreonam acyl-intermediate structure of class a beta-lactam Toho-1 E166A/R274N/R276N triple mutant 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：E166A, R274N, R276N	SO4 SULFATE ION × 4 AZR 2-({[(1Z)-1-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)-2-oxo-2-{[(2S,3S)-1-oxo-3-(sulfoamino)butan-2-yl]amino}ethylidene]amino}oxy)-2-methylpropanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.95-2.10M ammonium sulfate, 0.2M sodium citrate, PH5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.07 Å R-free 0.146
2ZQD Ceftazidime acyl-intermediate structure of class a beta-lact Toho-1 E166A/R274N/R276N triple mutant 提交 2008-08-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：E166A, R274N, R276N	SO4 SULFATE ION × 4 CAZ ACYLATED CEFTAZIDIME × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.95-2.10M Ammonium sulfate, 0.2M sodium citrate, PH5.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.19 Å R-free 0.159
4BD0 X-ray structure of a perdeuterated Toho-1 R274N R276N double mutant Beta-lactamase in complex with a fully deuterated boronic acid (BZB) 提交 2012-10-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–291（261 aa）片段：RESIDUES 32-291	突变：YES	BZB BENZO[B]THIOPHENE-2-BORONIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 293 K；2.0 M AMMONIUM SULFATE AND 0.1 M SODIUM CITRATE PD 5.1 PREPARED IN 99.9 PERCENT D2O AT 20 C	分辨率 1.21 Å R-free 0.133
4BD1 Neutron structure of a perdeuterated Toho-1 R274N R276N double mutant Beta-lactamase in complex with a fully deuterated boronic acid (BZB) 提交 2012-10-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–291（261 aa）	突变：YES	BZB BENZO[B]THIOPHENE-2-BORONIC ACID × 1	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PH 6.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.257
4C3Q Neutron structure of a perdeuterated Toho-1 R274N R276N double mutant Beta-lactamase in complex with a fully deuterated boronic acid (BZB) at 100K 提交 2013-08-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–291（261 aa）	突变：YES	BZB BENZO[B]THIOPHENE-2-BORONIC ACID × 1	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；PH 5.6	分辨率 2.20 Å R-free 0.240
4X69 Crystal structure of OP0595 complexed with CTX-M-44 提交 2014-12-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	未记录	OP0 (2S,5R)-N-(2-aminoethoxy)-1-formyl-5-[(sulfooxy)amino]piperidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；PEG 6000	分辨率 1.42 Å R-free 0.208
4X69 Crystal structure of OP0595 complexed with CTX-M-44 提交 2014-12-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 30–291（262 aa）	未记录	OP0 (2S,5R)-N-(2-aminoethoxy)-1-formyl-5-[(sulfooxy)amino]piperidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；PEG 6000	分辨率 1.42 Å R-free 0.208
5A91 15K X-ray ligand free: Exploring the Mechanism of beta-Lactam Ring Protonation in the Class A beta-lactamase Acylation Mechanism Using Neutron and X-ray Crystallography 提交 2015-07-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 30–291（262 aa）	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 293 K；300 ul of a 10 mg/ml protein concentration in a solution containing 2.0 M ammonium sulfate and 0.1 M sodium citrate (pH 6.1) prepared in D 2 O.	分辨率 1.20 Å R-free 0.150
5KMW TOHO1 Beta lactamase mutant E166A/R274N/R276N -benzyl penicillin complex 提交 2016-06-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 33–288（256 aa）	突变：E165A, R271N, R273N	SO4 SULFATE ION × 5 PNM OPEN FORM - PENICILLIN G × 1 PNN PENICILLIN G × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 6.1；293.15 K；30 microliters of 10 mg/ml protein concentration was added to a solution containing 2.0 M ammonium sulfate and 0.1 M sodium citrate (pH 6.1). For ligand soaking, crystals were placed for 2-3 h in a reservoir solution containing 2.7 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate (pH 6.1), and 5.0 mM benzyl penicillin. The crystals were then placed momentarily in a reservoir solution containing a cryoprotectant (30% w/v trehalose) and subsequently flash-frozen in liquid nitrogen	分辨率 1.10 Å R-free 0.170
5KSC E166A/R274N/R276N Toho-1 Beta-lactamase aztreonam acyl-enzyme intermediate 提交 2016-07-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–291（261 aa）	突变：E169A, R275N, R277N	AZR 2-({[(1Z)-1-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)-2-oxo-2-{[(2S,3S)-1-oxo-3-(sulfoamino)butan-2-yl]amino}ethylidene]amino}oxy)-2-methylpropanoic acid × 1	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 6.1；293.15 K；300 microliters of a 10 mg/ml protein concentration in a solution containing 2.0 M ammonium sulfate and 0.1 M sodium citrate (pH 6.1) prepared in D2O.	分辨率 2.10 Å R-free 0.280
6C78 Substrate Binding Induces Conformational Changes In A Class A Beta Lactamase That Primes It For Catalysis 提交 2018-01-22	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 32–291（260 aa）片段：RESIDUES 32-291	未记录	未记录非水小分子	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 6.1；293 K；300 MICROLITERS OF A 10 MG/ML PROTEIN CONCENTRATION IN A SOLUTION CONTAINING 2.0 M AMMONIUM SULFATE AND 0.1 M PREPARED IN D2O, PH 6.1, BATCH MODE, TEMPERATURE 293K	分辨率 1.75 Å
6C7A Conformational Changes in a Class A Beta lactamase that Prime it for Catalysis 提交 2018-01-22	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 32–291（260 aa）片段：residues 32-291	未记录	SO4 SULFATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 6.1；293 K；10 mg/ml protein in a solution containing 2.0 M ammonium sulfate and 0.1 M sodium citrate (pH 6.1)	分辨率 1.05 Å R-free 0.150

