← 返回搜索
6ceu

MBD3 MBD in complex with methylated, non-palindromic CpG DNA: alternative interpretation of crystallographic data

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methyl-CpG-binding domain protein 3

Homo sapiens

UniProt O95983

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*GP*CP*CP*AP*GP*(5CM)P*GP*TP*TP*GP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*GP*CP*CP*AP*AP*(5CM)P*GP*CP*TP*GP*GP*C)-3') ; × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 2 water × 3 与全部聚合物一致
2 蛋白–DNA 单体 蛋白 1 DNA 2 ;DNA (5'-D(*GP*CP*CP*AP*GP*(5CM)P*GP*TP*TP*GP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*GP*CP*CP*AP*AP*(5CM)P*GP*CP*TP*GP*GP*C)-3') ; × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 2 water × 3 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
2mb7

共 1 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6cc8 6cc8 6ccg 6ccg 6ceu 6ceu 6cev 6cev

共 8 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MBD3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 3–73； UniProt 1–71 作者链 B； PDB构建体 3–73； UniProt 1–71

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6ceu
沉积日期 deposition_date2018-02-12
结构标题 titleMBD3 MBD in complex with methylated, non-palindromic CpG DNA: alternative interpretation of crystallographic data
关键词 keywordsStructural Genomics Consortium, SGC, TRANSCRIPTION-DNA complex; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6ceu__assembly_1__model_1 trimeric （3） 排除 — —
排除原因： 来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。
2 1 6ceu__assembly_2__model_1 trimeric （3） 排除 — —
排除原因： 来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id6ceuA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology890 — Methyl-cpg-binding Protein 2; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Methyl-cpg-binding Protein 2; Chain A
结构域编号 domain_id6ceuB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology890 — Methyl-cpg-binding Protein 2; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Methyl-cpg-binding Protein 2; Chain A
▶

7. 引用文献 (1)