SAXSdb — 6m3p

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ankyrin-3

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 × 1 （Q62261）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 × 1 （Q62261）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ANK3_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–491； UniProt 975–1465 作者链 E； PDB构建体 1–491； UniProt 975–1465

Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1

Mus musculus

UniProt Q62261

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Ankyrin-3 × 1 （O70511）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Ankyrin-3 × 1 （O70511）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SPTB2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–320； UniProt 1591–1910 作者链 B； PDB构建体 1–320； UniProt 1591–1910

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6m3p
沉积日期 deposition_date	2020-03-04
结构标题 title	Crystal structure of AnkG/beta2-spectrin complex
关键词 keywords	PROTEIN BINDING, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6m3p__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6m3p__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6m3p__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.97 Å
Rg（电子密度）	37.13 Å
总 Rg	37.08 Å
原子数	5112
残基数	727
排除体积	89740 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6m3p__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6m3p__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ankyrin-3
分子量 formula_weight	54560.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,C
原子数 atom_count	10198

ADTLDNVNLVSSPVHSGFLVSFMVDARGGSMRGSRHHGMRIIIPPRKCTAPTRITCRLVKRHKLANPPPMVEGEGLASRLVEMGPAGAQFLGPVIVEIPHFGSMRGKERELIVLRSENGETWKEHQFDSKNEDLSELLNGMDEELDSPEELGTKRICRIITKDFPQYFAVVSRIKQESNQIGPEGGILSSTTVPLVQASFPEGALTKRIRVGLQAQPVPEETVKKILGNKATFSPIVTVEPRRRKFHKPITMTIPVPPPSGEGVSNGYKGDTTPSLRLLCSITGGTSPAQWEDITGTTPLTFIKDCVSFTTNVSARFWLADCHQVLETVGLASQLYRELICVPYMAKFVVFAKTNDPVESSLRCFCMTDDRVDKTLEQQENFEEVARSKDIEVLEGKPIYVDCYGNLAPLTKGGQQLVFNFYSFKENRLPFSIKVRDTSQEPCGRLSFLKEPKTTKGLPQTAVCNLNITLPAHKKAEKADRRQSFTSLALR

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1
分子量 formula_weight	37066.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B

AHKAQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEKAKDEQSAVSMLKKHQILEQAVEDYAETVHQLSKTSRALVADSHPESERISMRQSKVDKLYAGLKDLAEERRGKLDERHRLFQLNREVDDLEQWIAEREVVAGSHELGQDYEHVTMLQERFREFARDTGNIGQERVDTVNNMADELINSGHSDAATIAEWKDGLNEAWADLLELIDTRTQILAASYELHKFYHDAKEIFGRIQDKHKKLPEELGRDQNTVETLQRMHTTFEHDIQALGTQVRQLQEDAARLQAAYAGDKADDIQKRENEVLEAWKSLLDACEGRRVRLVDT

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	6m3pA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 —

结构域编号 domain_id	6m3pB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 —

结构域编号 domain_id	6m3pC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	220 — Chondroitinase Ac; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	6m3pC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	220 — Chondroitinase Ac; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	6m3pC03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2660 —

结构域编号 domain_id	6m3pE01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	220 — Chondroitinase Ac; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	6m3pE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	220 — Chondroitinase Ac; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	6m3pE03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2660 —

▶

晶胞边长 a length_a	66.277 Å
晶胞边长 b length_b	66.305 Å
晶胞边长 c length_c	160.926 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	99.47 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.78 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	100.87 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.312 Å
最低分辨率 resolution_low	44.995 Å
R 因子 r_factor	0.2563
R_work r_work	0.2545
R_free r_free	0.2951

Crystal structure of AnkG/beta2-spectrin complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ankyrin-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6m3p__assembly_1__model_1

6m3p__assembly_1__model_1 | I(q)

6m3p__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of AnkG/beta2-spectrin complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ankyrin-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6m3p__assembly_1__model_1

6m3p__assembly_1__model_1 | I(q)

6m3p__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)