SAXSdb — 6n6v

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactamase

Acinetobacter baumannii

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 32–273	片段：UNP residues 32-273 突变：F110A/M221A	KE1 meropenem, bound form × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；293 K；0.06 M citric acid, 0.04 M bis-Tris propane, pH 4.1, 16% PEG3350	分辨率 1.55 Å R-free 0.192

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6N6V	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4JF4 OXA-23 meropenem complex 提交 2013-02-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–273（243 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MER (4R,5S)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-4-methyl-4,5-d ihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；277 K；0.06 M citric acid/0.04 M bis-tris propane, 16 % PEG3350, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.14 Å R-free 0.254
4JF4 OXA-23 meropenem complex 提交 2013-02-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 31–273（243 aa）	未记录	MER (4R,5S)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-4-methyl-4,5-d ihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；277 K；0.06 M citric acid/0.04 M bis-tris propane, 16 % PEG3350, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.14 Å R-free 0.254
4JF5 Structure of OXA-23 at pH 4.1 提交 2013-02-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–273（243 aa）	未记录	FLC CITRATE ANION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；277 K；0.06 M citric acid/0.04 M bis-tris propane, 16 % PEG3350, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.15 Å R-free 0.162
4JF6 Structure of OXA-23 at pH 7.0 提交 2013-02-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–273（243 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	K POTASSIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.2 M succinic acid, 20% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.285
4K0W X-ray crystal structure of OXA-23 A220 duplication clinical variant 提交 2013-04-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–273（243 aa）片段：unp residues 31-273	突变：A220 insertion	CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 BCT BICARBONATE ION × 4 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；296 K；0.2M sodium chloride, 0.1M phosphate, 0.1M citrate 20% w/v PEG 8000 , pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 1.20 Å R-free 0.202
4K0X X-ray Crystal Structure of OXA-23 from Acinetobacter baumannii 提交 2013-04-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–273（243 aa）片段：UNP residues 31-273	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	BCT BICARBONATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；5% w/v PGA-LM, 30% v/v PEG 550MME,0.1M Sodium acetate, OXA-23 in 50 mM sodium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 1.61 Å R-free 0.192
6N6T OXA-23 mutant F110A/M221A low pH form 提交 2018-11-27	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–273（243 aa）片段：UNP residues 31-273	突变：F110A/M221A	FLC CITRATE ANION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；293 K；0.06 M citric acid, 0.04 M bis-Tris propane, pH 4.1, 16% PEG3350	分辨率 1.25 Å R-free 0.180
6N6U OXA-23 mutant F110A/M221A low pH form imipenem complex 提交 2018-11-27	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 32–273（242 aa）片段：UNP residues 32-273	突变：F110A/M221A	ID1 Imipenem × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；293 K；0.06 M citric acid, 0.04 M bis-Tris propane, pH 4.1, 16% PEG3350	分辨率 1.55 Å R-free 0.196
6N6W OXA-23 mutant F110A/M221A neutral pH form 提交 2018-11-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 36–273（238 aa）片段：UNP residues 36-273	突变：F110A/M221A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M succinic acid, pH 7.0, 20% PEG3350	分辨率 3.25 Å R-free 0.290
6N6X OXA-23 mutant F110A/M221A neutral pH form imipenem complex 提交 2018-11-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 35–273（239 aa）片段：UNP residues 35-273	突变：F110A/M221A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ID1 Imipenem × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M succinic acid, pH 7.0, 20% PEG3350	分辨率 3.10 Å R-free 0.216
6N6Y OXA-23 mutant F110A/M221A neutral pH form meropenem complex 提交 2018-11-27	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 35–273（239 aa）片段：UNP residues 35-273	突变：F110A/M221A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	KE1 meropenem, bound form × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M succinic acid, pH 7.0, 20% PEG3350	分辨率 3.50 Å R-free 0.300
9NSW apo-OXA-23, pH 7.5 提交 2025-03-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.40 Å R-free 0.201
9NSX OXA-23-NA-1-157, 3 minute soak 提交 2025-03-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Y33 (5R)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-5-methyl-4,5-dihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.57 Å R-free 0.205
9NSY OXA-23-NA-1-157, 4 minute soak 提交 2025-03-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Y33 (5R)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-5-methyl-4,5-dihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.70 Å R-free 0.229
9NSZ OXA-23-NA-1-157, 6 minute soak 提交 2025-03-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Y33 (5R)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-5-methyl-4,5-dihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.200
9NT0 OXA-23-meropenem, pH 7.5 提交 2025-03-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MER (4R,5S)-3-{[(3S,5S)-5-(dimethylcarbamoyl)pyrrolidin-3-yl]sulfanyl}-5-[(2S,3R)-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]-4-methyl-4,5-d ihydro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.202
9ZOP OXA-23-JDB/PQ-1-219, 3 min soak 提交 2025-12-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.252
9ZOQ OXA-23-JDB/PQ-1-219, 5 min soak 提交 2025-12-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.234
9ZOR OXA-23-JDB/PQ-1-219, 10 min complex 提交 2025-12-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.65 Å R-free 0.200
9ZOS OXA-23-JDB/PQ-1-219, 20 min complex 提交 2025-12-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	未记录	A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.229
9ZOT OXA-23-JDB/PQ-1-219, 30 min complex 提交 2025-12-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	未记录	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.198
9ZOU OXA-23-JDB/PQ-1-219, 40 min complex 提交 2025-12-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	未记录	A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.207
9ZOV OXA-23-JDB/PQ-1-219, 60 min complex 提交 2025-12-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	未记录	CO2 CARBON DIOXIDE × 1 A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.227
9ZOW OXA-23-JDB/PQ-1-219, 90 min complex 提交 2025-12-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–273（273 aa）	未记录	CO2 CARBON DIOXIDE × 1 A1C3I (2S)-2-[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]-4-{[(3S)-2,3-dihydroazet-3-yl]sulfanyl}-2-methyl-2H-pyrrole-5-carboxylic acid × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350	分辨率 1.70 Å R-free 0.230

