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6l37

X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW9662-ciprofibrate co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 99.3 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peroxisome proliferator-activated receptor alpha

Homo sapiens

UniProt Q07869

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 200–468 未记录 GW9 2-chloro-5-nitro-N-phenylbenzamide × 3 C5F 2-{4-[(1S)-2,2-dichlorocyclopropyl]phenoxy}-2-methylpropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 25 %(w/v) PEG3350 分辨率 2.91 Å R-free 0.248
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 200–468 未记录 GW9 2-chloro-5-nitro-N-phenylbenzamide × 3 C5F 2-{4-[(1S)-2,2-dichlorocyclopropyl]phenoxy}-2-methylpropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 25 %(w/v) PEG3350 分辨率 2.91 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6L37 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1I7G CRYSTAL STRUCTURE OF THE LIGAND BINDING DOMAIN FROM HUMAN PPAR-ALPHA IN COMPLEX WITH THE AGONIST AZ 242 提交 2001-03-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 196–468（273 aa） 片段：LIGAND BINDING DOMAIN
未记录 NA SODIUM ION × 1 AZ2 (2S)-2-ETHOXY-3-[4-(2-{4-[(METHYLSULFONYL)OXY]PHENYL}ETHOXY)PHENYL]PROPANOIC ACID × 1 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；Sodium Formate, Hepes, DEOXY-BIGCHAP, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.271
1K7L The 2.5 Angstrom resolution crystal structure of the human PPARalpha ligand binding domain bound with GW409544 and a co-activator peptide. 提交 2001-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 192–468（277 aa） 片段：ligand binding domain - residues 192 - 468
未记录 544 2-(1-METHYL-3-OXO-3-PHENYL-PROPYLAMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-OXAZOL-4-YL)-ETHOXY]-PHENYL}-PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 3350, NaNO3, hexanediol, YCl3, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.284
1K7L The 2.5 Angstrom resolution crystal structure of the human PPARalpha ligand binding domain bound with GW409544 and a co-activator peptide. 提交 2001-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 192–468（277 aa） 片段：ligand binding domain - residues 192 - 468
未记录 544 2-(1-METHYL-3-OXO-3-PHENYL-PROPYLAMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-OXAZOL-4-YL)-ETHOXY]-PHENYL}-PROPIONIC ACID × 1 YT3 YTTRIUM (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 3350, NaNO3, hexanediol, YCl3, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.284
1K7L The 2.5 Angstrom resolution crystal structure of the human PPARalpha ligand binding domain bound with GW409544 and a co-activator peptide. 提交 2001-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 192–468（277 aa） 片段：ligand binding domain - residues 192 - 468
未记录 544 2-(1-METHYL-3-OXO-3-PHENYL-PROPYLAMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-OXAZOL-4-YL)-ETHOXY]-PHENYL}-PROPIONIC ACID × 1 YT3 YTTRIUM (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 3350, NaNO3, hexanediol, YCl3, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.284
1K7L The 2.5 Angstrom resolution crystal structure of the human PPARalpha ligand binding domain bound with GW409544 and a co-activator peptide. 提交 2001-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 192–468（277 aa） 片段：ligand binding domain - residues 192 - 468
未记录 544 2-(1-METHYL-3-OXO-3-PHENYL-PROPYLAMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-OXAZOL-4-YL)-ETHOXY]-PHENYL}-PROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 3350, NaNO3, hexanediol, YCl3, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.284
1KKQ Crystal structure of the human PPAR-alpha ligand-binding domain in complex with an antagonist GW6471 and a SMRT corepressor motif 提交 2001-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa） 片段：PPAR-alpha LBD
未记录 471 N-((2S)-2-({(1Z)-1-METHYL-3-OXO-3-[4-(TRIFLUOROMETHYL) PHENYL]PROP-1-ENYL}AMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-1,3-OXAZOL-4-YL)ETHOXY]PHENYL}PROPYL)PROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG35K, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.290
1KKQ Crystal structure of the human PPAR-alpha ligand-binding domain in complex with an antagonist GW6471 and a SMRT corepressor motif 提交 2001-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 200–468（269 aa） 片段：PPAR-alpha LBD
未记录 471 N-((2S)-2-({(1Z)-1-METHYL-3-OXO-3-[4-(TRIFLUOROMETHYL) PHENYL]PROP-1-ENYL}AMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-1,3-OXAZOL-4-YL)ETHOXY]PHENYL}PROPYL)PROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG35K, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.290
1KKQ Crystal structure of the human PPAR-alpha ligand-binding domain in complex with an antagonist GW6471 and a SMRT corepressor motif 提交 2001-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 200–468（269 aa） 片段：PPAR-alpha LBD
未记录 471 N-((2S)-2-({(1Z)-1-METHYL-3-OXO-3-[4-(TRIFLUOROMETHYL) PHENYL]PROP-1-ENYL}AMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-1,3-OXAZOL-4-YL)ETHOXY]PHENYL}PROPYL)PROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG35K, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.290
1KKQ Crystal structure of the human PPAR-alpha ligand-binding domain in complex with an antagonist GW6471 and a SMRT corepressor motif 提交 2001-12-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 200–468（269 aa） 片段：PPAR-alpha LBD
