SAXSdb — 6jn2

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein AF-10

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific × 4 （Q8TEK3）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AF10_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 15–98； UniProt 699–782

Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific

Homo sapiens

UniProt Q8TEK3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Protein AF-10 × 4 （P55197）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DOT1L_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–82； UniProt 470–550

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6jn2
沉积日期 deposition_date	2019-03-13
结构标题 title	Crystal structure of the coiled-coil domains of human DOT1L in complex with AF10
关键词 keywords	hDOT1L, hAF10, Leucine zipper, heterodimer, tetramerization, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6jn2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6jn2__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6jn2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	41.46 Å
Rg（电子密度）	43.29 Å
总 Rg	42.87 Å
原子数	4392
残基数	536
排除体积	78818 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6jn2__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein AF-10
分子量 formula_weight	11161.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1098

MGSSHHHHHHSQDPDQPGNSSLENLPPVAASIEQLLERQWSEGQQFLLEQGTPSDILGMLKSLHQLQVENRRLEEQIKNLTAKKERLQLLNAQLSVPF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific
分子量 formula_weight	9415.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.43
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MHSPNPLLVAPTPPALQKLLESFKIQYLQFLAYTKTPQYKASLQELLGQEKEKNAQLLGAAQQLLSHCQAQKEEIRRLFQQK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

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晶胞边长 a length_a	107.813 Å
晶胞边长 b length_b	107.813 Å
晶胞边长 c length_c	114.035 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	I 41 2 2
空间群编号 int_tables_number	98
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.600 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.3293
R_work r_work	0.3242
R_free r_free	0.3812

Crystal structure of the coiled-coil domains of human DOT1L in complex with AF10

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein AF-10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6jn2__assembly_1__model_1

6jn2__assembly_1__model_1 | I(q)

6jn2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the coiled-coil domains of human DOT1L in complex with AF10

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein AF-10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6jn2__assembly_1__model_1

6jn2__assembly_1__model_1 | I(q)

6jn2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)