Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N × 1 （P61088） Ubv.V1.1 × 1 （Q96H31） | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N × 1 （P61088） Ubv.V1.1 × 1 （Q96H31） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | UB2V1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–143； UniProt 8–147 作者链 D； PDB构建体 4–143； UniProt 8–147 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 × 1 （Q13404） Ubv.V1.1 × 1 （Q96H31） | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 × 1 （Q13404） Ubv.V1.1 × 1 （Q96H31） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | UBE2N_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 6–155； UniProt 3–152 作者链 E； PDB构建体 6–155； UniProt 3–152 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 × 1 （Q13404） Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N × 1 （P61088） | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 3 | Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 × 1 （Q13404） Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N × 1 （P61088） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q96H31_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 13–88； UniProt 14–89 作者链 F； PDB构建体 13–88； UniProt 14–89 |
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| 条目编号 entry_id | 6d6i |
| 沉积日期 deposition_date | 2018-04-21 |
| 结构标题 title | Ube2V1 in complex with ubiquitin variant Ubv.V1.1 and Ube2N/Ubc13 |
| 关键词 keywords | Ubiquitin, Ubiquitin conjugating enzyme, Ubiquitin variant, Ube2V1, TRANSFERASE; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 23.44 Å |
| Rg（电子密度） | 22.41 Å |
| 总 Rg | 23.25 Å |
| 原子数 | 4906 |
| 残基数 | 348 |
| 排除体积 | 45282 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6d6ia_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.20 — UBC-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.20.1 — UBC-like |
| 家族 Family family | d.20.1.1 — UBC-related |
| 结构域编号 domain_id | d6d6ib_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.20 — UBC-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.20.1 — UBC-like |
| 家族 Family family | d.20.1.1 — UBC-related |
| 结构域编号 domain_id | d6d6ic_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.15.1 — Ubiquitin-like |
| 家族 Family family | d.15.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d6d6id_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.20 — UBC-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.20.1 — UBC-like |
| 家族 Family family | d.20.1.1 — UBC-related |
| 结构域编号 domain_id | d6d6ie_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.20 — UBC-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.20.1 — UBC-like |
| 家族 Family family | d.20.1.1 — UBC-related |
| 结构域编号 domain_id | d6d6if_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like) |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.15.1 — Ubiquitin-like |
| 家族 Family family | d.15.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 6d6iA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme |
| 结构域编号 domain_id | 6d6iD00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 110 — Ubiquitin Conjugating Enzyme |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Ubiquitin Conjugating Enzyme |