Aquaporin-1
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–269 | 未记录 | 无其他共同聚合物 | SOLID-STATE NMR NMR测量条件:pH 7;278 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM NaCl;压力 1 NMR样品组成:2 w/v [U-13C; U-15N] AQUAPORIN 1, NMR buffer | NMR buffer | 分辨率未提供 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6POJ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FQY STRUCTURE OF AQUAPORIN-1 AT 3.8 A RESOLUTION BY ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY 提交 2000-09-07 | 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–269(269 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
X-ray结晶条件
Dialysis with continuous flow dialysis machine;pH 6;298 K;Escherichia coli lipids, magnesium chloride, sodium chloride, MES, pH 6.0, Dialysis with continuous flow dialysis machine, temperature 298K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.417 |
| 1H6I A REFINED STRUCTURE OF HUMAN AQUAPORIN 1 提交 2001-06-15 | 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–269(269 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.54 Å R-free 0.376 |
| 1IH5 CRYSTAL STRUCTURE OF AQUAPORIN-1 提交 2001-04-18 | 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–269(269 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.70 Å R-free 0.458 |
| 4CSK human Aquaporin 提交 2014-03-08 | 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–269(269 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 9;pH 9
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分辨率 3.28 Å R-free 0.298 |
| 7UZE Erythrocyte ankyrin-1 complex class 2 local refinement of AQP1 (C4 symmetry applied) 提交 2022-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–269(269 aa)
链 B
1–269(269 aa)
链 C
1–269(269 aa)
链 D
1–269(269 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CLR CHOLESTEROL × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Final gel filtration buffer contained 0.05 % (w/v) digitonin, 130mM KCl, 20mM HEPES pH 7.4, 1mM ATP, 1mM MgCl2, 1mM PMSF. Peak fractions were concentrated to 8mg/mL, and 0.01% (w/v) of glycyrrhizic acid was added immediately prior to vitrification.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4-6 seconds, wait time 30 seconds.
|
分辨率 2.40 Å |
| 8CT2 Local refinement of AQP1 tetramer (C1; refinement mask included D1 of protein 4.2 and Ankyrin-1 AR1-5) in Class 2 of erythrocyte ankyrin-1 complex 提交 2022-05-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–269(269 aa)
链 B
1–269(269 aa)
链 C
1–269(269 aa)
链 D
1–269(269 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CLR CHOLESTEROL × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Final gel filtration buffer contained 0.05% w/v digitonin, 130 mM KCl, 20 mM HEPES, pH 7.4, 1 mM ATP, 1 mM MgCl2, 1 mM PMSF. Peak fractions were concentrated to 8 mg/mL, and 0.01% w/v glycyrrhizic acid was added immediately prior to vitrification.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4-6 seconds, wait time 30 seconds
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分辨率 3.10 Å |
| 8CTE Class 2 of erythrocyte ankyrin-1 complex (Composite map) 提交 2022-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 M
1–269(269 aa)
链 O
1–269(269 aa)
链 R
1–269(269 aa)
链 S
1–269(269 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CLR CHOLESTEROL × 10 AJP Digitonin × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;Final gel filtration buffer contained 0.05% w/v digitonin, 130 mM KCl, 20 mM HEPES, pH 7.4, 1 mM ATP, 1 mM MgCl2, 1 mM PMSF. Peak fractions were concentrated to 8 mg/mL, and 0.01% w/v glycyrrhizic acid was added immediately prior to vitrification.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4-6 seconds, wait time 30 seconds
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分辨率 2.90 Å |
| 9ZCZ C4 local refinement of stomatin-bound aquaporin (human) 提交 2025-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
3–249(247 aa)
链 B
3–249(247 aa)
链 C
3–249(247 aa)
链 D
3–249(247 aa)
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未记录 | CLR CHOLESTEROL × 4 PLM PALMITIC ACID × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.30 Å |
| 9ZD2 C1 local refinement of aquaporin 1 bound to endogenous human stomatin 提交 2025-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
3–249(247 aa)
链 B
3–249(247 aa)
链 C
3–249(247 aa)
链 D
3–249(247 aa)
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 4 CLR CHOLESTEROL × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | AQP1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 |