未记录 471 N-((2S)-2-({(1Z)-1-METHYL-3-OXO-3-[4-(TRIFLUOROMETHYL) PHENYL]PROP-1-ENYL}AMINO)-3-{4-[2-(5-METHYL-2-PHENYL-1,3-OXAZOL-4-YL)ETHOXY]PHENYL}PROPYL)PROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG35K, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.290
2NPA the crystal structure of the human PPARaplpha ligand binding domain in complex with a a-hydroxyimino phenylpropanoic acid 提交 2006-10-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 199–468（270 aa） 片段：ligand binding domain
未记录 MMB (2R,3E)-2-{4-[(5-METHYL-2-PHENYL-1,3-OXAZOL-4-YL)METHOXY]BENZYL}-3-(PROPOXYIMINO)BUTANOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 10K. 0.1M Hepes, 6% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.260
2NPA the crystal structure of the human PPARaplpha ligand binding domain in complex with a a-hydroxyimino phenylpropanoic acid 提交 2006-10-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 199–468（270 aa） 片段：ligand binding domain
未记录 MMB (2R,3E)-2-{4-[(5-METHYL-2-PHENYL-1,3-OXAZOL-4-YL)METHOXY]BENZYL}-3-(PROPOXYIMINO)BUTANOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；6% PEG 10K. 0.1M Hepes, 6% ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.260
2P54 a crystal structure of PPAR alpha bound with SRC1 peptide and GW735 提交 2007-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 202–468（267 aa） 片段：PPAR alpha
未记录 735 2-METHYL-2-(4-{[({4-METHYL-2-[4-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]-1,3-THIAZOL-5-YL}CARBONYL)AMINO]METHYL}PHENOXY)PROPANOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；7% PEG 3350, 200 mM NaF, 12% 2,5-hexanediol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.79 Å R-free 0.227
2REW Crystal Structure of PPARalpha ligand binding domain with BMS-631707 提交 2007-09-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 196–468（273 aa） 片段：ligand binding domain, residues 196-468
未记录 CPQ N,N-BIS(3-D-GLUCONAMIDOPROPYL)DEOXYCHOLAMIDE × 1 REW (2S,3S)-1-(4-METHOXYPHENYL)-3-(3-(2-(5-METHYL-2-PHENYLOXAZOL-4-YL)ETHOXY)BENZYL)-4-OXOAZETIDINE-2-CARBOXYLIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å R-free 0.245
2ZNN Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with a synthetic agonist TIPP703 提交 2008-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa） 片段：Ligand binding domain
未记录 S44 (2S)-2-(4-propoxy-3-{[({4-[(3S,5S,7S)-tricyclo[3.3.1.1~3,7~]dec-1-yl]phenyl}carbonyl)amino]methyl}benzyl)butanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG3350, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.01 Å R-free 0.253
3ET1 Structure of PPARalpha with 3-[5-Methoxy-1-(4-methoxy-benzenesulfonyl)-1H-indol-3-yl]-propionic acid 提交 2008-10-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 199–468（270 aa） 片段：LIGAND BINDING DOMAIN
未记录 ET1 3-{5-methoxy-1-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-1H-indol-3-yl}propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；277 K；The purified PPARa LBD protein was diluted to 10 mg/ml and 1mM of indeglitazar and 2x molar excess of SRC-1 peptide were added prior to crystallization by mixing equal volumes of protein/compound sample with reservoir solution containing 16% PEG 8000, 0.1 M Tris buffer at pH 8.0, 0.02 M lithium sulfate, and 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.258
3ET1 Structure of PPARalpha with 3-[5-Methoxy-1-(4-methoxy-benzenesulfonyl)-1H-indol-3-yl]-propionic acid 提交 2008-10-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 199–468（270 aa） 片段：LIGAND BINDING DOMAIN
未记录 ET1 3-{5-methoxy-1-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-1H-indol-3-yl}propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；277 K；The purified PPARa LBD protein was diluted to 10 mg/ml and 1mM of indeglitazar and 2x molar excess of SRC-1 peptide were added prior to crystallization by mixing equal volumes of protein/compound sample with reservoir solution containing 16% PEG 8000, 0.1 M Tris buffer at pH 8.0, 0.02 M lithium sulfate, and 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.258
3FEI Design and biological evaluation of novel, balanced dual PPARa/g agonists 提交 2008-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 202–468（267 aa） 片段：PPARalpha ligand binding domain
未记录 CTM (2S)-3-(4-{[2-(4-chlorophenyl)-1,3-thiazol-4-yl]methoxy}-2-methylphenyl)-2-ethoxypropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1M Tris, 0.2M MgCl2, 25% PEG3350, 15% Glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.260
3G8I Aleglitazar, a new, potent, and balanced PPAR alpha/gamma agonist for the treatment of type II diabetes 提交 2009-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 199–468（270 aa） 片段：Ligand bind domain
未记录 RO7 (2S)-2-methoxy-3-{4-[2-(5-methyl-2-phenyl-1,3-oxazol-4-yl)ethoxy]-1-benzothiophen-7-yl}propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；20-22% PEG 2000, 0.2M NACL, 5% GLYCEROL, 0.1M TRIS-CL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.261
3KDT Crystal structure of peroxisome proliferator-activatedeceptor alpha (PPARalpha) complex with N-3-((2-(4-Chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl)methoxy)benzyl)-N-(methoxycarbonyl)glycine 提交 2009-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 196–468（273 aa） 片段：Ligand-binding domain: UNP residues 196-468
链 B 196–468（273 aa） 片段：Ligand-binding domain: UNP residues 196-468
未记录 7HA N-(3-{[2-(4-chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl]methoxy}benzyl)-N-(methoxycarbonyl)glycine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；PEG 4000, Ammonium and magnesium acetate, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.316
