SAXSdb — 6e53

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomerase reverse transcriptase

Tribolium castaneum

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	单体	蛋白 1 DNA 1	RNA/DNA hairpin × 1 MAGNESIUM ION × 2 ;methyl 1-{2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-D-erythro-pentofuranosyl}-1H-indole-5-carboxylate ; × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q0QHL8_TRICA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–596； UniProt 1–596

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6e53
沉积日期 deposition_date	2018-07-19
结构标题 title	Structure of TERT in complex with a novel telomerase inhibitor
关键词 keywords	telomerase, catalytic subunit, telomerase inhibitor, TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR complex; TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6e53__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6e53__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6e53__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	27.92 Å
Rg（电子密度）	27.49 Å
总 Rg	28.25 Å
原子数	5492
残基数	619
排除体积	97805 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6e53__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Telomerase reverse transcriptase
分子量 formula_weight	70588.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.49
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5492

MVHYYRLSLKSRQKAPKIVNSKYNSILNIALKNFRLCKKHKTKKPVQILALLQEIIPKSYFGTTTNLKRFYKVVEKILTQSSFECIHLSVLHKCYDYDAIPWLQNVEPNLRPKLLLKHNLFLLDNIVKPIIAFYYKPIKTLNGHEIKFIRKEEYISFESKVFHKLKKMKYLVEVQDEVKPRGVLNIIPKQDNFRAIVSIFPDSARKPFFKLLTSKIYKVLEEKYKTSGSLYTCWSEFTQKTQGQIYGIKVDIRDAYGNVKIPVLCKLIQSIPTHLLDSEKKNFIVDHISNQFVAFRRKIYKWNHGLLQGDPLSGCLCELYMAFMDRLYFSNLDKDAFIHRTVDDYFFCSPHPHKVYDFELLIKGVYQVNPTKTRTNLPTHRHPQDEIPYCGKIFNLTTRQVRTLYKLPPNYEIRHKFKLWNFNNQISDDNPARFLQKAMDFPFICNSFTKFEFNTVFNDQRTVFANFYDAMICVAYKFDAAMMALRTSFLVNDFGFIWLVLSSTVRAYASRAFKKIVTYKGGKYRKVTFQCLKSIAWRAFLAVLKRRTEIYKGLIDRIKSREKLTMKFHDGEVDASYFCKLPEKFRFVKINRKASI

来源 Source

来源生物 organism	Tribolium castaneum
通用名 common_name	red flour beetle
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7070
宿主生物 host_organism	Tribolium castaneum

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	RNA/DNA hairpin
分子量 formula_weight	7164.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide/polyribonucleotide hybrid
链编号 strand_id	E

CUGACCUGACTTCGGTCAGGTCA

来源 Source

来源生物 organism	Tribolium castaneum
通用名 common_name	red flour beetle
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7070
宿主生物 host_organism	Tribolium castaneum

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	;methyl 1-{2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-alpha-D-erythro-pentofuranosyl}-1H-indole-5-carboxylate ;
分子量 formula_weight	531.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id	6e53A01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	6e53A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	6e53A03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2210 —

结构域编号 domain_id	6e53A04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2630 —

结构域编号 domain_id	6e53A05
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	357 — Tetracycline Repressor; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Telomerase reverse transcriptase (TERT), thumb domain

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晶胞边长 a length_a	80.020 Å
晶胞边长 b length_b	52.100 Å
晶胞边长 c length_c	100.480 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	98.45 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	19.986 Å
R 因子 r_factor	0.2331
R_work r_work	0.2302
R_free r_free	0.2880

Structure of TERT in complex with a novel telomerase inhibitor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomerase reverse transcriptase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6e53__assembly_1__model_1

6e53__assembly_1__model_1 | I(q)

6e53__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of TERT in complex with a novel telomerase inhibitor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Telomerase reverse transcriptase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6e53__assembly_1__model_1

6e53__assembly_1__model_1 | I(q)

6e53__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

CATH v4.4 (5 domains)

7. 引用文献 (1)