SAXSdb — 6ly9

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type ATP synthase subunit I

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 1 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit E × 1 （P74901）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5SIT6_THET8
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–652； UniProt 1–652

V-type ATP synthase, subunit K

物种未注明

UniProt Q5SIT7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 1 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit E × 1 （P74901）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q5SIT7_THET8
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 P； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 Q； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 R； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 S； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 T； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 U； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 V； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 W； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 X； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 Y； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99 作者链 Z； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99

V-type ATP synthase subunit C

物种未注明

UniProt P74902

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 1 （Q5SIT5） V-type ATP synthase subunit E × 1 （P74901）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VATC_THET8
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–323； UniProt 1–323

V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM)

物种未注明

UniProt Q5SIT5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase subunit E × 1 （P74901）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5SIT5_THET8
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–120； UniProt 1–120

V-type ATP synthase subunit E

物种未注明

UniProt P74901

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 16	V-type ATP synthase subunit I × 1 （Q5SIT6） V-type ATP synthase, subunit K × 12 （Q5SIT7） V-type ATP synthase subunit C × 1 （P74902） V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM) × 1 （Q5SIT5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VATE_THET8
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ly9
沉积日期 deposition_date	2020-02-13
结构标题 title	The membrane-embedded Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus
关键词 keywords	rotary ATPase, V/A-ATPase, molecular motor, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ly9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ly9__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ly9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	38.33 Å
Rg（电子密度）	37.25 Å
总 Rg	37.73 Å
原子数	13888
残基数	1894
排除体积	251940 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6ly9__assembly_1__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	V-type ATP synthase subunit I
分子量 formula_weight	72204.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N
原子数 atom_count	13888

MIAPMEKLVLAGPKGRAKELLQSLQQAGVVHLETLRPEALSAYQLSPEERAELRRWEAVSAGAEHTLSLLGLEAEPARPFPEGLEAAEKALSPIQAHAEGLTRQKQELEEELALAQAYLEPLERLAALAHGLDKSPFLRVIPFLLTEKELPLVEEALRKALEDRYLLAHEAYAGGVAALVVVHRKEVDQAKAALSRAGVAELRLPGALGELPLSEAARRLKERAEAAPRELSEVRQHLAKLARESASTLQSLWTRAQDEVARLKALEELASGRFGFALLGYVPVKAKPKVEEALARHKESVVYAFEPVDEHHEADRIPVVLDNPPWAKPFELLVSFLNTPKYGTFDPTPVVPVFFPFWFGMIVGDIGYALLFYLVGRWLSGYVKRNEPLVIDLFALKLKPQVIGKLVHILNWMVFWTVVWGVIYGEFFGTFLEHLGVFGTPEHPGLIPILIHRIDTAKTANLLILLSVAFGVVLVFFGLALRAYLGLKHRHMAHFWEGVGYLGGLVGVLALAASYLGNLQAGWLQGLMYLGFGVFLLAVLMSRIWLMIPEIFTQAGHILSHIRIYAVGAAGGILAGLLTDVGFALAERLGLLGVLLGLLVAGVLHLLILLLTTLGHMLQPIRLLWVEFFTKFGFYEENGRPYRPFKSVREAQ

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	V-type ATP synthase, subunit K
分子量 formula_weight	9841.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z

MKKLLVTVLLAVFGALAFAAEEAAASGGLDRGLIAVGMGLAVGLAALGTGVAQARIGAAGVGAIAEDRSNFGTALIFLLLPETLVIFGLLIAFILNGRL

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	V-type ATP synthase subunit C
分子量 formula_weight	35968.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MADDFAYLNARVRVRRGTLLKESFFQEALDLSFADFLRLLSETVYGGELAGQGLPDVDRAVLRTQAKLVGDLPRLVTGEAREAVRLLLLRNDLHNLQALLRAKATGRPFEEVLLLPGTLREEVWRQAYEAQDPAGMAQVLAVPGHPLARALRAVLRETQDLARVEALLAKRFFEDVAKAAKGLDQPALRDYLALEVDAENLRTAFKLQGSGLAPDAFFLKGGRFVDRVRFARLMEGDYAVLDELSGTPFSGLSGVRDLKALERGLRCVLLKEAKKGVQDPLGVGLVLAYVKEREWEAVRLRLLARRAYFGLPRAQVEEEVVCP

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM)
分子量 formula_weight	13166.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MTGGLVLNAISRAGGAMGGLGLIKSLAEKEKQLLERLEAAKKEAEERVKRAEAEAKALLEEAEAKAKALEAQYRERERAETEALLARYRERAEAEAKAVREKAMARLDEAVALVLKEVLP

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	V-type ATP synthase subunit E
分子量 formula_weight	20645.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MSKLEAILSQEVEAEIQALLQEAEAKAEAVKREAEEKAKALLQARERALEAQYRAALRRAESAGELLVATARTQARGEVLEEVRRRVREALEALPQKPEWPEVVRKLALEALEALPGAKALVANPEDLPHLEALARERGVELQAEPALRLGVRAVGAEGKTQVENSLLARLDRAWDALSSKVAQALWG

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.93 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	157618

The membrane-embedded Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type ATP synthase subunit I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

V-type ATP synthase, subunit K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

V-type ATP synthase subunit C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

V-type ATP synthase subunit E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6ly9__assembly_1__model_1

6ly9__assembly_1__model_1 | I(q)

6ly9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

The membrane-embedded Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type ATP synthase subunit I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase, subunit K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase subunit C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type ATP synthase subunit E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6ly9__assembly_1__model_1

6ly9__assembly_1__model_1 | I(q)

6ly9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)