3KDT Crystal structure of peroxisome proliferator-activatedeceptor alpha (PPARalpha) complex with N-3-((2-(4-Chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl)methoxy)benzyl)-N-(methoxycarbonyl)glycine 提交 2009-10-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 196–468（273 aa） 片段：Ligand-binding domain: UNP residues 196-468
未记录 7HA N-(3-{[2-(4-chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl]methoxy}benzyl)-N-(methoxycarbonyl)glycine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；PEG 4000, Ammonium and magnesium acetate, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.316
3KDT Crystal structure of peroxisome proliferator-activatedeceptor alpha (PPARalpha) complex with N-3-((2-(4-Chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl)methoxy)benzyl)-N-(methoxycarbonyl)glycine 提交 2009-10-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 196–468（273 aa） 片段：Ligand-binding domain: UNP residues 196-468
未记录 7HA N-(3-{[2-(4-chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl]methoxy}benzyl)-N-(methoxycarbonyl)glycine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；PEG 4000, Ammonium and magnesium acetate, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.316
3KDU Crystal structure of peroxisome proliferator-activatedeceptor alpha (PPARalpha) complex with N-3-((2-(4-Chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl)methoxy)benzyl)-N-((4-methylphenoxy)carbonyl)glycine 提交 2009-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 196–468（273 aa） 片段：Ligand-binding domain: UNP residues 196-468
链 B 196–468（273 aa） 片段：Ligand-binding domain: UNP residues 196-468
未记录 NKS N-(3-{[2-(4-chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl]methoxy}benzyl)-N-[(4-methylphenoxy)carbonyl]glycine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；PEG 4000, Ammonium and magnesium acetate, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.07 Å R-free 0.239
3KDU Crystal structure of peroxisome proliferator-activatedeceptor alpha (PPARalpha) complex with N-3-((2-(4-Chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl)methoxy)benzyl)-N-((4-methylphenoxy)carbonyl)glycine 提交 2009-10-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 196–468（273 aa） 片段：Ligand-binding domain: UNP residues 196-468
未记录 NKS N-(3-{[2-(4-chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl]methoxy}benzyl)-N-[(4-methylphenoxy)carbonyl]glycine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；PEG 4000, Ammonium and magnesium acetate, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.07 Å R-free 0.239
3KDU Crystal structure of peroxisome proliferator-activatedeceptor alpha (PPARalpha) complex with N-3-((2-(4-Chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl)methoxy)benzyl)-N-((4-methylphenoxy)carbonyl)glycine 提交 2009-10-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 196–468（273 aa） 片段：Ligand-binding domain: UNP residues 196-468
未记录 NKS N-(3-{[2-(4-chlorophenyl)-5-methyl-1,3-oxazol-4-yl]methoxy}benzyl)-N-[(4-methylphenoxy)carbonyl]glycine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；PEG 4000, Ammonium and magnesium acetate, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.07 Å R-free 0.239
3SP6 Structural basis for iloprost as a dual PPARalpha/delta agonist 提交 2011-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 196–468（273 aa）
未记录 IL2 (5E)-5-[(3aS,4R,5R,6aS)-5-hydroxy-4-[(1E,3S,4R)-3-hydroxy-4-methyloct-1-en-6-yn-1-yl]hexahydropentalen-2(1H)-ylidene]pentanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；15% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.239
3VI8 Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with a synthetic agonist APHM13 提交 2011-09-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa） 片段：Ligand binding domain
未记录 13M (2S)-2-(4-methoxy-3-{[(pyren-1-ylcarbonyl)amino]methyl}benzyl)butanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG3350, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.249
4BCR Structure of PPARalpha in complex with WY14643 提交 2012-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 195–468（274 aa） 片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 195-468
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 WY1 2-({4-CHLORO-6-[(2,3-DIMETHYLPHENYL)AMINO]PYRIMIDIN-2-YL}SULFANYL)ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 100 MM TRIS-HCL PH 7.5, 25% PEG 20 K
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
4BCR Structure of PPARalpha in complex with WY14643 提交 2012-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 195–468（274 aa） 片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 195-468
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 WY1 2-({4-CHLORO-6-[(2,3-DIMETHYLPHENYL)AMINO]PYRIMIDIN-2-YL}SULFANYL)ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 100 MM TRIS-HCL PH 7.5, 25% PEG 20 K
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
4CI4 Structural basis for GL479 a dual Peroxisome Proliferator-Activated Receptor alpha agonist 提交 2013-12-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 195–468（274 aa） 片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESDIUES 195-468
未记录 Y1N 2-methyl-2-[4-[2-[4-[(E)-phenyldiazenyl]phenoxy]ethyl]phenoxy]propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 27% PEG 20000, 0.1 M TRIS-HCL PH 7.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.258
5AZT Ternary complex of hPPARalpha ligand binding domain, 17-oxoDHA and a SRC1 peptide 提交 2015-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 201–468（268 aa） 片段：UNP residues 201-468
突变：F423L 4M5 (4~{Z},7~{Z},10~{Z},13~{Z},19~{Z})-17-oxidanylidenedocosa-4,7,10,13,19-pentaenoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M HEPES, 35% PEG3350
分辨率 3.45 Å R-free 0.308
5AZT Ternary complex of hPPARalpha ligand binding domain, 17-oxoDHA and a SRC1 peptide 提交 2015-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 201–468（268 aa） 片段：UNP residues 201-468
突变：F423L 4M5 (4~{Z},7~{Z},10~{Z},13~{Z},19~{Z})-17-oxidanylidenedocosa-4,7,10,13,19-pentaenoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；0.1M HEPES, 35% PEG3350
分辨率 3.45 Å R-free 0.308
5HYK Crystal structure of the complex PPARalpha/AL26-29 提交 2016-02-01 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 65W 2-methyl-2-[4-(naphthalen-1-yl)phenoxy]propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；PEG 3350 20%, 0,2 M Mg acetate
分辨率 1.83 Å R-free 0.262
6KAX X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-intrinsic fatty acid (E. coli origin) co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.23 Å R-free 0.203
6KAY X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW7647 co-crystals obtained by soaking 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 2VN 2-[(4-{2-[(4-cyclohexylbutyl)(cyclohexylcarbamoyl)amino]ethyl}phenyl)sulfanyl]-2-methylpropanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Bis-Tris(pH 6.5), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.74 Å R-free 0.252
6KAZ X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-pemafibrate co-crystals obtained by soaking 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 P7F (2~{R})-2-[3-[[1,3-benzoxazol-2-yl-[3-(4-methoxyphenoxy)propyl]amino]methyl]phenoxy]butanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Bis-Tris(pH 6.5), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.48 Å R-free 0.198
6KB0 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-5,8,11,14-eicosatetraynoic acid (ETYA) co-crystals obtained by soaking 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ITY icosa-5,8,11,14-tetraynoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Bis-Tris(pH 6.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.35 Å R-free 0.195
6KB1 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-tetradecylthioacetic acid (TTA) co-crystals obtained by soaking 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 T4T 2-tetradecylsulfanylethanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Bis-Tris(pH 6.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.25 Å R-free 0.204
6KB2 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-Wy14643 co-crystals obtained by soaking 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 WY1 2-({4-CHLORO-6-[(2,3-DIMETHYLPHENYL)AMINO]PYRIMIDIN-2-YL}SULFANYL)ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.244
6KB3 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW7647 co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 2VN 2-[(4-{2-[(4-cyclohexylbutyl)(cyclohexylcarbamoyl)amino]ethyl}phenyl)sulfanyl]-2-methylpropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.45 Å R-free 0.208
6KB4 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-pemafibrate co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 P7F (2~{R})-2-[3-[[1,3-benzoxazol-2-yl-[3-(4-methoxyphenoxy)propyl]amino]methyl]phenoxy]butanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.0), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.42 Å R-free 0.195
6KB5 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-5,8,11,14-eicosatetraynoic Acid (ETYA) co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ITY icosa-5,8,11,14-tetraynoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.0), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
6KB6 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-tetradecylthioacetic acid (TTA) co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 T4T 2-tetradecylsulfanylethanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.43 Å R-free 0.193
6KB7 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-Wy14643 co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 WY1 2-({4-CHLORO-6-[(2,3-DIMETHYLPHENYL)AMINO]PYRIMIDIN-2-YL}SULFANYL)ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 2.14 Å R-free 0.238
6KB8 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW7647 co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 2VN 2-[(4-{2-[(4-cyclohexylbutyl)(cyclohexylcarbamoyl)amino]ethyl}phenyl)sulfanyl]-2-methylpropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Bis-Tris (pH 6.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.47 Å R-free 0.218
6KB9 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-pemafibrate co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 P7F (2~{R})-2-[3-[[1,3-benzoxazol-2-yl-[3-(4-methoxyphenoxy)propyl]amino]methyl]phenoxy]butanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.0), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.55 Å R-free 0.198
6KBA X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-Wy14643 co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2019-06-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 WY1 2-({4-CHLORO-6-[(2,3-DIMETHYLPHENYL)AMINO]PYRIMIDIN-2-YL}SULFANYL)ACETIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.82 Å R-free 0.236
6KXX Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with a synthetic agonist (compound A) 提交 2019-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 T02 1-(4-chlorophenyl)-6-methyl-3-propan-2-yl-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM HEPES-NaOH, pH 7.4, 19-23% isopropanol, 19-23% PEG 4000
