6msm

Phosphorylated, ATP-bound human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 127.1 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator

Homo sapiens

UniProt P13569

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–1480 突变:E1371Q Piece of Molecule-1 × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 52 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CFTR_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1480; UniProt 1–1480

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6msm

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6msm
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6msm
沉积日期 deposition_date2018-10-16
结构标题 titlePhosphorylated, ATP-bound human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR)
关键词 keywordsABC transporter, anion channel, cystic fibrosis, membrane protein, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier36.60
回转半径 Rg (电子) rg_electron37.01
零角强度 I(0) i0249350000.00
分子量 molecular_weight137740.0 kDa
排除体积 excluded_volume176700 ų
包络体积 envelope_volume227220 ų
水化壳体积 shell_volume52104 ų
包络直径 envelope_diameter135.8
壳层 Rg shell_rg42.25
包络 Rg envelope_rg37.17
形状 Rg shape_rg37.01
总 Rg total_rg37.37
总原子数 total_atoms9703
残基数 n_residues1198
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax127.1
Rg (实空间) rg_real36.86
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.08
I(0) (实空间) i0_real2.4930e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.4770e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal36.70
I(0) (倒空间) i0_reciprocal249300000.0000
解质量估计 total_estimate0.6389
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary38.4
偏度 Skewness skewness0.586
峰度 Kurtosis kurtosis-0.086
角度范围 angular_range— – 0.2150 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha87490000.0000
实空间数据点数 n_real_points44
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.710; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.159; Positv: 1.000; Valcen: 0.874; Smooth: 0.821

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id6msmA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)