共 24 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BLT1_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–261； UniProt 32–291

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6c79
沉积日期 deposition_date	2018-01-22
结构标题 title	Conformational Changes in a Class A Beta lactamase that Prime it for Catalysis
关键词 keywords	HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	18.73 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	17.62 Å
零角强度 I(0) i0	15762000.00
分子量 molecular_weight	28720.0 kDa
排除体积 excluded_volume	35460 Å³
包络体积 envelope_volume	39555 Å³
水化壳体积 shell_volume	18558 Å³
包络直径 envelope_diameter	63.0 Å
壳层 Rg shell_rg	24.27 Å
包络 Rg envelope_rg	18.12 Å
形状 Rg shape_rg	17.62 Å
总 Rg total_rg	18.55 Å
总原子数 total_atoms	2010
残基数 n_residues	260
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	64.2 Å
Rg (实空间) rg_real	18.64 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.47 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.5760e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.1970e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	18.66 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	15760000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7875
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.256
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.241
角度范围 angular_range	— – 0.4250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	3336000.0000
实空间数据点数 n_real_points	74
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.745; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Beta-lactamase Toho-1
分子量 formula_weight	28045.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.5.2.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2446

ASVQQQLEALEKSSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCATSKVMAAAAVLKQSESDKHLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELGAAALQYSDNTAMNKLIAHLGGPDKVTAFARSLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPLAMAQTLKNLTLGKALAETQRAQLVTWLKGNTTGSASIRAGLPKSWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPENHAPLVLVTYFTQPEQKAENRNDILAAAAKIVTHGF

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;(6R,7R)-3-(acetyloxymethyl)-7-[[(2Z)-2-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)-2-methoxyimino-ethanoyl]amino]-8-oxo-5-thia-1-azabicy clo[4.2.0]oct-2-ene-2-carboxylic acid ;
分子量 formula_weight	455.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	333

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d6c79a_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.3 — beta-lactamase/transpeptidase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.3.1 — beta-lactamase/transpeptidase-like
家族 Family family	e.3.1.1 — beta-Lactamase/D-ala carboxypeptidase

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6c79A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Beta-lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DD-peptidase/beta-lactamase superfamily

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	72.720 Å
晶胞边长 b length_b	72.720 Å
晶胞边长 c length_c	98.944 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 32 2 1
空间群编号 int_tables_number	154
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.100 Å
最低分辨率 resolution_low	36.360 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1443
R_free r_free	0.1642

fit	/app/data/saxs_computation/c7/6c79/6c79.fit
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Conformational Changes in a Class A Beta lactamase that Prime it for Catalysis