分辨率 1.95 Å R-free 0.236
6KXY Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with a synthetic agonist (compound B) 提交 2019-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 T06 6-ethyl-1-(4-fluorophenyl)-3-pentan-3-yl-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM HEPES-NaOH, pH 7.4, 19-23% PEG 4000, 19-23% 1,2-propanediol
分辨率 2.00 Å R-free 0.257
6KYP X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW9662-clofibric acid co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2019-09-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GW9 2-chloro-5-nitro-N-phenylbenzamide × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.86 Å R-free 0.244
6KYP X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW9662-clofibric acid co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2019-09-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 200–468（269 aa）
未记录 GW9 2-chloro-5-nitro-N-phenylbenzamide × 3 E0O 2-(4-chloranylphenoxy)-2-methyl-propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.86 Å R-free 0.244
6L36 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW9662-fenofibric acid co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2019-10-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GW9 2-chloro-5-nitro-N-phenylbenzamide × 3 F5A 2-[4-(4-chlorobenzene-1-carbonyl)phenoxy]-2-methylpropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
6L36 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW9662-fenofibric acid co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2019-10-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 200–468（269 aa）
未记录 GW9 2-chloro-5-nitro-N-phenylbenzamide × 3 F5A 2-[4-(4-chlorobenzene-1-carbonyl)phenoxy]-2-methylpropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.249
6L38 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW9662-gemfibrozil co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2019-10-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GW9 2-chloro-5-nitro-N-phenylbenzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.76 Å R-free 0.258
6L38 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW9662-gemfibrozil co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2019-10-09 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 200–468（269 aa）
未记录 GW9 2-chloro-5-nitro-N-phenylbenzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.76 Å R-free 0.258
6L96 Structure of PPARalpha-LBD/pemafibrate/SRC1 peptide 提交 2019-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 194–468（275 aa）
链 B 194–468（275 aa）
未记录 P7F (2~{R})-2-[3-[[1,3-benzoxazol-2-yl-[3-(4-methoxyphenoxy)propyl]amino]methyl]phenoxy]butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；1.2 M ammonium sulfate and 0.1M bis-tris-HCl (pH 6.5)
分辨率 3.20 Å R-free 0.253
6LX4 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-fenofibric acid co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 F5A 2-[4-(4-chlorobenzene-1-carbonyl)phenoxy]-2-methylpropanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.13 Å R-free 0.230
6LX4 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-fenofibric acid co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 200–468（269 aa）
未记录 F5A 2-[4-(4-chlorobenzene-1-carbonyl)phenoxy]-2-methylpropanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.13 Å R-free 0.230
6LX5 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-ciprofibrate co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 C5F 2-{4-[(1S)-2,2-dichlorocyclopropyl]phenoxy}-2-methylpropanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.87 Å R-free 0.221
6LX5 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-ciprofibrate co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 200–468（269 aa）
未记录 C5F 2-{4-[(1S)-2,2-dichlorocyclopropyl]phenoxy}-2-methylpropanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.87 Å R-free 0.221
6LX6 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-palmitic acid co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.30 Å R-free 0.195
6LX7 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-stearic acid co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 STE STEARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.41 Å R-free 0.192
6LX8 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-oleic acid co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 OLA OLEIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.54 Å R-free 0.198
6LX9 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-arachidonic acid co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ACD ARACHIDONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.193
6LXA X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-eicosapentaenoic acid (EPA) co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 EPA 5,8,11,14,17-EICOSAPENTAENOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M HEPES (pH 7.5), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.23 Å R-free 0.196
6LXB X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-saroglitazar co-crystals obtained by soaking 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 EWR (2S)-2-ethoxy-3-[4-[2-[2-methyl-5-(4-methylsulfanylphenyl)pyrrol-1-yl]ethoxy]phenyl]propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Bis-Tris(pH 6.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.239
