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6kj7

E. coli ATCase catalytic subunit mutant - G166P

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 63.4 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit

Escherichia coli K-12

UniProt P0A786

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–311 突变：G166P 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4Ac, 0.1 M Tris pH 8.5, 20% PEG3350, and 10% glycerol 分辨率 2.84 Å R-free 0.260

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6KJ7 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ACM ARGININE 54 IN THE ACTIVE SITE OF ESCHERICHIA COLI ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE IS CRITICAL FOR CATALYSIS: A SITE-SPECIFIC MUTAGENESIS, NMR AND X-RAY CRYSTALLOGRAPHY STUDY 提交 1992-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 PAL N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1AT1 CRYSTAL STRUCTURES OF PHOSPHONOACETAMIDE LIGATED T AND PHOSPHONOACETAMIDE AND MALONATE LIGATED R STATES OF ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE AT 2.8-ANGSTROMS RESOLUTION AND NEUTRAL P*H 提交 1989-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 MLI MALONATE ION × 6 PCT PHOSPHONOACETAMIDE × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1D09 ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE COMPLEXED WITH N-PHOSPHONACETYL-L-ASPARTATE (PALA) 提交 1999-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 PAL N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 5.9；ENZYME: 12 MG/ML; BUFFER: 50 MM MALEIC ACID, 3 MM SOLDIUM AZIDE 1 MM N- PHOSPHONACETYL-L-ASPARTATE, pH 5.9, LIQUID DIFFUSION
分辨率 2.10 Å R-free 0.234
1EKX THE ISOLATED, UNREGULATED CATALYTIC TRIMER OF ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE COMPLEXED WITH BISUBSTRATE ANALOG PALA (N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTATE) 提交 2000-03-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–311（311 aa） 片段：CATALYTIC SUBUNIT
链 B 1–311（311 aa） 片段：CATALYTIC SUBUNIT
链 C 1–311（311 aa） 片段：CATALYTIC SUBUNIT
未记录 PAL N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTIC ACID × 3 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Calcium Acetate, PEG 8000, tris-HCL, 2-mercaptoethanol, PALA, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.214
1EZZ CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE P268A MUTANT IN THE T-STATE 提交 2000-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
突变：P268A 突变：P268A ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；ENZYME: 24 mg/ml; 1:1 enzyme to-buffer ratio, BUFFER: 20 mm HEPES, 14% (w/v) PEG 1450, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.242
1F1B CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE P268A MUTANT IN THE R-STATE IN THE PRESENCE OF N-PHOSPHONACETYL-L-ASPARTATE 提交 2000-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
突变：P268A 突变：P268A PAL N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.75；293 K；ENZYME: 7.5 mg/ml in 50 uL microdialysis button. BUFFER: 20 mm maleic acid, 3 mM sodium azide, 1 mM N-phosphonacetyl-L-aspartate, pH 5.75, MICRODIALYSIS, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.232
1I5O CRYSTAL STRUCTURE OF MUTANT R105A OF E. COLI ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE 提交 2001-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
突变：R105A 突变：R105A ZN ZINC ION × 6 PAL N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；293 K；Tris buffer, maleic acid, pH 5.7, MICRODIALYSIS, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.212
1NBE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE REGULATORY CHAIN MUTANT (T82A) 提交 1998-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
突变：T82A 突变：T82A MLT D-MALATE × 12 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.85；7.5 MG/ML PROTEIN DIALYZED AGAINST 100MM MALIC ACID AT PH 5.85,
分辨率 2.60 Å R-free 0.237
1Q95 Aspartate Transcarbamylase (ATCase) of Escherichia coli: A New Crystalline R State Bound to PALA, or to Product Analogues Phosphate and Citrate 提交 2003-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 B 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
链 D 1–310（310 aa）
链 E 1–310（310 aa）
链 F 1–310（310 aa）
未记录 PAL N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；PEG-mmes 2000, lithium sulfate, sodium azide, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.46 Å R-free 0.270
