Human immunodeficiency virus 1
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | ;(3aS,5R,6aR)-2-oxo-3-phenylhexahydro-2H-cyclopenta[d][1,3]oxazol-5-yl [(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]carbamate ; × 1 SODIUM ION × 2 CHLORIDE ION × 4 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q5RZ08_9HIV1 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 B； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 |
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| 条目编号 entry_id | 6e7j |
| 沉积日期 deposition_date | 2018-07-26 |
| 结构标题 title | HIV-1 wild type protease with GRL-042-17A, 3-phenylhexahydro-2h-cyclopenta[d]oxazol-2-one with a bicyclic oxazolidinone scaffold as the P2 ligand |
| 关键词 keywords | ;ANTIVIRAL, HIV-1 PROTEASE INHIBITOR OF GRL-042-17A, P2 LIGAND, MULTIDRUG-RESISTANT, OXAZOLIDINONE, VIRAL PROTEIN, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex ;; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 18.06 Å |
| Rg（电子密度） | 17.13 Å |
| 总 Rg | 18.20 Å |
| 原子数 | 1564 |
| 残基数 | 198 |
| 排除体积 | 28718 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6e7ja_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.1 — Retroviral protease (retropepsin) |
| 结构域编号 domain_id | d6e7jb_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.50 — Acid proteases |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.50.1 — Acid proteases |
| 家族 Family family | b.50.1.1 — Retroviral protease (retropepsin) |
| 结构域编号 domain_id | 6e7jA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |
| 结构域编号 domain_id | 6e7jB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Acid Proteases |