6LXC X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-saroglitazar co-crystals obtained by delipidation and cross-seeding 提交 2020-02-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 EWR (2S)-2-ethoxy-3-[4-[2-[2-methyl-5-(4-methylsulfanylphenyl)pyrrol-1-yl]ethoxy]phenyl]propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 2.03 Å R-free 0.217
7BPY X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-clofibric acid-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 E0O 2-(4-chloranylphenoxy)-2-methyl-propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 30 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.09 Å R-free 0.215
7BPY X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-clofibric acid-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 200–468（269 aa）
未记录 E0O 2-(4-chloranylphenoxy)-2-methyl-propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 30 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.09 Å R-free 0.215
7BPZ X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-bezafibrate-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2020-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 PEM 2-[P-[2-P-CHLOROBENZAMIDO)ETHYL]PHENOXY]-2-METHYLPROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.43 Å R-free 0.242
7BPZ X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-bezafibrate-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2020-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 200–468（269 aa）
未记录 PEM 2-[P-[2-P-CHLOROBENZAMIDO)ETHYL]PHENOXY]-2-METHYLPROPIONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 2.43 Å R-free 0.242
7BQ0 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-fenofibric acid-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 F5A 2-[4-(4-chlorobenzene-1-carbonyl)phenoxy]-2-methylpropanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.77 Å R-free 0.217
7BQ0 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-fenofibric acid-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 200–468（269 aa）
未记录 F5A 2-[4-(4-chlorobenzene-1-carbonyl)phenoxy]-2-methylpropanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.77 Å R-free 0.217
7BQ1 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-intrinsic fatty acid (E. coli origin)-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2020-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 25 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.52 Å R-free 0.213
7BQ2 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-pemafibrate-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2020-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 P7F (2~{R})-2-[3-[[1,3-benzoxazol-2-yl-[3-(4-methoxyphenoxy)propyl]amino]methyl]phenoxy]butanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.0), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.52 Å R-free 0.206
7BQ3 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW7647-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 2VN 2-[(4-{2-[(4-cyclohexylbutyl)(cyclohexylcarbamoyl)amino]ethyl}phenyl)sulfanyl]-2-methylpropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.98 Å R-free 0.237
7BQ4 X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-eicosapentaenoic acid (EPA)-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization 提交 2020-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 EPA 5,8,11,14,17-EICOSAPENTAENOIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.0), 30 %(w/v) PEG3350
分辨率 1.62 Å R-free 0.214
7C6Q Novel natural PPARalpha agonist with a unique binding mode 提交 2020-05-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 196–468（273 aa）
未记录 SAU 13-methyl[1,3]benzodioxolo[5,6-c][1,3]dioxolo[4,5-i]phenanthridin-13-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.2 M Ammonium formate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.76 Å R-free 0.261
7E5F HUMAN PPAR ALPHA LIGAND BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH TIPP703 OBTAINED BY SOAKING 提交 2021-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 S44 (2S)-2-(4-propoxy-3-{[({4-[(3S,5S,7S)-tricyclo[3.3.1.1~3,7~]dec-1-yl]phenyl}carbonyl)amino]methyl}benzyl)butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, 25% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350
分辨率 1.79 Å R-free 0.229
7E5G HUMAN PPAR ALPHA LIGAND BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH YN4pai OBTAINED BY SOAKING 提交 2021-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 HVX (2S)-2-[[4-butoxy-3-[(pyren-1-ylcarbonylamino)methyl]phenyl]methyl]butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, 25% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350
分辨率 1.66 Å R-free 0.229
7E5H HUMAN PPAR ALPHA LIGAND BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH APHM6 OBTAINED BY COCRYSTALLIZATION 提交 2021-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 HW3 (2S)-2-[[3-[[3-fluoranyl-4-(4-fluoranylphenoxy)phenyl]methylcarbamoyl]-4-methoxy-phenyl]methyl]butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, 25% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350
分辨率 1.66 Å R-free 0.239
7E5I HUMAN PPAR ALPHA LIGAND BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH APHM6 OBTAINED BY SOAKING 提交 2021-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 HW3 (2S)-2-[[3-[[3-fluoranyl-4-(4-fluoranylphenoxy)phenyl]methylcarbamoyl]-4-methoxy-phenyl]methyl]butanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, 25% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350
分辨率 1.58 Å R-free 0.221
