Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 1,2-ETHANEDIOL × 1 ;8-(((1R,2R,3R,5S)-2-(2-(4,4-difluorocyclohexyl)ethyl)-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-yl)amino)-3-methyl-5-(5-methylpyridin-3-yl)-1,7-naphthyridin-2(1H)-one ; × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | BRD4_HUMAN |
| Isoform | O60885-3 |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–127； UniProt 44–168 |
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| 条目编号 entry_id | 6hdq |
| 沉积日期 deposition_date | 2018-08-18 |
| 结构标题 title | N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH : 8-(((1R,2R,3R,5S)-2-(2-(4,4-difluorocyclohexyl)ethyl)-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-yl)amino)-3-methyl-5-(5-methylpyridin-3-yl)-1,7-naphthyridin-2(1H)-one |
| 关键词 keywords | INHIBITOR, HISTONE, EPIGENETIC READER, BROMODOMAIN, BRD4, BROMODOMAIN CONTAINING PROTEIN 4, ANTAGONIST, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.97 Å |
| Rg（电子密度） | 14.86 Å |
| 总 Rg | 16.02 Å |
| 原子数 | 1071 |
| 残基数 | 123 |
| 排除体积 | 19357 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6hdqa_ |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.29 — Bromodomain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.29.2 — Bromodomain |
| 家族 Family family | a.29.2.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 6hdqA01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 920 — Histone Acetyltransferase; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Bromodomain-like |