SAXSdb — 6chf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Uncharacterized protein DKFZp686C11235

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合同源多聚体蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 260–473 链 B； UniProt 260–473	突变：L234A L235A	;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；20% PEG MME 5,000 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.40 Å R-free 0.273

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6CHF	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5NSC Fc DEKK heterodimer variant 提交 2017-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 242–473（232 aa）链 B 242–473（232 aa）	突变：L351K, T366K 突变：L351D, L368E	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M sodium fluoride, 20% w/v PEG3350	分辨率 2.30 Å R-free 0.265
5NSG Fc DEDE homodimer variant 提交 2017-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 242–473（232 aa）	突变：L351D, L368E	ZN ZINC ION × 6 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；acetate buffer pH 4.5, 0.2 M zinc acetate, 16% w/v PEG 3000	分辨率 2.22 Å R-free 0.243
5U4Y IgG Fc bound to 3 helix of the B-domain from Protein A 提交 2016-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 261–472（212 aa）片段：unp residues 261-472 链 B 261–472（212 aa）片段：unp residues 261-472	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；25% PEG 3400, 0.1M magnesium acetate, 0.1 M HEPES pH 7.0. Protein concentration 5mg/mL.	分辨率 2.50 Å R-free 0.230
5U52 2 helix minimized version of the B-domain from Protein A (Z34C0 bound to IgG1 Fc (monoclinic form) 提交 2016-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 262–469（208 aa）片段：unp residues 262-469 链 B 262–469（208 aa）片段：unp residues 262-469	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；20% PEG monomethyl ether 550, 0.1M bis-tris propane pH 6.5, 0.1M NaCl, 5mg/mL protein concentration.	分辨率 1.94 Å R-free 0.228
5U66 Modified single helix from the B-domain of protein A bound to IgG1 Fc 提交 2016-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 263–469（207 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；20% PEG 4000, 0.1M HEPES pH 7.2, 5mg/mL protein concentration.	分辨率 1.70 Å R-free 0.227
5VME Crystal structure of human IgG1 Fc K248E, T437R mutant 提交 2017-04-27	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 251–473（223 aa）链 B 251–473（223 aa）	突变：K248, T437R 突变：K248, T437R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35.5% PEG 300, 0.1 M HEPES, pH 7.0	分辨率 3.10 Å R-free 0.285
6CJC CRYSTAL STRUCTURE OF A FC FRAGMENT LALA MUTANT (L234A, L235A) OF HUMAN IGG1 (CRYSTAL FORM 3) 提交 2018-02-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 260–473（214 aa）链 B 260–473（214 aa）	突变：L234A, L235A 突变：L234A, L235A	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；20% PEG MME 5,000 0.1 M Bis-Tris. pH 6.5	分辨率 2.58 Å R-free 0.241
6CJX Crystal structure of a Fc fragment LALA mutant (L234A, L235A) of human IgG1 (crystal form 2) 提交 2018-02-27	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 260–473（214 aa）链 B 260–473（214 aa）	突变：L234A, L235A 突变：L234A, L235A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；25% PEG 3,350 0.1 M Bus-Tris pH 6.5	分辨率 2.44 Å R-free 0.264
6N9T Structure of a peptide-based photo-affinity cross-linker with Herceptin Fc 提交 2018-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 249–472（224 aa）片段：residues 249-472	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；100mM sodium acetate pH=5.6, 12%(w/v) PEG 1000	分辨率 2.58 Å R-free 0.265
6N9T Structure of a peptide-based photo-affinity cross-linker with Herceptin Fc 提交 2018-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 249–472（224 aa）片段：residues 249-472	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；100mM sodium acetate pH=5.6, 12%(w/v) PEG 1000	分辨率 2.58 Å R-free 0.265
6P6D HUMAN IGG1 FC FRAGMENT, C239 INSERTION MUTANT 提交 2019-06-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 247–473（227 aa）链 B 247–473（227 aa）	突变：C239 insertion 突变：C239 insertion	CYS CYSTEINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；12 mg/mL protein, 20% w/v PEG 3350, 200 mM K Acetate	分辨率 2.31 Å R-free 0.268
7LF5 Structure of Hyperglycosylated Human IgG1 Fc (Fc267) 提交 2021-01-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 242–473（232 aa）	未记录	FUC alpha-L-fucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；CRYSTALS GROWN BY MIXING 1 UL OF FC267 (10 MG/ML IN 10mM HEPES, 75mM NaCl pH 7.4) WITH 1 UL OF PRECIPITANT SOLUTION CONSISTING OF 0.1M HEPES pH 6.5, 8% w/v PEG6000	分辨率 2.60 Å R-free 0.243