1R0B Aspartate Transcarbamylase (ATCase) of Escherichia coli: A New Crystalline R State Bound to PALA, or to Product Analogues Phosphate and Citrate 提交 2003-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 B 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
链 D 1–310（310 aa）
链 E 1–310（310 aa）
链 F 1–310（310 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.8；294 K；sodium citrate, sodium phosphate, N-ethylmorpholine, pH 5.8, MICRODIALYSIS, temperature 294K
分辨率 2.90 Å R-free 0.300
1R0C Products in the T State of Aspartate Transcarbamylase: Crystal Structure of the Phosphate and N-carbamyl-L-aspartate Ligated Enzyme 提交 2003-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 G 1–310（310 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 6 NCD N-CARBAMOYL-L-ASPARTATE × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；PEG 4000, Hepes-Na, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.37 Å R-free 0.274
1RAA CRYSTAL STRUCTURE OF CTP-LIGATED T STATE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR ATCASE MUTANTS AND THE MECHANISM OF NEGATIVE COOPERATIVITY 提交 1992-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1RAB CRYSTAL STRUCTURE OF CTP-LIGATED T STATE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR ATCASE MUTANTS AND THE MECHANISM OF NEGATIVE COOPERATIVITY 提交 1992-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1RAC CRYSTAL STRUCTURE OF CTP-LIGATED T STATE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR ATCASE MUTANTS AND THE MECHANISM OF NEGATIVE COOPERATIVITY 提交 1992-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1RAD CRYSTAL STRUCTURE OF CTP-LIGATED T STATE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR ATCASE MUTANTS AND THE MECHANISM OF NEGATIVE COOPERATIVITY 提交 1992-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1RAE CRYSTAL STRUCTURE OF CTP-LIGATED T STATE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR ATCASE MUTANTS AND THE MECHANISM OF NEGATIVE COOPERATIVITY 提交 1992-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1RAF CRYSTAL STRUCTURE OF CTP-LIGATED T STATE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR ATCASE MUTANTS AND THE MECHANISM OF NEGATIVE COOPERATIVITY 提交 1992-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1RAG CRYSTAL STRUCTURE OF CTP-LIGATED T STATE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR ATCASE MUTANTS AND THE MECHANISM OF NEGATIVE COOPERATIVITY 提交 1992-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1RAH CRYSTAL STRUCTURE OF CTP-LIGATED T STATE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR ATCASE MUTANTS AND THE MECHANISM OF NEGATIVE COOPERATIVITY 提交 1992-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1RAI CRYSTAL STRUCTURE OF CTP-LIGATED T STATE ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR ATCASE MUTANTS AND THE MECHANISM OF NEGATIVE COOPERATIVITY 提交 1992-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1SKU E. coli Aspartate Transcarbamylase 240's Loop Mutant (K244N) 提交 2004-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
突变：K244N 突变：K244N MLI MALONATE ION × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；Prior to crystallization the enzyme was dialyzed into 40 mM KH2PO4, 2.0 mM 2-mercaptoethanol, 0.2 mM EDTA, pH 7.0 for 24 hours. Single crystals of the K244N mutant were obtained by mixing a 20 mg/ml filtered solution (0.22 m) of the K244N enzyme with a solution of 17% (w/v) PEG 1450, 50 mM malonate, 0.2 mM EDTA, 1 mM sodium azide and 20 mM Bis-Tris buffer pH 7.0 in a 1:1 ratio (v/v), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.231
1TTH Aspartate Transcarbamoylase Catalytic Chain Mutant Glu50Ala Complexed with N-(Phosphonacetyl-L-Aspartate) (PALA) 提交 2004-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
突变：E50A 突变：E50A PAL N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；295 K；50 mM maleic-acid-N-ethyl-morpholine buffer (pH 5.84) containing 3 mM sodium azide and 1 mM PALA, pH 5.90, MICRODIALYSIS, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.264
1TU0 Aspartate Transcarbamoylase Catalytic Chain Mutant E50A Complex with Phosphonoacetamide 提交 2004-06-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