共 23 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9L4P2_ACIBA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–242； UniProt 32–273

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6n6v
沉积日期 deposition_date	2018-11-27
结构标题 title	OXA-23 mutant F110A/M221A low pH form meropenem complex
关键词 keywords	carbapenemase, antibiotic resistance, mutant, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	18.39 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	17.06 Å
零角强度 I(0) i0	11594600.00
分子量 molecular_weight	26188.0 kDa
排除体积 excluded_volume	33145 Å³
包络体积 envelope_volume	36751 Å³
水化壳体积 shell_volume	17779 Å³
包络直径 envelope_diameter	58.2 Å
壳层 Rg shell_rg	23.43 Å
包络 Rg envelope_rg	17.34 Å
形状 Rg shape_rg	17.06 Å
总 Rg total_rg	18.07 Å
总原子数 total_atoms	1841
残基数 n_residues	230
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	56.8 Å
Rg (实空间) rg_real	18.28 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.28 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.1590e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2530e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	18.30 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	11590000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9008
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.152
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.440
角度范围 angular_range	— – 0.4350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	3453000.0000
实空间数据点数 n_real_points	75
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.907; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.997

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Beta-lactamase
分子量 formula_weight	27382.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.5.2.6
突变 mutation	F110A/M221A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2013

IVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSATAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAADIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII

来源 Source

来源生物 organism	Acinetobacter baumannii
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	470
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	meropenem, bound form
分子量 formula_weight	385.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	166

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d6n6va_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.3 — beta-lactamase/transpeptidase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.3.1 — beta-lactamase/transpeptidase-like
家族 Family family	e.3.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6n6vA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Beta-lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DD-peptidase/beta-lactamase superfamily

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	136.114 Å
晶胞边长 b length_b	44.012 Å
晶胞边长 c length_c	46.222 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.550 Å
最低分辨率 resolution_low	36.957 Å
R 因子 r_factor	0.1732
R_work r_work	0.1722
R_free r_free	0.1917

fit	/app/data/saxs_computation/n6/6n6v/6n6v.fit
pddf	/app/data/pr_computation/n6/6n6v/6n6v.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/n6/6n6v/6n6v.dat

OXA-23 mutant F110A/M221A low pH form meropenem complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactamase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction