Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*GP*(C7R)P*(PST)P*AP*AP*TP*AP*TP*AP*TP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*GP*CP*AP*TP*(AS)P*(PST)P*(AS)P*(PST)P*TP*AP*GP*C)-3') ; × 1 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | SATB1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–89； UniProt 368–452 作者链 B； PDB构建体 5–89； UniProt 368–452 |
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| 条目编号 entry_id | 6lff |
| 沉积日期 deposition_date | 2019-12-02 |
| 结构标题 title | transcription factor SATB1 CUTr1 domain in complex with a phosphorothioate DNA |
| 关键词 keywords | DNA-binding protein, DNA modification, Transcription factor, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION-DNA complex; TRANSCRIPTION/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 13.83 Å |
| Rg（电子密度） | 12.43 Å |
| 总 Rg | 13.71 Å |
| 原子数 | 670 |
| 残基数 | 82 |
| 排除体积 | 11827 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 6lffA00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 结构域编号 domain_id | 6lffB00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — lambda repressor-like DNA-binding domains |