突变：E50A 突变：E50A PCT PHOSPHONOACETAMIDE × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；295 K；The Glu50Ala mutant was crystallized in 100 mM sodium citrate, 1 mM 2-mercaptoethanol, and 15% PEG 8000 pH 7.0. Before mounting, 50 mM PAM was added and the crystal soaked, pH 6.0, MICRODIALYSIS, temperature 295K, pH 6.00
分辨率 2.55 Å R-free 0.279
1TUG Aspartate Transcarbamoylase Catalytic Chain Mutant E50A Complex with Phosphonoacetamide, Malonate, and Cytidine-5-Prime-Triphosphate (CTP) 提交 2004-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
突变：E50A 突变：E50A MLI MALONATE ION × 6 PCT PHOSPHONOACETAMIDE × 6 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；295 K；100 mM sodium citrate, 1 mM 2-mercaptoethanol, 0.2 mM EDTA and 1.0 mM CTP pH 6.0 then soaked for 24 hours in 100 mM malonate, 2 mM CTP, 3 mM sodium azide, 2 mM 2-mercaptoethanol, and 15% PEG 8000 pH 7.0. Before mounting, 50 mM PAM was added and the crystal allowed to soak until data collected., MICRODIALYSIS, temperature 295K, pH 6.00
分辨率 2.10 Å R-free 0.272
1XJW The Structure of E. coli Aspartate Transcarbamoylase Q137A Mutant in The R-State 提交 2004-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
突变：Q137A 突变：Q137A PAL N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.9；295 K；12 mg/ml Buffer 50 mM Maleic Acid, 3 mM Sodium Azide 1 mM N-Phosphonacetyl-L-Aspartate, pH 5.9, MICRODIALYSIS, temperature 295K
分辨率 2.71 Å R-free 0.223
2A0F Structure of D236A mutant E. coli Aspartate Transcarbamoylase in presence of Phosphonoacetamide at 2.90 A resolution 提交 2005-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
突变：D236A 突变：D236A PCT PHOSPHONOACETAMIDE × 3 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；298 K；maleic acid, sodium azide, phosphonoacetamide, pH 5.7, MICRODIALYSIS, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.279
2AIR T-state Active Site of Aspartate Transcarbamylase:Crystal Structure of the Carbamyl Phosphate and L-alanosine Ligated Enzyme 提交 2005-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 G 1–310（310 aa）
未记录 CP PHOSPHORIC ACID MONO(FORMAMIDE)ESTER × 6 AL0 3-[HYDROXY(NITROSO)AMINO]-L-ALANINE × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；PEG-4000, iso-propranol, sodium azide, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.00 Å R-free 0.273
2AT1 CRYSTAL STRUCTURES OF PHOSPHONOACETAMIDE LIGATED T AND PHOSPHONOACETAMIDE AND MALONATE LIGATED R STATES OF ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE AT 2.8-ANGSTROMS RESOLUTION AND NEUTRAL PH 提交 1989-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 PCT PHOSPHONOACETAMIDE × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
2ATC CRYSTAL AND MOLECULAR STRUCTURES OF NATIVE AND CTP-LIGANDED ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE FROM ESCHERICHIA COLI 提交 1982-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
2FZC The Structure of Wild-Type E. Coli Aspartate Transcarbamoylase in Complex with Novel T State Inhibitors at 2.10 Resolution 提交 2006-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 EOP {ETHANE-1,2-DIYLBIS[IMINO(2-OXOETHANE-2,1-DIYL)]}BIS(PHOSPHONIC ACID) × 6 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；298 K；ATCase holoenzyme was crystallized by microdialysis, using 50 L wells. The enzyme solution, at ~18 mg/mL, was dialyzed against a solution of 40 mM citric acid, 3 mM sodium azide, 1 mM 2-mercaptoethanol, 1 mM cytidine 5 -triphosphate, 0.2 mM EDTA (pH 5.7) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.250
2FZG The Structure of Wild-Type E. Coli Aspartate Transcarbamoylase in Complex with Novel T State Inhibitors at 2.25 Resolution 提交 2006-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 EOB {1,3-PHENYLENEBIS[IMINO(2-OXOETHANE-2,1-DIYL)]}BIS(PHOSPHONIC ACID) × 6 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；298 K；ATCase holoenzyme was crystallized by microdialysis, using 50 L wells. The enzyme solution, at ~18 mg/mL, was dialyzed against a solution of 40 mM citric acid, 3 mM sodium azide, 1 mM 2-mercaptoethanol, 1 mM cytidine 5 -triphosphate, 0.2 mM EDTA (pH 5.7), MICRODIALYSIS, temperature 298K
分辨率 2.25 Å R-free 0.237
