6kig

Structure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 257.6 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

UniProt Q31LJ0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–763 链 G; UniProt 1–763 链 e; UniProt 1–763 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 (Q31LJ1) Photosystem I iron-sulfur center × 3 (Q31QV2) Photosystem I reaction center subunit II × 3 (Q31PI7) Photosystem I reaction center subunit IV × 3 (Q31NL7) Photosystem I reaction center subunit III × 3 (Q31NT9) Photosystem I PsaI protein × 3 (P95823) Photosystem I reaction center subunit IX × 3 (Q31NU0) Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 (Q31PR9) Photosystem I reaction center subunit XI × 3 (P95822) PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 (P15347) CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 PSAA_SYNE7
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–763; UniProt 1–763 作者链 G; PDB构建体 1–763; UniProt 1–763 作者链 e; PDB构建体 1–763; UniProt 1–763

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt Q31LJ1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–734 链 H; UniProt 1–734 链 f; UniProt 1–734 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 (Q31LJ0) Photosystem I iron-sulfur center × 3 (Q31QV2) Photosystem I reaction center subunit II × 3 (Q31PI7) Photosystem I reaction center subunit IV × 3 (Q31NL7) Photosystem I reaction center subunit III × 3 (Q31NT9) Photosystem I PsaI protein × 3 (P95823) Photosystem I reaction center subunit IX × 3 (Q31NU0) Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 (Q31PR9) Photosystem I reaction center subunit XI × 3 (P95822) PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 (P15347) CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSAB_SYNE7
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–734; UniProt 1–734 作者链 H; PDB构建体 1–734; UniProt 1–734 作者链 f; PDB构建体 1–734; UniProt 1–734

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt Q31QV2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–81 链 N; UniProt 1–81 链 g; UniProt 1–81 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 (Q31LJ0) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 (Q31LJ1) Photosystem I reaction center subunit II × 3 (Q31PI7) Photosystem I reaction center subunit IV × 3 (Q31NL7) Photosystem I reaction center subunit III × 3 (Q31NT9) Photosystem I PsaI protein × 3 (P95823) Photosystem I reaction center subunit IX × 3 (Q31NU0) Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 (Q31PR9) Photosystem I reaction center subunit XI × 3 (P95822) PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 (P15347) CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSAC_SYNE7
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 N; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81 作者链 g; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit II

物种未注明

UniProt Q31PI7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 2–142 链 O; UniProt 2–142 链 h; UniProt 2–142 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 (Q31LJ0) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 (Q31LJ1) Photosystem I iron-sulfur center × 3 (Q31QV2) Photosystem I reaction center subunit IV × 3 (Q31NL7) Photosystem I reaction center subunit III × 3 (Q31NT9) Photosystem I PsaI protein × 3 (P95823) Photosystem I reaction center subunit IX × 3 (Q31NU0) Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 (Q31PR9) Photosystem I reaction center subunit XI × 3 (P95822) PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 (P15347) CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q31PI7_SYNE7
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–141; UniProt 2–142 作者链 O; PDB构建体 1–141; UniProt 2–142 作者链 h; PDB构建体 1–141; UniProt 2–142

Photosystem I reaction center subunit IV

物种未注明

UniProt Q31NL7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 1–75 链 Q; UniProt 1–75 链 i; UniProt 1–75 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 (Q31LJ0) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 (Q31LJ1) Photosystem I iron-sulfur center × 3 (Q31QV2) Photosystem I reaction center subunit II × 3 (Q31PI7) Photosystem I reaction center subunit III × 3 (Q31NT9) Photosystem I PsaI protein × 3 (P95823) Photosystem I reaction center subunit IX × 3 (Q31NU0) Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 (Q31PR9) Photosystem I reaction center subunit XI × 3 (P95822) PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 (P15347) CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSAE_SYNE7
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 Q; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 i; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75

Photosystem I reaction center subunit III

物种未注明

UniProt Q31NT9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 1–159 链 R; UniProt 1–159 链 j; UniProt 1–159 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 (Q31LJ0) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 (Q31LJ1) Photosystem I iron-sulfur center × 3 (Q31QV2) Photosystem I reaction center subunit II × 3 (Q31PI7) Photosystem I reaction center subunit IV × 3 (Q31NL7) Photosystem I PsaI protein × 3 (P95823) Photosystem I reaction center subunit IX × 3 (Q31NU0) Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 (Q31PR9) Photosystem I reaction center subunit XI × 3 (P95822) PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 (P15347) CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q31NT9_SYNE7
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–159; UniProt 1–159 作者链 R; PDB构建体 1–159; UniProt 1–159 作者链 j; PDB构建体 1–159; UniProt 1–159

Photosystem I PsaI protein

物种未注明

UniProt P95823

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 1–38 链 S; UniProt 1–38 链 k; UniProt 1–38 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 (Q31LJ0) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 (Q31LJ1) Photosystem I iron-sulfur center × 3 (Q31QV2) Photosystem I reaction center subunit II × 3 (Q31PI7) Photosystem I reaction center subunit IV × 3 (Q31NL7) Photosystem I reaction center subunit III × 3 (Q31NT9) Photosystem I reaction center subunit IX × 3 (Q31NU0) Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 (Q31PR9) Photosystem I reaction center subunit XI × 3 (P95822) PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 (P15347) CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 P95823_SYNE7
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–38; UniProt 1–38 作者链 S; PDB构建体 1–38; UniProt 1–38 作者链 k; PDB构建体 1–38; UniProt 1–38

