SAXSdb — 6f4g

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Probable U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ;

Drosophila melanogaster

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 2 RNA 1	U1 small nuclear ribonucleoprotein A × 1 （P43332） U2-SL4 × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 3	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 2 RNA 1	U1 small nuclear ribonucleoprotein A × 1 （P43332） U2-SL4 × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 2 water × 3	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RU2A_DROME
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–176； UniProt 1–176 作者链 D； PDB构建体 1–176； UniProt 1–176

U1 small nuclear ribonucleoprotein A

Drosophila melanogaster

UniProt P43332

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 2 RNA 1	;Probable U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （Q9V4Q8） U2-SL4 × 1 CHLORIDE ION × 1 water × 3	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 2 RNA 1	;Probable U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （Q9V4Q8） U2-SL4 × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 2 water × 3	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SNRPA_DROME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–98； UniProt 1–96 作者链 E； PDB构建体 3–98； UniProt 1–96

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6f4g
沉积日期 deposition_date	2017-11-29
结构标题 title	'Crystal structure of the Drosophila melanogaster SNF/U2A'/U2-SL4 complex
关键词 keywords	SNF, RRM, Splicing, Evolution; SPLICING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6f4g__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6f4g__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6f4g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.67 Å
Rg（电子密度）	21.27 Å
总 Rg	22.26 Å
原子数	2717
残基数	295
排除体积	47040 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6f4g__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6f4g__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;Probable U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ;
分子量 formula_weight	20473.6 kDa
突变 mutation	C19V, C68T, C119S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	6473

MVKLTPELINQSMQYINPVRERELDLRGYKIPQIENLGATLDQFDTIDLSDNDLRKLDNLPHLPRLKTLLLNNNRILRISEGLEEAVPNLGSIILTGNNLQELSDLEPLVGFTKLETISLLINPVSTKPNYREYMAYKFPQLRLLDFRKIKQKDRQAAQEFFRTKQGKDVLKEISR

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	Fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	U1 small nuclear ribonucleoprotein A
分子量 formula_weight	11082.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

GAMEMLPNQTIYINNLNEKIKKEELKKSLYAIFSQFGQILDIVALKTLKMRGQAFVIFKEIGSASNALRTMQGFPFYDKPMQIAYSKSDSDIVAKIKG

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	Fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	U2-SL4
分子量 formula_weight	8020.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	C,F

GCGGCCGUAUUGCAGUACCGCGGCC

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	875

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	6f4gA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	6f4gB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — RRM (RNA recognition motif) domain

结构域编号 domain_id	6f4gD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	6f4gE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	330 — RRM (RNA recognition motif) domain

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晶胞边长 a length_a	65.045 Å
晶胞边长 b length_b	103.914 Å
晶胞边长 c length_c	116.350 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	47.442 Å
R 因子 r_factor	0.1687
R_work r_work	0.1670
R_free r_free	0.2177

'Crystal structure of the Drosophila melanogaster SNF/U2A'/U2-SL4 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Probable U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

U1 small nuclear ribonucleoprotein A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6f4g__assembly_1__model_1

6f4g__assembly_1__model_1 | I(q)

6f4g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

'Crystal structure of the Drosophila melanogaster SNF/U2A'/U2-SL4 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Probable U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

U1 small nuclear ribonucleoprotein A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6f4g__assembly_1__model_1

6f4g__assembly_1__model_1 | I(q)

6f4g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)