8HUK X-ray structure of human PPAR alpha ligand binding domain-lanifibranor-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2022-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 2.98 Å R-free 0.254
8HUK X-ray structure of human PPAR alpha ligand binding domain-lanifibranor-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2022-12-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 200–468（269 aa）
未记录 BJB 4-[1-(1,3-benzothiazol-6-ylsulfonyl)-5-chloro-indol-2-yl]butanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 2.98 Å R-free 0.254
8HUN X-ray structure of human PPAR alpha ligand binding domain-seladelpar co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2022-12-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 KKB Seladelpar × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 2.01 Å R-free 0.228
8HUQ X-ray structure of human PPAR alpha ligand binding domain-elafibranor-SRC1 coactivator peptide co-crystals obtained by soaking 提交 2022-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 MUO 2-[2,6-dimethyl-4-[(~{E})-3-(4-methylsulfanylphenyl)-3-oxidanylidene-prop-1-enyl]phenoxy]-2-methyl-propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1 M Tris (pH 8.5), 25%(w/v) PEG3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.213
8RCE Crystal structure of PPAR alfa Ligand Binding Domain in complex with the ligand LBB78 提交 2023-12-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 WUE (2~{S})-2-(4-naphthalen-1-ylphenoxy)-3-phenyl-propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20 % PEG 3350, 0.2 M Mg acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.300
8YT6 Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with a 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-derived compound 提交 2024-03-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 A1LZX 6-(2-ethoxyethyl)-1-(4-fluorophenyl)-3-pentan-3-yl-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM HEPES-NaOH, 19-23% PEG 4000, 19-23% 1,2-propanediol
分辨率 1.85 Å R-free 0.265
8YT9 Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with a 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-derived compound 提交 2024-03-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 A1LZY 1-(4-fluorophenyl)-6-[2-(5-methyl-2-phenyl-1,3-oxazol-4-yl)ethoxy]-3-pentan-3-yl-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM HEPES-NaOH, 19-23% PEG 4000, 19-23% 1,2-propanediol
分辨率 1.59 Å R-free 0.206
8YTL Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with a 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-derived compound 提交 2024-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 PGO S-1,2-PROPANEDIOL × 1 A1LZ0 1-(4-fluorophenyl)-6-[4-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]piperazin-1-yl]-3-pentan-3-yl-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM HEPES-NaOH, 19-23% PEG 4000, 19-23% 1,2-propanediol
分辨率 2.00 Å R-free 0.260
8YU8 Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with a 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-derived compound 提交 2024-03-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 A1LZ1 6-(4-butoxycarbonylpiperazin-1-yl)-1-(4-fluorophenyl)-3-pentan-3-yl-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM HEPES-NaOH, 19-23% PEG 4000, 19-23% 1,2-propanediol
分辨率 1.95 Å R-free 0.259
8YWU Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with a 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-derived compound 提交 2024-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 A1LZ9 1-(4-fluorophenyl)-6-[2-[(5-methyl-2-phenyl-1,3-oxazol-4-yl)methoxy]ethyl]-3-pentan-3-yl-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM HEPES-NaOH, 19-23% PEG 4000, 19-23% 1,2-propanediol
分辨率 1.77 Å R-free 0.230
8YWV Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with a 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-derived compound 提交 2024-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 A1L0A 1-(4-fluorophenyl)-6-[4-(2-methylpropoxycarbonyl)piperazin-1-yl]-3-pentan-3-yl-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM HEPES-NaOH, 19-23% PEG 4000, 19-23% 1,2-propanediol
分辨率 2.01 Å R-free 0.251
9IWJ X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-NCoR2 corepressor peptide co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2024-07-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 14% PEG 8000, 0.2M magnesium chloride
分辨率 2.48 Å R-free 0.254
9IWJ X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-NCoR2 corepressor peptide co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2024-07-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 200–468（269 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 14% PEG 8000, 0.2M magnesium chloride
分辨率 2.48 Å R-free 0.254
9IWJ X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-NCoR2 corepressor peptide co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2024-07-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 200–468（269 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 14% PEG 8000, 0.2M magnesium chloride
分辨率 2.48 Å R-free 0.254
9IWJ X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-NCoR2 corepressor peptide co-crystals obtained by co-crystallization 提交 2024-07-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 200–468（269 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 14% PEG 8000, 0.2M magnesium chloride
分辨率 2.48 Å R-free 0.254
9IWL X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-intrinsic fatty acid (E. coli origin)-CBP coactivator peptide co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2024-07-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 30% PEG 4000, 0.2M Sodium acetate trihydrate
分辨率 2.09 Å R-free 0.236
9IWM X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW7647-TRAP220 coactivator peptide co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2024-07-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 2VN 2-[(4-{2-[(4-cyclohexylbutyl)(cyclohexylcarbamoyl)amino]ethyl}phenyl)sulfanyl]-2-methylpropanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris (pH 8.5), 25% PEG 3350, 0.2M Ammonium acetate
分辨率 1.39 Å R-free 0.205
9IWN X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-intrinsic fatty acid (E. coli origin)-PGC1alpha coactivator peptide co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2024-07-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 25% PEG 3350
分辨率 1.59 Å R-free 0.208
9IWO X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW7647-PGC1alpha coactivator peptide co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2024-07-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 2VN 2-[(4-{2-[(4-cyclohexylbutyl)(cyclohexylcarbamoyl)amino]ethyl}phenyl)sulfanyl]-2-methylpropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 25% PEG 3350
分辨率 1.49 Å R-free 0.213
9SFS Human PPAR alpha ligand binding domain in complex with 10-HSA ligand 提交 2025-08-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–467（268 aa）
未记录 A1J4E (S)-10-Hydroxystearic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris (pH 6.5), 28% (w/v) Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
分辨率 2.00 Å R-free 0.285
9T5S Crystal structure of human PPARalpha in complex with co-activator PGC-1 alpha peptide and bempedoic acid 提交 2025-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 A1JTY Bempedoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；20 %w/v PEG 3350, 0.2 M Na2HPO4
分辨率 1.74 Å R-free 0.211
9T5S Crystal structure of human PPARalpha in complex with co-activator PGC-1 alpha peptide and bempedoic acid 提交 2025-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 200–468（269 aa）
未记录 A1JTY Bempedoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；20 %w/v PEG 3350, 0.2 M Na2HPO4
分辨率 1.74 Å R-free 0.211
9VZS X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-10-hydroxystearic acid (10-HSA) co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2025-07-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 WAD (10R)-10-hydroxyoctadecanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 25% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.46 Å R-free 0.201
9VZT X-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-10-oxostearic acid (10-oxoSA) co-crystals obtained by cross-seeding 提交 2025-07-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 200–468（269 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 KTC 10-oxooctadecanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M HEPES (pH 7.0), 25 % (w/v) PEG 3350
分辨率 1.48 Å R-free 0.202

共 78 个其他 PDB 条目、105 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PPARA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 5–273； UniProt 200–468 作者链 B； PDB构建体 5–273； UniProt 200–468

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6l37

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6l37
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6l37
沉积日期 deposition_date2019-10-09
结构标题 titleX-ray structure of human PPARalpha ligand binding domain-GW9662-ciprofibrate co-crystals obtained by delipidation and co-crystallization
关键词 keywordsNuclear receptor, Protein-ligand complex, PPAR, Transcription; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier30.28 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron29.79 Å
零角强度 I(0) i059887000.00
分子量 molecular_weight62634.0 kDa
排除体积 excluded_volume79184 ų
包络体积 envelope_volume97892 ų
水化壳体积 shell_volume28518 ų
包络直径 envelope_diameter103.6 Å
壳层 Rg shell_rg35.43 Å
包络 Rg envelope_rg29.67 Å
形状 Rg shape_rg29.78 Å
总 Rg total_rg30.37 Å
总原子数 total_atoms4471
残基数 n_residues539
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax99.3 Å
Rg (实空间) rg_real30.44 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.90 Å
I(0) (实空间) i0_real5.9890e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0160e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal30.38 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal59880000.0000
解质量估计 total_estimate0.8617
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary26.7 Å
偏度 Skewness skewness0.411
峰度 Kurtosis kurtosis-0.568
角度范围 angular_range— – 0.2600 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha21810000.0000
实空间数据点数 n_real_points53
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.830; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.837; Smooth: 0.871
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd6l37a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.123 — Nuclear receptor ligand-binding domain
超家族 Superfamily superfamilya.123.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain
家族 Family familya.123.1.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain
结构域编号 domain_idd6l37a2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6l37b_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.123 — Nuclear receptor ligand-binding domain
超家族 Superfamily superfamilya.123.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain
家族 Family familya.123.1.1 — Nuclear receptor ligand-binding domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)