← 返回搜索
6f26

Crystal structure of human Casein Kinase I delta in complex with compound 31b

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Casein kinase I isoform delta

Homo sapiens

UniProt P48730

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 SULFATE ION × 13 ;(9~{S},10~{S},11~{R})-~{N}-[4-[3-(4-fluorophenyl)-5-propan-2-yl-1,2-oxazol-4-yl]pyridin-2-yl]-4-(4-methoxyphenyl)-10,11-bis(oxidanyl)-1,7-diazatricyclo[7.3.0.0^{3,7}]dodeca-3,5-diene-6-carboxamide ; × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 SULFATE ION × 6 ;(9~{S},10~{S},11~{R})-~{N}-[4-[3-(4-fluorophenyl)-5-propan-2-yl-1,2-oxazol-4-yl]pyridin-2-yl]-4-(4-methoxyphenyl)-10,11-bis(oxidanyl)-1,7-diazatricyclo[7.3.0.0^{3,7}]dodeca-3,5-diene-6-carboxamide ; × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
3uys 3uys 3uys 3uys 3uyt 3uyt 3uyt 3uyt 3uzp 3uzp 4hgt 4hgt

共 92 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
3uys 3uys 3uyt 3uyt 3uzp 4hnf 4kb8 4kb8 4kba 4kba 4kbc 4kbc

共 22 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6ru6 6ru7 6ru7 6ru8 6ru8 6ru8 6ru8 8d7m 8d7m 8d7n 8d7n 8d7o

共 15 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KC1D_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 21–314； UniProt 1–294 作者链 B； PDB构建体 21–314； UniProt 1–294

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6f26
沉积日期 deposition_date2017-11-23
结构标题 titleCrystal structure of human Casein Kinase I delta in complex with compound 31b
关键词 keywordsKinase, Inhibitor, Complex, CK1, transferase; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6f26__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6f26__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6f26__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）20.78 Å
Rg（电子密度）19.50 Å
总 Rg20.48 Å
原子数4687
残基数280
排除体积42324 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6f26__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6f26__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd6f26a_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family familyd.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit
结构域编号 domain_idd6f26b_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family familyd.144.1.7 — Protein kinases, catalytic subunit

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id6f26A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id6f26A02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
结构域编号 domain_id6f26B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phosphorylase Kinase; domain 1
结构域编号 domain_id6f26B02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1
▶

7. 引用文献 (1)