Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | ;(2~{S})-2-[[3-[[5-[4-(aminomethyl)phenyl]-1-benzofuran-7-yl]sulfonylamino]thiophen-2-yl]carbonylamino]-5-carbamimidamido-pentanoic acid ; × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | NRP1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–158； UniProt 273–427 |
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| 条目编号 entry_id | 6fmc |
| 沉积日期 deposition_date | 2018-01-30 |
| 结构标题 title | Neuropilin1-b1 domain in complex with EG01377, 0.9 Angstrom structure |
| 关键词 keywords | VEGF-receptor, Semaphorin-receptor, small molecule inhibitor, Angiogenesis, Discoidin domain, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.54 Å |
| Rg（电子密度） | 15.51 Å |
| 总 Rg | 16.69 Å |
| 原子数 | 1301 |
| 残基数 | 158 |
| 排除体积 | 23127 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6fmca1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.18 — Galactose-binding domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.18.1 — Galactose-binding domain-like |
| 家族 Family family | b.18.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d6fmca2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 6fmcA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Jelly Rolls |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 260 — Galactose-binding domain-like |