7LF9 Structure of Hyperglycosylated Human IgG1 Fc (Fc329) 提交 2021-01-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 242–473（232 aa）链 B 242–473（232 aa）	未记录	FUC alpha-L-fucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；CRYSTALS GROWN BY MIXING 1 UL OF FC329 (10 MG/ML IN 10mM HEPES, 75mM NaCl pH 7.4) WITH 1 UL OF PRECIPITANT SOLUTION CONSISTING OF 0.1M HEPES pH 6.5, 12.571% w/v PEG6000	分辨率 2.20 Å R-free 0.246
7LFN Structure of Hyperglycosylated Human IgG1 Fc (Fc267_329) 提交 2021-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 242–473（232 aa）链 B 242–473（232 aa）	未记录	FUC alpha-L-fucopyranose × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；CRYSTALS GROWN BY MIXING 1 UL OF FC267_329 (10 MG/ML IN 10mM HEPES, 75mM NaCl pH 7.4) WITH 1 UL OF PRECIPITANT SOLUTION CONSISTING OF 0.025M MES pH 7.0, 0.1M KCl, 20.571% w/v PEG3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.270
7RHO Human IgG1 Fc fragment, hinge-free, expressed in E. coli 提交 2021-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 263–473（211 aa）片段：engineered variant 链 B 263–473（211 aa）片段：engineered variant	未记录	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；295 K；20% (w/v) PEG 6000, 40 mM CaCl2, 100 mM NaHepes	分辨率 2.00 Å R-free 0.270
7RHO Human IgG1 Fc fragment, hinge-free, expressed in E. coli 提交 2021-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 263–473（211 aa）片段：engineered variant 链 E 263–473（211 aa）片段：engineered variant	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；295 K；20% (w/v) PEG 6000, 40 mM CaCl2, 100 mM NaHepes	分辨率 2.00 Å R-free 0.270
7RHO Human IgG1 Fc fragment, hinge-free, expressed in E. coli 提交 2021-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 263–473（211 aa）片段：engineered variant 链 G 263–473（211 aa）片段：engineered variant	未记录	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；295 K；20% (w/v) PEG 6000, 40 mM CaCl2, 100 mM NaHepes	分辨率 2.00 Å R-free 0.270
7RHO Human IgG1 Fc fragment, hinge-free, expressed in E. coli 提交 2021-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 263–473（211 aa）片段：engineered variant 链 K 263–473（211 aa）片段：engineered variant	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；295 K；20% (w/v) PEG 6000, 40 mM CaCl2, 100 mM NaHepes	分辨率 2.00 Å R-free 0.270
8F8W Crystal structure of Nb.X0 bound to the afucosylated human IgG1 fragment crystal form I 提交 2022-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 247–470（224 aa）链 B 247–470（224 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium HEPES 7.5 20 % w/v PEG 8000. Cryopreserved with 12.5% glycerol.	分辨率 2.71 Å R-free 0.241
8F8W Crystal structure of Nb.X0 bound to the afucosylated human IgG1 fragment crystal form I 提交 2022-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 247–470（224 aa）链 F 247–470（224 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium HEPES 7.5 20 % w/v PEG 8000. Cryopreserved with 12.5% glycerol.	分辨率 2.71 Å R-free 0.241
8F8X Crystal structure of Nb.X0 bound to the afucosylated human IgG1 fragment crystal form II 提交 2022-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 247–470（224 aa）链 B 247–470（224 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 % w/v PEG 6000, 0.1 M Sodium citrate 4.0, 0.2 M Lithium chloride. No additional cryoprotectant.	分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8Q5U Endoglycosidase S2 in complex with IgG1 Fc 提交 2023-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 247–473（227 aa）链 B 247–473（227 aa）链 C 247–473（227 aa）	突变：L234C E382A 突变：L234C E382A 突变：L234C E382A	GOL GLYCEROL × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 5 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Morpheus (Molecular Dimensions) conditon G12: 0.1 M carboxylic acids(0.2M Sodium formate; 0.2M Ammonium acetate; 0.2M Sodium citrate tribasic dihydrate; 0.2M Potassium sodium tartrate tetrahydrate; 0.2M Sodium oxamate); 0.1 M buffer system 3(Tris (base); BICINE); pH 8.5; 37.5 v/v Precipitant Mix 4 (25% v/v MPD; 25% PEG 1000; 25% w/v PEG 3350)	分辨率 3.00 Å R-free 0.252
9IUJ Integrin alpha-v beta-3 in complex with rhodostomin 提交 2024-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 247–473（227 aa）链 B 247–473（227 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å
9JEI Integrin alpha-v beta-3 in complex with Echistatin 提交 2024-09-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 247–473（227 aa）链 B 247–473（227 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
9LT3 Integrin alpha-v beta-3 in complex with Trimucrin 提交 2025-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 247–473（227 aa）链 B 247–473（227 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.79 Å

