6mrt

12-meric ClyA pore complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemolysin E, chromosomal

Escherichia coli (strain K12)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 12	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HLYE_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 B； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 C； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 D； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 E； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 F； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 G； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 H； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 I； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 J； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 K； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303 作者链 L； PDB构建体 22–324； UniProt 1–303

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6mrt
沉积日期 deposition_date	2018-10-15
结构标题 title	12-meric ClyA pore complex
关键词 keywords	Pore-forming toxin, MEMBRANE PROTEIN, Toxin; MEMBRANE PROTEIN, Toxin
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6mrt__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6mrt__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6mrt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	56.30 Å
Rg（电子密度）	56.20 Å
总 Rg	56.42 Å
原子数	26868
残基数	3420
排除体积	483420 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6mrt__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

结构域编号 domain_id	d6mrta_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrtb_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrtc_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrtd_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrte_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrtf_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrtg_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrth_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrti_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrtj_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrtk_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

结构域编号 domain_id	d6mrtl_
类 Class class	h — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold fold	h.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamily	h.4.4 — Bacterial hemolysins
家族 Family family	h.4.4.1 — Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA)

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	6mrtA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtF00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtI00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtJ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtK00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6mrtL00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Hemolysin E; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	482946

描述 description	Hemolysin E, chromosomal
分子量 formula_weight	36131.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L
原子数 atom_count	26868

12-meric ClyA pore complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemolysin E, chromosomal

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6mrt__assembly_1__model_1

6mrt__assembly_1__model_1 | I(q)

6mrt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Escherichia coli (strain K12)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

12-meric ClyA pore complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemolysin E, chromosomal

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6mrt__assembly_1__model_1

6mrt__assembly_1__model_1 | I(q)

6mrt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (12 domains)

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)