6jxk

Rb+-bound E2-MgF state of the gastric proton pump (Wild-type)

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium-transporting ATPase alpha chain 1

Sus scrofa

UniProt P19156

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Potassium-transporting ATPase subunit beta × 1 （P18434） TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1 MAGNESIUM ION × 1 CHOLESTEROL × 1 POTASSIUM ION × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Potassium-transporting ATPase subunit beta × 1 （P18434） TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1 MAGNESIUM ION × 1 CHOLESTEROL × 1 POTASSIUM ION × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATP4A_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–987； UniProt 49–1034 作者链 E； PDB构建体 2–987； UniProt 49–1034

Potassium-transporting ATPase subunit beta

Sus scrofa

UniProt P18434

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Potassium-transporting ATPase alpha chain 1 × 1 （P19156） TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1 MAGNESIUM ION × 1 CHOLESTEROL × 1 POTASSIUM ION × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Potassium-transporting ATPase alpha chain 1 × 1 （P19156） TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1 MAGNESIUM ION × 1 CHOLESTEROL × 1 POTASSIUM ION × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATP4B_PIG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–289； UniProt 2–290 作者链 F； PDB构建体 1–289； UniProt 2–290

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6jxk
沉积日期 deposition_date	2019-04-23
结构标题 title	Rb+-bound E2-MgF state of the gastric proton pump (Wild-type)
关键词 keywords	P-type ATPase, proton pump, gastric, ion pump, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6jxk__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6jxk__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6jxk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	46.45 Å
Rg（电子密度）	46.81 Å
总 Rg	46.50 Å
原子数	9899
残基数	1258
排除体积	177800 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6jxk__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6jxk__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Potassium-transporting ATPase alpha chain 1
分子量 formula_weight	109197.7 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.2.19
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,E
原子数 atom_count	19807

GMEINDHQLSVAELEQKYQTSATKGLSASLAAELLLRDGPNALRPPRGTPEYVKFARQLAGGLQCLMWVAAAICLIAFAIQASEGDLTTDDNLYLALALIAVVVVTGCFGYYQEFKSTNIIASFKNLVPQQATVIRDGDKFQINADQLVVGDLVEMKGGDRVPADIRILQAQGCKVDNSSLTGESEPQTRSPECTHESPLETRNIAFFSTMCLEGTAQGLVVNTGDRTIIGRIASLASGVENEKTPIAIEIEHFVDIIAGLAILFGATFFIVAMCIGYTFLRAMVFFMAIVVAYVPEGLLATVTVCLSLTAKRLASKNCVVKNLEAVETLGSTSVICSDKTGTLTQNRMTVSHLWFDNHIHSADTTEDQSGQTFDQSSETWRALCRVLTLCNRAAFKSGQDAVPVPKRIVIGDASETALLKFSELTLGNAMGYRERFPKVCEIPFNSTNKFQLSIHTLEDPRDPRHVLVMKGAPERVLERCSSILIKGQELPLDEQWREAFQTAYLSLGGLGERVLGFCQLYLSEKDYPPGYAFDVEAMNFPTSGLCFAGLVSMIDPPRATVPDAVLKCRTAGIRVIMVTGDHPITAKAIAASVGIISEGSETVEDIAARLRVPVDQVNRKDARACVINGMQLKDMDPSELVEALRTHPEMVFARTSPQQKLVIVESCQRLGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDAAKNAADMILLDDNFASIVTGVEQGRLIFDNLKKSIAYTLTKNIPELTPYLIYITVSVPLPLGCITILFIELCTDIFPSVSLAYEKAESDIMHLRPRNPKRDRLVNEPLAAYSYFQIGAIQSFAGFTDYFTAMAQEGWFPLLCVGLRPQWENHHLQDLQDSYGQEWTFGQRLYQQYTCYTVFFISIEMCQIADVLIRKTRRLSAFQQGFFRNRILVIAIVFQVCIGCFLCYCPGMPNIFNFMPIRFQWWLVPMPFSLLIFVYDEIRKLGVRCCPGSWWDQELYY

来源 Source

来源生物 organism	Sus scrofa
通用名 common_name	Pig
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9823
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Potassium-transporting ATPase subunit beta
分子量 formula_weight	32982.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F

AALQEKKSCSQRMEEFQRYCWNPDTGQMLGRTLSRWVWISLYYVAFYVVMSGIFALCIYVLMRTIDPYTPDYQDQLKSPGVTLRPDVYGEKGLDISYNVSDSTTWAGLAHTLHRFLAGYSPAAQEGSINCTSEKYFFQESFLAPNHTKFSCKFTADMLQNCSGRPDPTFGFAEGKPCFIIKMNRIVKFLPGNSTAPRVDCAFLDQPRDGPPLQVEYFPANGTYSLHYFPYYGKKAQPHYSNPLVAAKLLNVPRNRDVVIVCKILAEHVSFDNPHDPYEGKVEFKLKIQK

来源 Source

来源生物 organism	Sus scrofa
通用名 common_name	Pig
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9823
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	TETRAFLUOROMAGNESATE(2-)
分子量 formula_weight	100.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL
分子量 formula_weight	386.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

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晶胞边长 a length_a	191.510 Å
晶胞边长 b length_b	106.430 Å
晶胞边长 c length_c	250.960 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	107.79 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	monoclinic

分辨率 resolution	4.300 Å
最低分辨率 resolution_low	47.790 Å
R 因子 r_factor	0.2666
R_work r_work	0.2627
R_free r_free	0.3384

Rb+-bound E2-MgF state of the gastric proton pump (Wild-type)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium-transporting ATPase alpha chain 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Potassium-transporting ATPase subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6jxk__assembly_1__model_1

6jxk__assembly_1__model_1 | I(q)

6jxk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Rb+-bound E2-MgF state of the gastric proton pump (Wild-type)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium-transporting ATPase alpha chain 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Potassium-transporting ATPase subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6jxk__assembly_1__model_1

6jxk__assembly_1__model_1 | I(q)

6jxk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 引用文献 (1)