共 20 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6MZV7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–214； UniProt 260–473 作者链 B； PDB构建体 1–214； UniProt 260–473

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6chf
沉积日期 deposition_date	2018-02-22
结构标题 title	Crystal structure of a Fc fragment LALA mutant (L234A, L235A) of human IgG1 (crystal form 1)
关键词 keywords	Immunoglobulin, IgG1, immune system, immunoglobulin-like beta sandwich, FC fragment, LALA mutation; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	28.32 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	27.12 Å
零角强度 I(0) i0	41682800.00
分子量 molecular_weight	50386.0 kDa
排除体积 excluded_volume	63113 Å³
包络体积 envelope_volume	83780 Å³
水化壳体积 shell_volume	25909 Å³
包络直径 envelope_diameter	86.0 Å
壳层 Rg shell_rg	34.47 Å
包络 Rg envelope_rg	26.51 Å
形状 Rg shape_rg	27.12 Å
总 Rg total_rg	27.92 Å
总原子数 total_atoms	3545
残基数 n_residues	419
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	81.4 Å
Rg (实空间) rg_real	28.16 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.47 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.1680e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.8140e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	28.22 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	41680000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9151
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	43.6 Å
偏度 Skewness skewness	-0.003
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.824
角度范围 angular_range	— – 0.2800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	5441000.0000
实空间数据点数 n_real_points	57
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.984; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.946

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Uncharacterized protein DKFZp686C11235
分子量 formula_weight	24149.3 kDa
突变 mutation	L234A L235A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3601

AAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1463.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	47

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d6chfa1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d6chfa2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d6chfb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d6chfb2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6chfA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	6chfB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	48.905 Å
晶胞边长 b length_b	73.809 Å
晶胞边长 c length_c	136.902 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	46.055 Å
R 因子 r_factor	0.2185
R_work r_work	0.2156
R_free r_free	0.2733

fit	/app/data/saxs_computation/ch/6chf/6chf.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ch/6chf/6chf.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ch/6chf/6chf.dat

Crystal structure of a Fc fragment LALA mutant (L234A, L235A) of human IgG1 (crystal form 1)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Uncharacterized protein DKFZp686C11235

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction