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6lb3

Crystal structure of PA4674 in complex with its operator DNA (18bp) from Pseudomonas aeruginosa

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HTH cro/C1-type domain-containing protein

Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1)

UniProt Q9HVC1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
2 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 4 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*AP*CP*GP*CP*TP*TP*AP*AP*CP*GP*TP*TP*AP*AP*GP*GP*GP*T)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*AP*CP*CP*CP*TP*TP*AP*AP*CP*GP*TP*TP*AP*AP*GP*CP*GP*T)-3') ; × 1 SULFATE ION × 2 water × 6 与全部聚合物一致
3 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 4 DNA 2 ;DNA (5'-D(P*AP*CP*GP*CP*TP*TP*AP*AP*CP*GP*TP*TP*AP*AP*GP*GP*GP*T)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(P*AP*CP*CP*CP*TP*TP*AP*AP*CP*GP*TP*TP*AP*AP*GP*CP*GP*T)-3') ; × 1 water × 6 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体
7csv

共 1 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6jpi 6lb3 6lb3 7csw 7csy

共 5 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9HVC1_PSEAE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–101； UniProt 1–101 作者链 B； PDB构建体 1–101； UniProt 1–101 作者链 C； PDB构建体 1–101； UniProt 1–101 作者链 D； PDB构建体 1–101； UniProt 1–101 作者链 E； PDB构建体 1–101； UniProt 1–101 作者链 F； PDB构建体 1–101； UniProt 1–101 作者链 G； PDB构建体 1–101； UniProt 1–101 作者链 H； PDB构建体 1–101； UniProt 1–101

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6lb3
沉积日期 deposition_date2019-11-13
结构标题 titleCrystal structure of PA4674 in complex with its operator DNA (18bp) from Pseudomonas aeruginosa
关键词 keywordsToxin antitoxin system, transcription regulator, DNA binding protein, ANTITOXIN, ANTITOXIN-DNA complex; ANTITOXIN/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6lb3__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6lb3__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6lb3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）10.84 Å
Rg（电子密度）9.84 Å
总 Rg11.02 Å
原子数287
残基数14
排除体积4190 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6lb3__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6lb3__assembly_2__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 6lb3__assembly_3__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 引用文献 (1)