2FZK The Structure of Wild-Type E. Coli Aspartate Transcarbamoylase in Complex with Novel T State Inhibitors at 2.50 Resolution 提交 2006-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 EOZ 3,5-BIS[(PHOSPHONOACETYL)AMINO]BENZOIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；298 K；ATCase holoenzyme was crystallized by microdialysis, using 50 L wells. The enzyme solution, at ~18 mg/mL, was dialyzed against a solution of 40 mM citric acid, 3 mM sodium azide, 1 mM 2-mercaptoethanol, 1 mM cytidine 5 -triphosphate, 0.2 mM EDTA (pH 5.7), MICRODIALYSIS, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.239
2H3E Structure of wild-type E. coli Aspartate Transcarbamoylase in the presence of N-phosphonacetyl-L-isoasparagine at 2.3A resolution 提交 2006-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 6PR (S)-4-AMINO-4-OXO-3-(2-PHOSPHONOACETAMIDO)BUTANOIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；293 K；50 mM Maleic acid, 3 mM sodium azide, 1 mM N-phosphonacetyl-L-isoasparagine, pH 5.7, MICRODIALYSIS, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.250
2HSE Structure of D236A E. coli Aspartate Transcarbamoylase in the presence of phosphonoacetamide and l-Aspartate at 2.60 A resolution 提交 2006-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 PCT PHOSPHONOACETAMIDE × 6 ASP ASPARTIC ACID × 9 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.8；293 K；50mM maleic acid, 3mM sodium azide, 10mM phosphonoacetamide, 20mM L-aspartate, pH 5.8, MICRODIALYSIS, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
2IPO E. coli Aspartate Transcarbamoylase complexed with N-phosphonacetyl-L-asparagine 提交 2006-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 1IP N~2~-(PHOSPHONOACETYL)-L-ASPARAGINE × 6 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6 ZN ZINC ION × 6 MAE MALEIC ACID × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；295 K；50 mM Maleic acid, 1 mM N-phosphonacetyl-L-asparagine, 3 mM Sodium Azide, pH 5.7, MICRODIALYSIS, temperature 295K
分辨率 2.60 Å R-free 0.253
2QG9 Structure of a regulatory subunit mutant D19A of ATCase from E. coli 提交 2007-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；298 K；0.1M citrate buffer, pH 5.7, MICRODIALYSIS, temperature 298.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.244
2QGF Structure of regulatory chain mutant H20A of asparate transcarbamoylase from E. coli 提交 2007-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；298 K；0.1M citric acid, pH 5.7, MICRODIALYSIS, temperature 298.0K
分辨率 2.20 Å R-free 0.223
3AT1 CRYSTAL STRUCTURES OF PHOSPHONOACETAMIDE LIGATED T AND PHOSPHONOACETAMIDE AND MALONATE LIGATED R STATES OF ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE AT 2.8-ANGSTROMS RESOLUTION AND NEUTRAL PH 提交 1989-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 PCT PHOSPHONOACETAMIDE × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
3CSU CATALYTIC TRIMER OF ESCHERICHIA COLI ASPARTATE TRANSCARBAMOYLASE 提交 1999-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–310（310 aa） 片段：CATALYTIC SUBUNIT
链 B 1–310（310 aa） 片段：CATALYTIC SUBUNIT
链 C 1–310（310 aa） 片段：CATALYTIC SUBUNIT
未记录 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.8；pH 7.8
分辨率 1.88 Å R-free 0.291
3D7S Crystal structure of Wild-Type E. Coli Asparate Transcarbamoylase at pH 8.5 at 2.80 A Resolution 提交 2008-05-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；50 mM Tris 8K PEG, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.235
3MPU Crystal structure of the C47A/A241C disulfide-linked E. coli Aspartate Transcarbamoylase holoenzyme 提交 2010-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
突变：C47A, A241C 突变：C47A, A241C PO4 PHOSPHATE ION × 12 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.9；293 K；Protein at 10 mg/ml was dialyzed against solution containing 100 mM KH2PO4, 3mM NaN3, pH 5.9, MICRODIALYSIS, temperature 293K
分辨率 2.85 Å R-free 0.240
3MPU Crystal structure of the C47A/A241C disulfide-linked E. coli Aspartate Transcarbamoylase holoenzyme 提交 2010-04-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 2–311（310 aa）
突变：C47A, A241C PO4 PHOSPHATE ION × 12 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.9；293 K；Protein at 10 mg/ml was dialyzed against solution containing 100 mM KH2PO4, 3mM NaN3, pH 5.9, MICRODIALYSIS, temperature 293K
分辨率 2.85 Å R-free 0.240
3NPM Crystal Structure of the C47A/A241C disulfide-linked C6 Aspartate Transcarbamoylase enzyme 提交 2010-06-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–311（310 aa）
突变：A48C; C242A PO4 PHOSPHATE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10 mg/mL of C47A/A241C c6 in 100 mM tris-acetate pH 8.3, in a 1:1 ratio (v/v), with reservoir. Crystallization buffer consisted of 40% PEG 1000, 100 mM NH4H2PO4, and 100 mM HEPES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.205
4AT1 STRUCTURAL CONSEQUENCES OF EFFECTOR BINDING TO THE T STATE OF ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE. CRYSTAL STRUCTURES OF THE UNLIGATED AND ATP-, AND CTP-COMPLEXED ENZYMES AT 2.6-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
4E2F Crystal Structure of E. coli Aspartate Transcarbamoylase K164E/E239K Mutant in an intermediate state 提交 2012-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
链 E 2–311（310 aa）
链 G 2–311（310 aa）
链 I 2–311（310 aa）
链 K 2–311（310 aa）
突变：K164E, E239K 突变：K164E, E239K 突变：K164E, E239K 突变：K164E, E239K 突变：K164E, E239K 突变：K164E, E239K ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.75；293 K；16% (w/v) PEG 4000, 0.04 M Na2MoO4, 0.04 M N-cyclohexyl-3-aminopropanesulfonic acid, 30 mM Tris-acetate, pH 8.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.274
4F04 A Second Allosteric site in E. coli Aspartate Transcarbamoylase: R-state ATCase with UTP bound 提交 2012-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 PAL N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 6 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.95；298 K；50 mM maleic acid, 3 mM sodium azide, 1 mM PALA, adjusted to pH=5.95 with N-ethylmorpholine, MICRODIALYSIS, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.207
4FYV Aspartate Transcarbamoylase Complexed with dCTP 提交 2012-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ZN ZINC ION × 6 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；298 K；40 mM sodium citrate, 1 mM 2-mercaptoethanol, 0.2 mM EDTA, 1.0 mM dCTP, pH 5.7, MICRODIALYSIS, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.215
4FYW E. coli Aspartate Transcarbamoylase complexed with CTP 提交 2012-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；298 K；40 mM sodium citrate, 1 mM 2-mercaptoethanol, 0.2 mM EDTA, 1.0 mM CTP, pH 5.7, MICRODIALYSIS, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4FYX E. coli Aspartate Transcarbamoylase complexed with dCTP, UTP, and Mg2+ 提交 2012-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 6 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；298 K；40 mM sodium citrate, 1 mM 2-mercaptoethanol, 0.2 mM EDTA, 1.0 mM dCTP, pH 5.7 (crystals soaked in 5 mM UTP and 5 mM Mg2+), MICRODIALYSIS, temperature 298K
分辨率 2.09 Å R-free 0.212
4FYY E. coli Aspartate Transcarbamoylase Complexed with CTP, UTP, and Mg2+ 提交 2012-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICRODIALYSIS；pH 5.7；298 K；40 mM sodium citrate, 1 mM 2-mercaptoethanol, 0.2 mM EDTA, 1.0 mM CTP, pH 5.7 (crystals soaked in 5 mM UTP and 5 mM Mg2+), MICRODIALYSIS, temperature 298K
分辨率 1.94 Å R-free 0.236
5AT1 STRUCTURAL CONSEQUENCES OF EFFECTOR BINDING TO THE T STATE OF ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE. CRYSTAL STRUCTURES OF THE UNLIGATED AND ATP-, AND CTP-COMPLEXED ENZYMES AT 2.6-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
6AT1 STRUCTURAL CONSEQUENCES OF EFFECTOR BINDING TO THE T STATE OF ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE. CRYSTAL STRUCTURES OF THE UNLIGATED AND ATP-, AND CTP-COMPLEXED ENZYMES AT 2.6-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å
6KJ8 E. coli ATCase holoenzyme mutant - G166P (catalytic chain) 提交 2019-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
链 E 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH 7.0, 30% Jeffamine M-600 pH 7.0, and 10% glycerol
分辨率 3.01 Å R-free 0.247
6KJ9 E. coli ATCase catalytic subunit mutant - G128/130A 提交 2019-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–311（310 aa）
链 B 2–311（310 aa）
链 E 2–311（310 aa）
突变：G128A, G130A 突变：G128A, G130A 突变：G128A, G130A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4Ac, 0.1M Tris pH 8.5, 20% PEG3350, and 10% glycerol
分辨率 2.50 Å R-free 0.228
6KJ9 E. coli ATCase catalytic subunit mutant - G128/130A 提交 2019-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–311（310 aa）
链 D 2–311（310 aa）
链 F 2–311（310 aa）
突变：G128A, G130A 突变：G128A, G130A 突变：G128A, G130A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M NH4Ac, 0.1M Tris pH 8.5, 20% PEG3350, and 10% glycerol
分辨率 2.50 Å R-free 0.228
6KJA E. coli ATCase holoenzyme mutant - G128/130A (catalytic chain) 提交 2019-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
链 C 2–311（310 aa）
链 E 2–311（310 aa）
突变：G128A, G130A 突变：G128A, G130A 突变：G128A, G130A ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 30% Jeffamine M-600 pH 7.0, and 10% glycerol
分辨率 3.06 Å R-free 0.283
6KJB wild-type apo-form E. coli ATCase holoenzyme with an unusual open conformation of R167 提交 2019-07-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–311（310 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M MES pH 6.0 10% Glycerol and 10% PEG 8000
分辨率 2.06 Å R-free 0.223
7AT1 CRYSTAL STRUCTURES OF ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE LIGATED WITH PHOSPHONOACETAMIDE, MALONATE, AND CTP OR ATP AT 2.8-ANGSTROMS RESOLUTION AND NEUTRAL P*H 提交 1989-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 PCT PHOSPHONOACETAMIDE × 6 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 THE CRYSTALS WERE GROWN IN A SOLUTION OF PHOSPHONACETAMIDE (PAM) AND MALONATE (MAL) AT PH 5.8. THEY WERE THEN SOAKED IN A SOLUTION CONTAINING PAM, MAL, AND ATP AT PH 7.0.
分辨率 2.80 Å
8AT1 CRYSTAL STRUCTURES OF ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE LIGATED WITH PHOSPHONOACETAMIDE, MALONATE, AND CTP OR ATP AT 2.8-ANGSTROMS RESOLUTION AND NEUTRAL P*H 提交 1989-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 PCT PHOSPHONOACETAMIDE × 6 ZN ZINC ION × 6 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 THE CRYSTALS WERE GROWN IN A SOLUTION OF PHOSPHONACETAMIDE (PAM) AND MALONATE (MAL) AT PH 5.8. THEY WERE THEN SOAKED IN A SOLUTION CONTAINING PAM, MAL, AND CTP AT PH 7.0.
分辨率 2.80 Å
8ATC COMPLEX OF N-PHOSPHONACETYL-L-ASPARTATE WITH ASPARTATE CARBAMOYLTRANSFERASE. X-RAY REFINEMENT, ANALYSIS OF CONFORMATIONAL CHANGES AND CATALYTIC AND ALLOSTERIC MECHANISMS 提交 1989-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
链 C 1–310（310 aa）
未记录 PAL N-(PHOSPHONACETYL)-L-ASPARTIC ACID × 6 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
9ATC ATCASE Y165F MUTANT 提交 1998-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–310（310 aa）
突变：CHAIN A, Y165F ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.3；pH 6.3
分辨率 2.40 Å R-free 0.344

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 PYRB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–310； UniProt 2–311

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6kj7

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6kj7
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6kj7
沉积日期 deposition_date2019-07-21
结构标题 titleE. coli ATCase catalytic subunit mutant - G166P
关键词 keywordsaspartate transcarbamoylase catalytic subunit, de novo pyrimidine biosynthesis, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier20.13 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron19.07 Å
零角强度 I(0) i016831700.00
分子量 molecular_weight31256.0 kDa
排除体积 excluded_volume39234 ų
包络体积 envelope_volume44791 ų
水化壳体积 shell_volume19709 ų
包络直径 envelope_diameter63.5 Å
壳层 Rg shell_rg25.25 Å
包络 Rg envelope_rg19.26 Å
形状 Rg shape_rg19.08 Å
总 Rg total_rg19.90 Å
总原子数 total_atoms2202
残基数 n_residues281
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax63.4 Å
Rg (实空间) rg_real20.07 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.32 Å
I(0) (实空间) i0_real1.6830e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.1720e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal20.08 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal16830000.0000
解质量估计 total_estimate0.9006
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary23.5 Å
偏度 Skewness skewness0.275
峰度 Kurtosis kurtosis-0.380
角度范围 angular_range— – 0.3950 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha4123000.0000
实空间数据点数 n_real_points71
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.903; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.998
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id6kj7A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1370 — Aspartate/ornithine carbamoyltransferase
结构域编号 domain_id6kj7A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1370 — Aspartate/ornithine carbamoyltransferase
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)