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt Q31NU0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–41 链 T; UniProt 1–41 链 l; UniProt 1–41 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 (Q31LJ0) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 (Q31LJ1) Photosystem I iron-sulfur center × 3 (Q31QV2) Photosystem I reaction center subunit II × 3 (Q31PI7) Photosystem I reaction center subunit IV × 3 (Q31NL7) Photosystem I reaction center subunit III × 3 (Q31NT9) Photosystem I PsaI protein × 3 (P95823) Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 (Q31PR9) Photosystem I reaction center subunit XI × 3 (P95822) PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 (P15347) CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 PSAJ_SYNE7
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–41; UniProt 1–41 作者链 T; PDB构建体 1–41; UniProt 1–41 作者链 l; PDB构建体 1–41; UniProt 1–41

Photosystem I reaction center subunit PsaK

物种未注明

UniProt Q31PR9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 1–84 链 U; UniProt 1–84 链 m; UniProt 1–84 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 (Q31LJ0) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 (Q31LJ1) Photosystem I iron-sulfur center × 3 (Q31QV2) Photosystem I reaction center subunit II × 3 (Q31PI7) Photosystem I reaction center subunit IV × 3 (Q31NL7) Photosystem I reaction center subunit III × 3 (Q31NT9) Photosystem I PsaI protein × 3 (P95823) Photosystem I reaction center subunit IX × 3 (Q31NU0) Photosystem I reaction center subunit XI × 3 (P95822) PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 (P15347) CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q31PR9_SYNE7
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–84; UniProt 1–84 作者链 U; PDB构建体 1–84; UniProt 1–84 作者链 m; PDB构建体 1–84; UniProt 1–84

Photosystem I reaction center subunit XI

物种未注明

UniProt P95822

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 L; UniProt 1–166 链 V; UniProt 1–166 链 n; UniProt 1–166 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 (Q31LJ0) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 (Q31LJ1) Photosystem I iron-sulfur center × 3 (Q31QV2) Photosystem I reaction center subunit II × 3 (Q31PI7) Photosystem I reaction center subunit IV × 3 (Q31NL7) Photosystem I reaction center subunit III × 3 (Q31NT9) Photosystem I PsaI protein × 3 (P95823) Photosystem I reaction center subunit IX × 3 (Q31NU0) Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 (Q31PR9) PsaM × 3 Iron stress-induced chlorophyll-binding protein × 18 (P15347) CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSAL_SYNE7
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 V; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166 作者链 n; PDB构建体 1–166; UniProt 1–166

Iron stress-induced chlorophyll-binding protein

物种未注明

UniProt P15347

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 51 PDB 声明:51-meric(51) 与蛋白拷贝数一致 链 1; UniProt 1–342 链 2; UniProt 1–342 链 3; UniProt 1–342 链 4; UniProt 1–342 链 5; UniProt 1–342 链 6; UniProt 1–342 链 Y; UniProt 1–342 链 Z; UniProt 1–342 链 a; UniProt 1–342 链 b; UniProt 1–342 链 c; UniProt 1–342 链 d; UniProt 1–342 链 q; UniProt 1–342 链 r; UniProt 1–342 链 s; UniProt 1–342 链 t; UniProt 1–342 链 u; UniProt 1–342 链 v; UniProt 1–342 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 3 (Q31LJ0) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 3 (Q31LJ1) Photosystem I iron-sulfur center × 3 (Q31QV2) Photosystem I reaction center subunit II × 3 (Q31PI7) Photosystem I reaction center subunit IV × 3 (Q31NL7) Photosystem I reaction center subunit III × 3 (Q31NT9) Photosystem I PsaI protein × 3 (P95823) Photosystem I reaction center subunit IX × 3 (Q31NU0) Photosystem I reaction center subunit PsaK × 3 (Q31PR9) Photosystem I reaction center subunit XI × 3 (P95822) PsaM × 3 CLA CHLOROPHYLL A × 594 PQN PHYLLOQUINONE × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 9 BCR BETA-CAROTENE × 144 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 45 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 18 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 6 SQD 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 24 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ISIA_SYNE7
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 1; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 2; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 3; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 4; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 5; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 6; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 Y; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 Z; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 a; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 b; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 c; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 d; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 q; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 r; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 s; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 t; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 u; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342 作者链 v; PDB构建体 1–342; UniProt 1–342

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6kig

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6kig
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6kig
沉积日期 deposition_date2019-07-18
结构标题 titleStructure of cyanobacterial photosystem I-IsiA supercomplex
关键词 keywordsPhotosystem, Antenna, Chlorophyll-binding protein, Membrane protein, Photosynthesis, iron stress-induced protein A; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier97.23
回转半径 Rg (电子) rg_electron96.85
零角强度 I(0) i031221500000.00
分子量 molecular_weight2001600.0 kDa
排除体积 excluded_volume2682500 ų
包络体积 envelope_volume3419200 ų
水化壳体积 shell_volume279630 ų
包络直径 envelope_diameter293.8
壳层 Rg shell_rg92.57
包络 Rg envelope_rg97.10
形状 Rg shape_rg96.93
总 Rg total_rg96.43
总原子数 total_atoms142968
残基数 n_residues12888
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax257.6
Rg (实空间) rg_real94.63
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.65
I(0) (实空间) i0_real2.9960e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.5080e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal96.51
I(0) (倒空间) i0_reciprocal31140000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9108
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary96.6
偏度 Skewness skewness0.208
峰度 Kurtosis kurtosis-0.693
角度范围 angular_range— – 0.0800 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.1520
最高正则化参数 α highest_alpha3083000000.0000
实空间数据点数 n_real_points17
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 1.000; Stabil: 0.949; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (21)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)